工具：keytool （Windows下路径：%JAVA_HOME%/bin/keytool.exe）
环境：Windows8.1企业版、Tomcat-7.0.27、JDK1.6、IE11、Chrome
一、为服务器生成证书
C:Windowssystem32>keytool -genkey -v -alias tomcat -keyalg RSA -keystore D: omcat.keystore -validity 36500
输入keystore密码：
再次输入新密码:
您的名字与姓氏是什么？
[Unknown]： StoneXing
您的组织单位名称是什么？
[Unknown]： iFLYTEK
您的组织名称是什么？
[Unknown]： iFLYTEK
您所在的城市或区域名称是什么？
[Unknown]： 合肥市
您所在的州或省份名称是什么？
[Unknown]： 安徽省
该单位的两字母国家代码是什么
[Unknown]： CN
CN=StoneXing, OU=iFLYTEK, O=iFLYTEK, L=合肥市, ST=安徽省, C=CN 正确吗？ [否]： y
正在为以下对象生成 1,024 位 RSA 密钥对和自签名证书 (SHA1withRSA)（有效期为 36,500 天）:
CN=StoneXing, OU=iFLYTEK, O=iFLYTEK, L=合肥市, ST=安徽省, C=CN
输入<tomcat>的主密码
（如果和 keystore 密码相同，按回车）：
[正在存储 D: omcat.keystore]
C:Windowssystem32>
“D: omcat.keystore”含义是将证书文件的保存路径，证书文件名称是tomcat.keystore(可自定义名称)；
“-validity 36500”含义是证书有效期，36500表示100年，默认值是90天；
二、为客户端生成证书
1、生成客户端证书C:Windowssystem32>keytool -genkey -v -alias mykey -keyalg RSA -storetype PKCS12 -keystore D:client.key.p12
输入keystore密码：
再次输入新密码:
您的名字与姓氏是什么？
[Unknown]： StoneXing
您的组织单位名称是什么？
[Unknown]： iFLYTEK
您的组织名称是什么？
[Unknown]： iFLYTEK
您所在的城市或区域名称是什么？
[Unknown]： 合肥
您所在的州或省份名称是什么？
[Unknown]： 安徽省
该单位的两字母国家代码是什么
[Unknown]： CN
CN=StoneXing, OU=iFLYTEK, O=iFLYTEK, L=合肥, ST=安徽省, C=CN 正确吗？ [否]： y
正在为以下对象生成 1,024 位 RSA 密钥对和自签名证书 (SHA1withRSA)（有效期为 90 天）:
CN=StoneXing, OU=iFLYTEK, O=iFLYTEK, L=合肥, ST=安徽省, C=CN
[正在存储 D:client.key.p12]
C:Windowssystem32>
生成的两个文件：
2、安装客户端证书
双击客户端证书“client.key.p12”完成导入证书过程如下：
三、让服务器信任客户端证书
1、将客户端证书导出为CER文件由于是双向SSL认证，服务器必须要信任客户端证书，因此，必须把客户端证书添加为服务器的信任认证。因不能直接将PKCS12格式的证书库导入服务器证书库，将客户端证书导出为一个单独的CER文件
keytool -export -alias mykey -keystore D:client.key.p12 -storetype PKCS12 -storepass password -rfc -file D:client.key.cer
注：password为客户端证书的密码
C:Windowssystem32>keytool -export -alias mykey -keystore D:client.key.p12 -storetype PKCS12 -storepass 888888 -rfc -file D:client.key.cer
保存在文件中的认证 <D:client.key.cer>
C:Windowssystem32>
2、将CER文件导入到服务器的证书库
添加为一个信任证书使用命令如下：
C:Windowssystem32>keytool -import -v -file D:client.key.cer -keystore D: omcat.keystore
输入keystore密码：
所有者:CN=StoneXing, OU=iFLYTEK, O=iFLYTEK, L=合肥, ST=安徽省, C=CN
签发人:CN=StoneXing, OU=iFLYTEK, O=iFLYTEK, L=合肥, ST=安徽省, C=CN
