1 FPGA的集成度比CPLD高，具有更复杂的布线结构和逻辑实现。
2 CPLD更适合触发器有限而乘积丰富的结构，更适合完成复杂的组合逻辑；FPGA更适合于触发器丰富的结构，适合完成时序逻辑。
3 cpld连续式布线结构决定了他的时序均匀的可预测的，而fpga的分段式布线结构决定了其延时的不可预测性。cpld比fpga速度快。
4 在编程上fpga比cpld具有更大的灵活性。cpld通过修改具有固定内部电路的逻辑功能来编程，fpga主要通过改变内部连线的布线来编程；fpga可在逻辑门下编程，而cpld实在逻辑块编程。
5 在编程方式上，cpld主要是基于eepROM或flash存储器编程，编程次数可达一万次，优点是系统断电时编程信息不丢失。fpga大部分是基于sram编程，断电丢失，每次上电需从期间外部将编程数据重新写入sram，其优点是可以编程任意次，且可以在工作中快速编程，从而实现班级和系统及的动态配置。
6 一般情况下，cpld的功耗要比fpga大，且集成度越高越明显。