下载网址:https://sourceforge.net/projects/calibur/
安装:
1 $ tar zxvf calibur.tar.gz 2 $ cd calibur 3 $ make
安装完成后,会产生calibur和calibur-lite两个可执行文件。
添加环境变量:
1 $ vim ~/.bashrc 2 #calibur 3 export PATH=$Programs/calibur:$PATH 4 $ source ~/.bashrc
安装及配置完成。
用法:
1. 首先需要把所有pdb文件的名称制成一个列表;
1 $ ls *.pdb > pdblist
2. 运行calibur;
1 $ calibur pdblist # 软件自行指定合适的阈值 2 $ calibur pdblist 1 # 自己指定阈值 3 $ calibur # 打印帮助信息