序列号:52e07723
有效期: Thu Jan 23 09:57:55 CST 2014 至Wed Apr 23 09:57:55 CST 2014
证书指纹:
MD5:15:29:58:68:8D:63:E1:00:8E:E6:EC:5E:AD:23:79:38
SHA1:B7:EF:B9:67:BD:56:95:82:3D:D8:14:0D:20:69:F0:C8:60:98:31:9A
签名算法名称:SHA1withRSA
版本: 3
信任这个认证？ [否]： y
认证已添加至keystore中
[正在存储 D: omcat.keystore]
C:Windowssystem32>
3、检查安装结果
通过list命令查看服务器的证书库，可以看到两个证书，一个是服务器证书，一个是受信任的客户端证书：
keytool -list -keystore D: omcat.keystore (tomcat为你设置服务器端的证书名)。
C:Windowssystem32>keytool -list -keystore D: omcat.keystore
输入keystore密码：
Keystore 类型： JKS
Keystore 提供者： SUN
您的 keystore 包含 2 输入
tomcat, 2014-1-23, PrivateKeyEntry,
认证指纹 (MD5)： 4B:71:06:02:7C:35:F8:BF:B1:24:E2:68:8F:65:75:15
mykey, 2014-1-23, trustedCertEntry,
认证指纹 (MD5)： 15:29:58:68:8D:63:E1:00:8E:E6:EC:5E:AD:23:79:38
C:Windowssystem32>
四、让客户端信任服务器证书
1、把服务器证书导出为CER文件由于是双向SSL认证，客户端也要验证服务器证书，因此，必须把服务器证书添加到浏览的“受信任的根证书颁发机构”。由于不能直接将keystore格式的证书库导入，必须先把服务器证书导出为一个单独的CER文件，使用如下命令：
keytool -keystore D:home omcat.keystore -export -alias tomcat -file D:home omcat.cer (tomcat为你设置服务器端的证书名)。
C:Windowssystem32>keytool -keystore D: omcat.keystore -export -alias tomcat -file D: omcat.cer
输入keystore密码：
保存在文件中的认证 <D: omcat.cer>
C:Windowssystem32>
2、在客户端安装服务器证书
双击“tomcat.cer”，按照提示安装证书，将证书填入到“受信任的根证书颁发机构”。
3、检查安装结果
IE -> Internet选项 -> 内容 -> 证书
五、配置Tomcat服务器
-
<Connector port="8443" protocol="HTTP/1.1" SSLEnabled="true"
-
maxThreads="150" scheme="https" secure="true"
-
clientAuth="false" sslProtocol="TLS"
-
keystoreFile="D:\tomcat.keystore" keystorePass="888888"
-
truststoreFile="D:\tomcat.keystore" truststorePass="888888" />
注意服务端证书名保持一致
属性说明：
clientAuth:设置是否双向验证，默认为false，设置为true代表双向验证
keystoreFile:服务器证书文件路径
keystorePass:服务器证书密码
truststoreFile:用来验证客户端证书的根证书，此例中就是服务器证书
truststorePass:根证书密码
六、测试
https://localhost:8443/
服务器的证书与网址不相符问题需要理解浏览器做了什么：
1、浏览器将自己支持的一套加密规则发送给网站。2、网站从中选出一组加密算法与HASH算法，并将自己的身份信息以证书的形式发回给浏览器。证书里面包含了网站地址，加密公钥，以及证书的颁发机构等信息。
3、获得网站证书之后浏览器要做以下工作：
a) 验证证书的合法性（颁发证书的机构是否合法，证书中包含的网站地址是否与正在访问的地址一致等），如果证书受信任，则浏览器栏里面会显示一个小锁头，否则会给出证书不受信的提示。
b) 如果证书受信任，或者是用户接受了不受信的证书，浏览器会生成一串随机数的密码，并用证书中提供的公钥加密。
c) 使用约定好的HASH计算握手消息，并使用生成的随机数对消息进行加密，最后将之前生成的所有信息发送给网站。
引用：http://bbs.csdn.net/topics/390685015