• tensorflow载入数据的三种方式


    Tensorflow数据读取有三种方式:

    • Preloaded data: 预加载数据
    • Feeding: Python产生数据,再把数据喂给后端。
    • Reading from file: 从文件中直接读取

    这三种有读取方式有什么区别呢? 我们首先要知道TensorFlow(TF)是怎么样工作的。

    TF的核心是用C++写的,这样的好处是运行快,缺点是调用不灵活。而Python恰好相反,所以结合两种语言的优势。涉及计算的核心算子和运行框架是用C++写的,并提供API给Python。Python调用这些API,设计训练模型(Graph),再将设计好的Graph给后端去执行。简而言之,Python的角色是Design,C++是Run。

    一、预加载数据:

    [python] view plain copy
     
    1. import tensorflow as tf  
    2. # 设计Graph  
    3. x1 = tf.constant([2, 3, 4])  
    4. x2 = tf.constant([4, 0, 1])  
    5. y = tf.add(x1, x2)  
    6. # 打开一个session --> 计算y  
    7. with tf.Session() as sess:  
    8.     print sess.run(y)  


    二、python产生数据,再将数据喂给后端

    [python] view plain copy
     
    1. import tensorflow as tf  
    2. # 设计Graph  
    3. x1 = tf.placeholder(tf.int16)  
    4. x2 = tf.placeholder(tf.int16)  
    5. y = tf.add(x1, x2)  
    6. # 用Python产生数据  
    7. li1 = [2, 3, 4]  
    8. li2 = [4, 0, 1]  
    9. # 打开一个session --> 喂数据 --> 计算y  
    10. with tf.Session() as sess:  
    11.     print sess.run(y, feed_dict={x1: li1, x2: li2})  

    说明:在这里x1, x2只是占位符,没有具体的值,那么运行的时候去哪取值呢?这时候就要用到sess.run()中的feed_dict参数,将Python产生的数据喂给后端,并计算y。
    这两种方案的缺点:

    1、预加载:将数据直接内嵌到Graph中,再把Graph传入Session中运行。当数据量比较大时,Graph的传输会遇到效率问题。

    2、用占位符替代数据,待运行的时候填充数据。

    前两种方法很方便,但是遇到大型数据的时候就会很吃力,即使是Feeding,中间环节的增加也是不小的开销,比如数据类型转换等等。最优的方案就是在Graph定义好文件读取的方法,让TF自己去从文件中读取数据,并解码成可使用的样本集。

    三、从文件中读取,简单来说就是将数据读取模块的图搭好

    1、准备数据,构造三个文件,A.csv,B.csv,C.csv

    [python] view plain copy
     
    1. $ echo -e "Alpha1,A1 Alpha2,A2 Alpha3,A3" > A.csv  
    2. $ echo -e "Bee1,B1 Bee2,B2 Bee3,B3" > B.csv  
    3. $ echo -e "Sea1,C1 Sea2,C2 Sea3,C3" > C.csv  


    2、单个Reader,单个样本

    [python] view plain copy
     
    1. #-*- coding:utf-8 -*-  
    2. import tensorflow as tf  
    3. # 生成一个先入先出队列和一个QueueRunner,生成文件名队列  
    4. filenames = ['A.csv', 'B.csv', 'C.csv']  
    5. filename_queue = tf.train.string_input_producer(filenames, shuffle=False)  
    6. # 定义Reader  
    7. reader = tf.TextLineReader()  
    8. key, value = reader.read(filename_queue)  
    9. # 定义Decoder  
    10. example, label = tf.decode_csv(value, record_defaults=[['null'], ['null']])  
    11. #example_batch, label_batch = tf.train.shuffle_batch([example,label], batch_size=1, capacity=200, min_after_dequeue=100, num_threads=2)  
    12. # 运行Graph  
    13. with tf.Session() as sess:  
    14.     coord = tf.train.Coordinator()  #创建一个协调器,管理线程  
    15.     threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord)  #启动QueueRunner, 此时文件名队列已经进队。  
    16.     for i in range(10):  
    17.         print example.eval(),label.eval()  
    18.     coord.request_stop()  
    19.     coord.join(threads)  

    说明:这里没有使用tf.train.shuffle_batch,会导致生成的样本和label之间对应不上,乱序了。生成结果如下:

    Alpha1 A2
    Alpha3 B1
    Bee2 B3
    Sea1 C2
    Sea3 A1
    Alpha2 A3
    Bee1 B2
    Bee3 C1
    Sea2 C3
    Alpha1 A2

