• VTK 图形基本操作进阶_点云配准技术(LandMark标记点算法和坐标系显示方法)


    1.点云配准

    在计算机逆向工程中,通过三维扫描等实物数字化技术可以获取各种点云数据。但是受到测量环境和设备的影响,再一次测量的情况下,难以获取实物整体的点云数据,因此需要多次从不同角度进行测量。但不同的测量数据之间可能会存在平移错误或旋转错位等问题。这就需要使用点云配准技术来对测量点云数据进行局部配准和整合,以得到完整的模型数据。

    另外,在外科手术导航技术中,图像标记点技术与人体表面标记点的配准是一个关键步骤,对于手术定位的精度有着重要的影响。通常这需要使用基于标记点的配准技术。因此,点云配准及时对一组源点云数据应用一个空间变换,使得变换后的数据与目标点云数据能够一一映射,使两组数据之间的平均距离误差最小。

    2.LandMark配准实验

    VTKLandMarkTransform实现了片几点配准算法,使得两个点集在配准后的平均距离最小。通过SetSourceLandmarks()和SetTargetLandmarks()函数分别设置源标记点集和目标标记点集。需要注意的是,源标记点集和目标标记点集序号要对应。
    基于标记点的配准算法如下所示:
      1 #include <vtkAutoInit.h>
      2 VTK_MODULE_INIT(vtkRenderingOpenGL);
      3 VTK_MODULE_INIT(vtkRenderingFreeType);
      4 VTK_MODULE_INIT(vtkInteractionStyle);
      5  
      6 #include <vtkSmartPointer.h>
      7 #include <vtkPoints.h>
      8 #include <vtkLandmarkTransform.h>
      9 #include <vtkPolyData.h>
     10 #include <vtkVertexGlyphFilter.h>
     11 #include <vtkTransformPolyDataFilter.h>
     12 #include <vtkPolyDataMapper.h>
     13 #include <vtkActor.h>
     14 #include <vtkProperty.h>
     15 #include <vtkRenderer.h>
     16 #include <vtkRenderWindow.h>
     17 #include <vtkRenderWindowInteractor.h>
     18 #include <vtkAxesActor.h>
     19 //研究一下坐标系显示位置
     20 #include <vtkOrientationMarkerWidget.h>
     21 int main()
     22 {
     23     vtkSmartPointer<vtkPoints> sourcePoints =
     24         vtkSmartPointer<vtkPoints>::New();
     25     double sourcePoint1[3] = { 0.5, 0, 0 };
     26     sourcePoints->InsertNextPoint(sourcePoint1);
     27     double sourcePoint2[3] = { 0, 0.5, 0 };
     28     sourcePoints->InsertNextPoint(sourcePoint2);
     29     double sourcePoint3[3] = { 0, 0, 0.5 };
     30     sourcePoints->InsertNextPoint(sourcePoint3);
     31  
     32     vtkSmartPointer<vtkPoints> targetPoints =
     33         vtkSmartPointer<vtkPoints>::New();
     34     double targetPoint1[3] = { 0.0, 0.0, 0.55 };
     35     targetPoints->InsertNextPoint(targetPoint1);
     36     double targetPoint2[3] = { 0.0, 0.55, 0.0 };
     37     targetPoints->InsertNextPoint(targetPoint2);
     38     double targetPoint3[3] = { -0.55, 0.0, 0.0 };
     39     targetPoints->InsertNextPoint(targetPoint3);
     40     //利用Landmark算法求变换矩阵
     41     vtkSmartPointer<vtkLandmarkTransform> landmarkTransform =
     42         vtkSmartPointer<vtkLandmarkTransform>::New();
     43     landmarkTransform->SetSourceLandmarks(sourcePoints);
     44     landmarkTransform->SetTargetLandmarks(targetPoints);
     45     landmarkTransform->SetModeToRigidBody(); //执行刚体配准
     46     landmarkTransform->Update();
     47     构造PolyData类型 进行图形可视化
     48     vtkSmartPointer<vtkPolyData> source =
     49         vtkSmartPointer<vtkPolyData>::New();
     50     source->SetPoints(sourcePoints);
     51     vtkSmartPointer<vtkPolyData> target =
     52         vtkSmartPointer<vtkPolyData>::New();
     53     target->SetPoints(targetPoints);
     54     /
     55     vtkSmartPointer<vtkVertexGlyphFilter> sourceGlyphFilter =
     56         vtkSmartPointer<vtkVertexGlyphFilter>::New();
     57     sourceGlyphFilter->SetInputData(source);
     58     sourceGlyphFilter->Update();
     59  
     60     vtkSmartPointer<vtkVertexGlyphFilter> targetGlyphFilter =
     61         vtkSmartPointer<vtkVertexGlyphFilter>::New();
     62     targetGlyphFilter->SetInputData(target);
     63     targetGlyphFilter->Update();
     64     源数据施加配准变换矩阵
     65     vtkSmartPointer<vtkTransformPolyDataFilter> transformFilter =
     66         vtkSmartPointer<vtkTransformPolyDataFilter>::New();
     67     transformFilter->SetInputData(sourceGlyphFilter->GetOutput());
     68     transformFilter->SetTransform(landmarkTransform);
     69     transformFilter->Update();
     70     /
     71     vtkSmartPointer<vtkPolyDataMapper> sourceMapper =
     72         vtkSmartPointer<vtkPolyDataMapper>::New();
     73     sourceMapper->SetInputConnection(sourceGlyphFilter->GetOutputPort());
     74  
     75     vtkSmartPointer<vtkActor> sourceActor =
     76         vtkSmartPointer<vtkActor>::New();
     77     sourceActor->SetMapper(sourceMapper);
     78     sourceActor->GetProperty()->SetColor(1, 1, 0);
     79     sourceActor->GetProperty()->SetPointSize(10);
     80  
     81     vtkSmartPointer<vtkPolyDataMapper> targetMapper =
     82         vtkSmartPointer<vtkPolyDataMapper>::New();
     83     targetMapper->SetInputConnection(targetGlyphFilter->GetOutputPort());
     84  
     85     vtkSmartPointer<vtkActor> targetActor =
     86         vtkSmartPointer<vtkActor>::New();
     87     targetActor->SetMapper(targetMapper);
     88     targetActor->GetProperty()->SetColor(0, 1, 0);
     89     targetActor->GetProperty()->SetPointSize(10);
     90  
     91     vtkSmartPointer<vtkPolyDataMapper> solutionMapper =
     92         vtkSmartPointer<vtkPolyDataMapper>::New();
     93     solutionMapper->SetInputConnection(transformFilter->GetOutputPort());
     94  
     95     vtkSmartPointer<vtkActor> solutionActor =
     96         vtkSmartPointer<vtkActor>::New();
     97     solutionActor->SetMapper(solutionMapper);
     98     solutionActor->GetProperty()->SetColor(1, 0, 0);
     99     solutionActor->GetProperty()->SetPointSize(10);
    100     
    101     vtkSmartPointer<vtkRenderer> render =
    102         vtkSmartPointer<vtkRenderer>::New();
    103     render->AddActor(sourceActor);
    104     render->AddActor(targetActor);
    105     render->AddActor(solutionActor);
    106     render->SetBackground(0, 0, 0);
    107  
    108     vtkSmartPointer<vtkRenderWindow> rw =
    109         vtkSmartPointer<vtkRenderWindow>::New();
    110     rw->AddRenderer(render);
    111     rw->SetSize(480, 480);
    112     rw->SetWindowName("Regisration by Landmark");
    113     //设置坐标系显示功能
    114     vtkSmartPointer<vtkAxesActor> axes =
    115         vtkSmartPointer<vtkAxesActor>::New();
    116     axes->SetScale(10);
    117     render->AddActor(axes);
    118  
    119     vtkSmartPointer<vtkRenderWindowInteractor> rwi =
    120         vtkSmartPointer<vtkRenderWindowInteractor>::New();
    121     rwi->SetRenderWindow(rw);
    122     /************************************************************/
    123     vtkSmartPointer<vtkOrientationMarkerWidget> widget =
    124         vtkSmartPointer<vtkOrientationMarkerWidget>::New();
    125     widget->SetOutlineColor(0.9300, 0.5700, 0.1300);
    126     widget->SetOrientationMarker(axes);
    127     widget->SetInteractor(rwi); //加入鼠标交互
    128     widget->SetViewport(0.0, 0.0, 0.3, 0.3);  //设置显示位置
    129     widget->SetEnabled(1);
    130     widget->InteractiveOn();//开启鼠标交互
    131     /************************************************************/
    132     render->ResetCamera();
    133     rw->Render();
    134     rwi->Initialize();
    135     rwi->Start();
    136  
    137     return 0;
    138 }
    输出结果:
    黄色散点代表待配准点集;绿色散点代表金标准;红色散点代表施加变换矩阵后的源数据点集。
    vtkVertexGliphFilter类显示点集!!!VTKTransformPolyDataFilter用来对源标记点进行变换来显示配准后的点集,SetTransform()直接设置为vtkLandmarkTransform的变换结果。

