• conda 添加bioconda源,创建/删除/重命名环境


    1.conda安装

    https://repo.continuum.io/miniconda/选择conda版本

    wget "https://repo.continuum.io/archive/Miniconda2-4.5.12-Linux-x86_64.sh"
    
    bash Miniconda2-4.5.12-Linux-x86_64.sh
    
    source ~/.bashrc
    

    2.添加镜像源

    conda config --add channels conda-forge
    conda config --add channels defaults
    conda config --add channels r
    conda config --add channels bioconda
    

    3.添加国内镜像源

    conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
    conda config --set show_channel_urls yes
    conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
    conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/
    
    # bioconda
    conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
    conda config --set show_channel_urls yes
    
    conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
    conda config --set show_channel_urls yes
    

    4.创建新环境

    conda create -n py python=3.5

    5.删除新环境

    conda remove -n py --all
    

    6.重命名环境

    conda create -n py3.5 --clone py
    
    
    conda remove -n py3.5 --all
    
    
    conda info -e
    
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  • 原文地址:https://www.cnblogs.com/yahengwang/p/10613027.html
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