讨论是整篇论文的精华和灵魂，考查作者的文献积累量和对所研究内容的理解深度，作者需要阐述为什么结果是重要的，内容包括理论、应用、在其他其他领域的作用及应用，阐述时要求直接明确。
具体而言，首先概述最重要的结果，根据是否符合最后结果做出解释，对能解释的问题加以解释，对不能解决的问题提出猜测，实在不能解决的问题需要说明研究的局限性，最后可以阐述还需要什么实验是结果更明确。使用主动语态，常用现在时和过去时。
结构上，第一段写主要的研究结果，也就是前面图意味着什么，然后说明研究的意义。中间段阐释与别人的实验有何不同，给出可能的猜测，讨论能解释的结果必须自圆其说，不能解释的结果要考虑研究的局限性。末段用来总结几个重要的研究结果，及该研究的应用。
常见问题：没有选择深入讨论的问题，没有体现出自身研究的独特性，没能从同一个问题多个角度讨论，即讨论为什么方法或原理会不同，结果和讨论的没对应，作者不引用或没有系统引用，这使得可信度降低，没有与自身前作相讨论，仅简单重复introduction或result却没解释，对结果过度解释，夸大结果重要性，在讨论中指责其他研究。