    2.VTKLandmarkTransform类

     VTKLandmarkTransform类的使用比较简单,只需要设定源标记点和目标标记点。SetModeToRigidBody()函数用于设置其配准变换类型为刚体变换,仅包括简单的平移和旋转(六个自由度)。此外还有一个更为广泛应用的函数——SetModeToSimilarity,设置为相似变换,包括平移、旋转和放缩变换(七个自由度)。以及SetModeToAffine()函数设置仿射变换。默认情况,就采用相似变换进行配准。

    3.vtkAxesActor类

     有的时候,在显示三维物体时,我们希望知道当前场景对应的坐标系位置或者方向,这样在旋转物体的时候,就能够很清楚地看到当前正对这视野的是什么面xy平面,还是y轴等信息了。

    在vtk库中有一个vtkAxesActor负责显示坐标系,在查阅了vtk的wiki之后,找到了两个示例,在这里将两者结合起来,放在同一个例子中显示,并用java代码重写。
    其中,第一个示例:http://vtk.org/Wiki/VTK/Examples/Cxx/GeometricObjects/Axes 是直接将vtkAxesActor加入到renderer中进行显示: 
    1     //设置坐标系显示功能
    2     vtkSmartPointer<vtkAxesActor> axes =
    3         vtkSmartPointer<vtkAxesActor>::New();
    4     axes->SetScale(10);
    5     render->AddActor(axes);

    而第二个示例:
    http://vtk.org/Wiki/VTK/Examples/Cxx/Visualization/DisplayCoordinateAxes 是以Widget的方式在一个独立的视口中显示,比较适合用来放在左下角指示当前的坐标系位置:

    1 vtkSmartPointer<vtkOrientationMarkerWidget> widget =
    2         vtkSmartPointer<vtkOrientationMarkerWidget>::New();
    3     widget->SetOutlineColor(0.9300, 0.5700, 0.1300);
    4     widget->SetOrientationMarker(axes);
    5     widget->SetInteractor(rwi); //加入鼠标交互
    6     widget->SetViewport(0.0, 0.0, 0.3, 0.3);  //设置显示位置
    7     widget->SetEnabled(1);
    8     widget->InteractiveOn();//开启鼠标交互
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