• 【模式匹配】Aho-Corasick自动机


    1. 多模匹配

    AC自动机(Aho-Corasick Automaton)是多模匹配算法的一种。所谓多模匹配,是指在字符串匹配中,模式串有多个。前面所介绍的KMPBM为单模匹配,即模式串只有一个。假设主串(T[1 cdots m]),模式串有k个(mathbb{P} = { P_1, cdots, P_k}),且模式串集合的总长度为(n)。如果采用KMP来匹配多模式串,则算法复杂度为:

    [O(|P_1|+m+cdots + |P_k|+m)=O(n+km) ]

    而KMP并没有利用到模式串之间的重复字符结构信息,每一次的匹配都需要将主串从头至尾扫描一遍。贝尔实验室的Aho与Corasick于1975年基于有限状态机(finite state machines)提出AC自动机算法[1]。小插曲:实际上AC算法比KMP提出要早,KMP是1977年才被提出来了的。

    2. AC算法

    AC自动机

    自动机由状态(数字标记的圆圈)和转换(带标签的箭头)组成,每一次转换对应一个字符。AC算法的核心包括三个函数:goto、failure、output;这三个函数构成了AC自动机。对于模式串{he, his, hers, she},goto函数表示字符按模式串的转移,暗含了模式串的共同前缀的字符结构信息,如下图:

    failure函数表示匹配失败时退回的状态:

    output函数表示模式串对应于自动机的状态:

    完整的AC自动机如下:

    匹配

    AC算法根据自动机匹配模式串,过程比较简单:从主串的首字符、自动机的初始状态0开始,

    • 若字符匹配成功,则按自动机的goto函数转移到下一状态;且若转移的状态对应有output函数,则输出已匹配上的模式串;
    • 若字符匹配失败,则递归地按自动机的failure函数进行转移

    匹配母串的算法如下:

    构造

    AC自动机的确简单高效,但是如何构造其对应的goto、failure、output函数呢?首先来看goto函数,细心一点我们发现goto函数本质上就是一棵带有回退指针的trie树,利用模式串的共同前缀信息,与output函数共同表示模式串的字符结构的信息。

    failure函数是整个AC算法的精妙之处,用于匹配失败时的回溯;且回溯到的状态(state)应满足:状态(state)能按当前状态的转移字符进行能goto到的状态,且能构成最长匹配。记(g(r,a)=s)表示状态r可以按字符a goto到状态s,则称状态r为状态s的前一状态,字符a为状态s的转移字符。failure函数满足这样一个规律:当匹配失败时,回溯到的状态为前一状态的failure函数值(我们称之为failure转移状态)按转移字符能goto到的状态;若不能,则为前一状态的failure转移状态的failure转移状态按转移能goto到的状态;若不能,则为......上面的话听着有点拗口,让我们以上图AC自动机为例子来说明:

    • 对于状态7,前一状态6的failure转移状态为0,状态0按转移字符s可以goto到状态3,所以状态7的failure函数(f(7)=3)
    • 对于状态2,前一状态1的failure转移状态为0,状态0按转移字符e可以goto到状态0,所以状态2的failure函数(f(2)=0)

    其中,所有root节点(状态0)能goto到的状态,其failure函数值均为0。根据goto表(trie树)的特性,可知某一状态的前一状态、转移字符是唯一确定的。因此定义(eta(s)=r)表示状态(s)的前一状态为(r)( au(s)=a)指状态(s)的转移字符为(a);记(f^{i}(s)=fleft( f^{(i-1)}(s) ight))。那么,状态s的failure函数的计算公式为:

    [f(s) = left{ {matrix{ {gleft( f^{n}(eta(s)), au(s) ight)} & n = arg underset{i}{min} \, left{ gleft( f^{i}(eta(s)), au(s) ight) eq failure ight}cr {0} & else cr } } ight. ]

    在计算failure函数时,巧妙地运用队列进行递归构造,具体实现如下:

    3. 实现

    Talk is cheap, show me the code. Java版实现在这里;下面给出python实现(代码参考了 Implementation of the Aho-Corasick algorithm in Python):

    # coding=utf-8
    from collections import deque, namedtuple
    
    automaton = []
    # state_id: int, value: char, goto: dict, failure: int, output: set
    Node = namedtuple("Node", "state value goto failure output")
    
    
    def init_trie(words):
        """
        creates an AC automaton, firstly create an empty trie, then add words to the trie
        and sets fail transitions
        """
        create_empty_trie()
        map(add_word, words)
        set_fail_transitions()
    
    
    def create_empty_trie():
        """ initialize the root of the trie """
        automaton.append(Node(0, '', {}, 0, set()))
    
    
    def add_word(word):
        """add word into trie"""
        node = automaton[0]
        for char in word:
            # char is not in trie
            if goto_state(node, char) is None:
                next_state = len(automaton)
                node.goto[char] = next_state  # modify goto(state, char)
                automaton.append(Node(next_state, char, {}, 0, set()))
                node = automaton[next_state]
            else:
                node = automaton[goto_state(node, char)]
        node.output.add(word)
    
    
    def goto_state(node, char):
        """goto function"""
        if char in node.goto:
            return node.goto[char]
        else:
            return None
    
    
    def set_fail_transitions():
        """construction of failure function, and update the output function"""
        queue = deque()
        # initialization
        for char in automaton[0].goto:
            s = automaton[0].goto[char]
            queue.append(s)
            automaton[s] = automaton[s]._replace(failure=0)
        while queue:
            r = queue.popleft()
            node = automaton[r]
            for a in node.goto:
                s = node.goto[a]
                queue.append(s)
                state = node.failure
                # failure transition recursively
                while goto_state(automaton[state], a) is None and state != 0:
                    state = automaton[state].failure
                # except the chars in goto function, all chars transition will goto root node self
                if state == 0 and goto_state(automaton[state], a) is None:
                    goto_a = 0
                else:
                    goto_a = automaton[state].goto[a]
                automaton[s] = automaton[s]._replace(failure=goto_a)
                fs = automaton[s].failure
                automaton[s].output.update(automaton[fs].output)
    
    
    def search_result(strings):
        """AC pattern matching machine"""
        result_set = set()
        node = automaton[0]
        for char in strings:
            while goto_state(node, char) is None and node.state != 0:
                node = automaton[node.failure]
            if node.state == 0 and goto_state(node, char) is None:
                node = automaton[0]
            else:
                node = automaton[goto_state(node, char)]
            if len(node.output) >= 1:
                result_set.update(node.output)
        return result_set
    
    
    init_trie(['he', 'she', 'his', 'hers'])
    print search_result("ushersm")
    

    -------------------------------------------------------- 2016-06-14 更新 --------------------------------------------------------

    实现了一个scala版本,支持添加词属性,代码托管在scala-AC

    4. 参考资料

    [1] Aho, Alfred V., and Margaret J. Corasick. "Efficient string matching: an aid to bibliographic search." Communications of the ACM 18.6 (1975): 333-340.
    [2] Pekka Kilpeläinen, Lecture 4: Set Matching and Aho-Corasick Algorithm.

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