    解决方案:用tf.train.shuffle_batch,那么生成的结果就能够对应上。

    [python] view plain copy
     
    1. #-*- coding:utf-8 -*-  
    2. import tensorflow as tf  
    3. # 生成一个先入先出队列和一个QueueRunner,生成文件名队列  
    4. filenames = ['A.csv', 'B.csv', 'C.csv']  
    5. filename_queue = tf.train.string_input_producer(filenames, shuffle=False)  
    6. # 定义Reader  
    7. reader = tf.TextLineReader()  
    8. key, value = reader.read(filename_queue)  
    9. # 定义Decoder  
    10. example, label = tf.decode_csv(value, record_defaults=[['null'], ['null']])  
    11. example_batch, label_batch = tf.train.shuffle_batch([example,label], batch_size=1, capacity=200, min_after_dequeue=100, num_threads=2)  
    12. # 运行Graph  
    13. with tf.Session() as sess:  
    14.     coord = tf.train.Coordinator()  #创建一个协调器,管理线程  
    15.     threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord)  #启动QueueRunner, 此时文件名队列已经进队。  
    16.     for i in range(10):  
    17.         e_val,l_val = sess.run([example_batch, label_batch])  
    18.         print e_val,l_val  
    19.     coord.request_stop()  
    20.     coord.join(threads)  


    3、单个Reader,多个样本,主要也是通过tf.train.shuffle_batch来实现

    [python] view plain copy
     
    1. #-*- coding:utf-8 -*-  
    2. import tensorflow as tf  
    3. filenames = ['A.csv', 'B.csv', 'C.csv']  
    4. filename_queue = tf.train.string_input_producer(filenames, shuffle=False)  
    5. reader = tf.TextLineReader()  
    6. key, value = reader.read(filename_queue)  
    7. example, label = tf.decode_csv(value, record_defaults=[['null'], ['null']])  
    8. # 使用tf.train.batch()会多加了一个样本队列和一个QueueRunner。  
    9. #Decoder解后数据会进入这个队列,再批量出队。  
    10. # 虽然这里只有一个Reader,但可以设置多线程,相应增加线程数会提高读取速度,但并不是线程越多越好。  
    11. example_batch, label_batch = tf.train.batch(  
    12.       [example, label], batch_size=5)  
    13. with tf.Session() as sess:  
    14.     coord = tf.train.Coordinator()  
    15.     threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord)  
    16.     for i in range(10):  
    17.         e_val,l_val = sess.run([example_batch,label_batch])  
    18.         print e_val,l_val  
    19.     coord.request_stop()  
    20.     coord.join(threads)  


    说明:下面这种写法,提取出来的batch_size个样本,特征和label之间也是不同步的

    [python] view plain copy
     
    1. #-*- coding:utf-8 -*-  
    2. import tensorflow as tf  
    3. filenames = ['A.csv', 'B.csv', 'C.csv']  
    4. filename_queue = tf.train.string_input_producer(filenames, shuffle=False)  
    5. reader = tf.TextLineReader()  
    6. key, value = reader.read(filename_queue)  
    7. example, label = tf.decode_csv(value, record_defaults=[['null'], ['null']])  
    8. # 使用tf.train.batch()会多加了一个样本队列和一个QueueRunner。  
    9. #Decoder解后数据会进入这个队列,再批量出队。  
    10. # 虽然这里只有一个Reader,但可以设置多线程,相应增加线程数会提高读取速度,但并不是线程越多越好。  
    11. example_batch, label_batch = tf.train.batch(  
    12.       [example, label], batch_size=5)  
    13. with tf.Session() as sess:  
    14.     coord = tf.train.Coordinator()  
    15.     threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord)  
    16.     for i in range(10):  
    17.         print example_batch.eval(), label_batch.eval()  
    18.     coord.request_stop()  
    19.     coord.join(threads)  

    说明:输出结果如下:可以看出feature和label之间是不对应的

    ['Alpha1' 'Alpha2' 'Alpha3' 'Bee1' 'Bee2'] ['B3' 'C1' 'C2' 'C3' 'A1']
    ['Alpha2' 'Alpha3' 'Bee1' 'Bee2' 'Bee3'] ['C1' 'C2' 'C3' 'A1' 'A2']
    ['Alpha3' 'Bee1' 'Bee2' 'Bee3' 'Sea1'] ['C2' 'C3' 'A1' 'A2' 'A3']

    4、多个reader,多个样本

    [python] view plain copy
     
    1. #-*- coding:utf-8 -*-  
    2. import tensorflow as tf  
    3. filenames = ['A.csv', 'B.csv', 'C.csv']  
    4. filename_queue = tf.train.string_input_producer(filenames, shuffle=False)  
    5. reader = tf.TextLineReader()  
    6. key, value = reader.read(filename_queue)  
    7. record_defaults = [['null'], ['null']]  
    8. #定义了多种解码器,每个解码器跟一个reader相连  
    9. example_list = [tf.decode_csv(value, record_defaults=record_defaults)  
    10.                   for _ in range(2)]  # Reader设置为2  
    11. # 使用tf.train.batch_join(),可以使用多个reader,并行读取数据。每个Reader使用一个线程。  
    12. example_batch, label_batch = tf.train.batch_join(  
    13.       example_list, batch_size=5)  
    14. with tf.Session() as sess:  
    15.     coord = tf.train.Coordinator()  
    16.     threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord)  
    17.     for i in range(10):  
    18.         e_val,l_val = sess.run([example_batch,label_batch])  
    19.         print e_val,l_val  
    20.     coord.request_stop()  
    21.     coord.join(threads)  


