多级目录结构的软件，一般是单个程序、库文件或模块放在各自的目录中。automake要求每个目录都有自己的Makefile.am文件来编译各自目录 下的代码。在顶级的目录中，有一个Makefile.am文件，该文件通过SUBDIRS指明了这个目录下有多少个直接下级目录的代码需要编译。下级目录 的Makefile.am也指明自己需要编译的下级目录。通过这样的层层递归i，从而完成多级目录结构的编译。
下面看一个具体的示例：
本例假设目录结构如下：
helloworld |src ||--test.cpp ||dohello |||--dohello.h |||--dohello.cpp |doc ||--userguide
顶级目录helloworld，该目录下有src和doc两个目录。src目录下有一个test.cpp文件，一个dohello目录，dohello目录下又有dohello.h和dohello.cpp两个文件。doc下有一个readme文件。
整个程序中test.cpp是主文件，里面有main函数。test.cpp调用了dohello.h和dohello.cpp中的类。
下面是编译步骤：
1.运行autoscan产生configure.scan
在顶级目录helloworld下运行autoscan命令。产生configure.scan文件内容如下：
# -*- Autoconf -*- # Process this file with autoconf to produce a configure script. AC_PREREQ(2.61) AC_INIT(FULL-PACKAGE-NAME, VERSION, BUG-REPORT-ADDRESS) AC_CONFIG_SRCDIR([src/test.cpp]) AC_CONFIG_HEADER([config.h]) # Checks for programs. AC_PROG_CXX AC_PROG_CC # Checks for libraries. # Checks for header files. # Checks for typedefs, structures, and compiler characteristics. # Checks for library functions. AC_CONFIG_FILES([Makefile src/Makefile src/dohello/Makefile]) AC_OUTPUT
2.编辑configure.in
将configure.scan改名成configure.in，然后修改如下：
# Process this file with autoconf to produce a configure script. AC_PREREQ(2.61) AC_INIT(hello,1.0) #软件包名称和版本号,另一种写法是写在AM_INIT_AUTOMAKE中. AC_CONFIG_SRCDIR([src/test.cpp]) #AC_CONFIG_HEADER([config.h]) AM_INIT_AUTOMAKE # Checks for programs. AC_PROG_CXX AC_PROG_CC AC_PROG_RANLIB #使用了静态库编译,需要此宏定义 # Checks for libraries. # Checks for header files. # Checks for typedefs, structures, and compiler characteristics. # Checks for library functions. #AC_CONFIG_FILES([src/Makefile src/dohello/Makefile]) AC_OUTPUT(Makefile src/Makefile src/dohello/Makefile) #需要生成的Makefile，本例需要生成三个。
3.运行aclocal和autoconf
configure.in修改完后则先后执行aclocal和autoconf命令。
4.建立各个目录的Makefile.am文件
在顶级目录、src目录和dohello目录下分别建立三个Makefile.am文件。内容分别如下：
顶级目录Makefile.am：
#----------------开始------------------------------------------ AUTOMAKE_OPTIONS=foreign SUBDIRS=src #本目录的直接下级目录src需要编译 EXTRA_DIST=doc/userguide #doc/userguide不需要编译，但要发布该文件。如果有多个文件，则用空格分开。 #----------------结束------------------------------------------
src目录下的Makefile.am：
#----------------开始------------------------------------------ AUTOMAKE_OPTIONS=foreign SUBDIRS=dohello #本目录的直接下级目录dohello需要编译 bin_PROGRAMS=hello #本目录的文件编译成可执行文件hello。如有多个，用空格分开。然后在下面分别写它们的SOURCE和LDADD。 hello_SOURCES=test.cpp #编译hello需要的源文件列表，如有多个，用空格分开。 hello_LDADD=dohello/libhello.a #编译hello需要的库文件列表。如有多个，用空格分开。 #----------------结束------------------------------------------
dohello目录下的Makefile.am：
#----------------开始------------------------------------------ AUTOMAKE_OPTIONS=foreign noinst_LIBRARIES=libhello.a #本目录下的代码编译成libhello.a库。不需要发布。如果需要发布，则写成bin_LIBRARIES。注意，库的名称格式必需为 libxxx.a。因为编译静态库，configure.in需要定义AC_PROG_RANLIB宏。 libhello_a_SOURCES=dohello.h dohello.cpp #编译libhello.a需要的源文件。注意将库名称中的'.'号改成'_'号。 #----------------结束------------------------------------------
5.运行automake
以上几个Makefile.am都书写完毕后，运行automake --add-missing。
6.运行./configure和make