MySQL是一个开源的数据库系统，近些年来使用率越来越高，目前属于Oracle公司所有，其拥有MySQL的商标，属于主流版本，由于其开源特性，出现了一些分支，常见的有MariaDB、Percona Server、Drizzle。这三个版本各有其特点。其中目前最流行的是MariaDB，很多Linux发行版默认的MySQL已经切换为MariaDB，但其他分支也有其适用范围，在选择的时候需要仔细甄别。
Percona Server由一家MySQL咨询公司拥有，这个公司的工具包Percona ToolKit非常出名。这个数据库也是开源版本，但是并不接受外界代码贡献，因为它实际上是Oracle的主流MySQL版本的增强版，所以其版本号基本和Oracle的主流版本一致，其目标是增强主流版本功能，集中在透明、性能和操作灵活性上，兼容性做到了可以直接打开主流版本的数据库，反之也不困难，这方便了临时切换，这个公司似乎并不主张用户更换其MySQL版本，可能其后续开发力量有限吧。默认的搜索引擎为XtraDB存储引擎，即改进版本的InnoDB，可以完全兼容InnoDB。
MariaDB是MySQL的创始人Monty Widenius因为对MySQL的开发流程不满，而离开Sun之后创建的Monty公司开发的MySQL分支，MariaDB的名称来源其女儿的名字maria。MariaDB默认的存储引擎为aria，即增强版的MyISAM，支持事务功能，还增加了许多针对服务器的扩展，它也包含Percona XtraDB引擎，以及SphinxSE和PBXT引擎。目前其版本为10.0.12，其源码来源于主流版本的MySQL5.5版本，按照其网站的说法，移植和重新实现了MySQL5.6的特性，增加了一些新的特性。不过目前其10.1.0版本也在开发中，其网站说明是“MariaDB 10.1是目前正在研发的版本，是MariaDB 10.0的演进，包括从MySQL 5.6、5.7的一些特性的移植和重新实现，还包括一些全新的功能”，从目前来看，MariaDB的目标是兼容主流版本，增加新功能，如果Oracle长期不更新版本，MariaDB也是个不错的选择。但是有一个问题，Monty公司也是需要盈利的，其也提供MariaDB的企业版及Cluster，其持续性不知道是否比得上Oracle。
Drizzle是个完全不一样的分支，它不兼容于MySQL，基于MySQL 4.1的源码，删除了多余的功能，开发语言改为C++，采用流行的Boost库，目标是大内存、多内核的系统，较适合新的应用。
在版本的选择上，主流版本是第一选择，MariaDB目前来说看不出明显的优势，而且其新的特性也没有造成压倒性的优势，Percona Server本身来说，是MySQL的增强版，也没有明显的优势。Drizzle需要更仔细的选择，毕竟其和MySQL不兼容。
所以一般来说，应该选择主流版本，测试MariaDB版本，看是否值得迁移。