    tf.train.batchtf.train.shuffle_batch函数是单个Reader读取,但是可以多线程。tf.train.batch_jointf.train.shuffle_batch_join可设置多Reader读取,每个Reader使用一个线程。至于两种方法的效率,单Reader时,2个线程就达到了速度的极限。多Reader时,2个Reader就达到了极限。所以并不是线程越多越快,甚至更多的线程反而会使效率下降。

    5、迭代控制,设置epoch参数,指定我们的样本在训练的时候只能被用多少轮

    [python] view plain copy
     
    1. #-*- coding:utf-8 -*-  
    2. import tensorflow as tf  
    3. filenames = ['A.csv', 'B.csv', 'C.csv']  
    4. #num_epoch: 设置迭代数  
    5. filename_queue = tf.train.string_input_producer(filenames, shuffle=False,num_epochs=3)  
    6. reader = tf.TextLineReader()  
    7. key, value = reader.read(filename_queue)  
    8. record_defaults = [['null'], ['null']]  
    9. #定义了多种解码器,每个解码器跟一个reader相连  
    10. example_list = [tf.decode_csv(value, record_defaults=record_defaults)  
    11.                   for _ in range(2)]  # Reader设置为2  
    12. # 使用tf.train.batch_join(),可以使用多个reader,并行读取数据。每个Reader使用一个线程。  
    13. example_batch, label_batch = tf.train.batch_join(  
    14.       example_list, batch_size=1)  
    15. #初始化本地变量  
    16. init_local_op = tf.initialize_local_variables()  
    17. with tf.Session() as sess:  
    18.     sess.run(init_local_op)  
    19.     coord = tf.train.Coordinator()  
    20.     threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord)  
    21.     try:  
    22.         while not coord.should_stop():  
    23.             e_val,l_val = sess.run([example_batch,label_batch])  
    24.             print e_val,l_val  
    25.     except tf.errors.OutOfRangeError:  
    26.             print('Epochs Complete!')  
    27.     finally:  
    28.             coord.request_stop()  
    29.     coord.join(threads)  
    30.     coord.request_stop()  
    31.     coord.join(threads)  


    在迭代控制中,记得添加tf.initialize_local_variables(),官网教程没有说明,但是如果不初始化,运行就会报错。

    =========================================================================================对于传统的机器学习而言,比方说分类问题,[x1 x2 x3]是feature。对于二分类问题,label经过one-hot编码之后就会是[0,1]或者[1,0]。一般情况下,我们会考虑将数据组织在csv文件中,一行代表一个sample。然后使用队列的方式去读取数据

    说明:对于该数据,前三列代表的是feature,因为是分类问题,后两列就是经过one-hot编码之后得到的label

    使用队列读取该csv文件的代码如下:

    [python] view plain copy
     
    1. #-*- coding:utf-8 -*-  
    2. import tensorflow as tf  
    3. # 生成一个先入先出队列和一个QueueRunner,生成文件名队列  
    4. filenames = ['A.csv']  
    5. filename_queue = tf.train.string_input_producer(filenames, shuffle=False)  
    6. # 定义Reader  
    7. reader = tf.TextLineReader()  
    8. key, value = reader.read(filename_queue)  
    9. # 定义Decoder  
    10. record_defaults = [[1], [1], [1], [1], [1]]  
    11. col1, col2, col3, col4, col5 = tf.decode_csv(value,record_defaults=record_defaults)  
    12. features = tf.pack([col1, col2, col3])  
    13. label = tf.pack([col4,col5])  
    14. example_batch, label_batch = tf.train.shuffle_batch([features,label], batch_size=2, capacity=200, min_after_dequeue=100, num_threads=2)  
    15. # 运行Graph  
    16. with tf.Session() as sess:  
    17.     coord = tf.train.Coordinator()  #创建一个协调器,管理线程  
    18.     threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord)  #启动QueueRunner, 此时文件名队列已经进队。  
    19.     for i in range(10):  
    20.         e_val,l_val = sess.run([example_batch, label_batch])  
    21.         print e_val,l_val  
    22.     coord.request_stop()  
    23.     coord.join(threads)  


    输出结果如下:

    说明:

    record_defaults = [[1], [1], [1], [1], [1]]

    代表解析的模板,每个样本有5列,在数据中是默认用‘,’隔开的,然后解析的标准是[1],也即每一列的数值都解析为整型。[1.0]就是解析为浮点,['null']解析为string类型

    本文转自  https://blog.csdn.net/lujiandong1/article/details/53376802

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