5.4利用RFLP和SNP绘制遗传图
因为限制性标记可以确定那个分子水平上的突变（即已知基因座），但是无法和蛋白质功能相联系。所以我们采用限制性标记的多态性，即该限制酶识别的位点若发生突变，则大概率在该基因座附近，所以可以将这些位点和表型相联系。所以可以据此判断遗传病的突变位点（因为突变在靶基因附近，所以酶限制位点在靶基因附近）和判定两个基因是否重组（若发生重组，则限制酶位点转移）
因为RELP利用序列长度从而定位距离（例如DNA指纹（DNA fingerprinting），就是比较亲子之间染色体特定区域的距离，以此判断亲缘关系），所以RELP可以定位到一个连锁群上的任何基因位点。
因为平均1kb一个SNP，所以SNP可以用来定位靶基因的位置（靶基因两边最近SNP）。
而具有这两种特点的区域被称为单体型（haplotpe），个体基因中单体型的个数，称为多态性频率（frequency of polymorphism）。