R语言-处理异常值或报错的三个示例

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Tuesday, March 31, 2015

之前用rvest帮人写了一个定期抓取amazon价格库存，并与之前价格比较的小程序，算是近期写过的第一个完整的程序了。里面涉及了一些报错的处理。

这里主要参考了stackoverflow上的以下问答：

1. How to skip an error in a loop
2. skip to next value of loop upon error in R

tryCatch部分，后续查找资料，发现以下博文： 1. R语言使用tryCatch进行简单的错误处理

以下是代码示例：

1）使用tryCatch函数跳过错误信息。（示例以download.file为样式）

看以下代码。这里需要批量下载一堆amazon产品信息。如果产品ID号不对，或者IP被限制，网页会打不开，而download.file会报错。我这里用tryCatch来获取网页打不开时的错误信息。并且要求执行下一步循环“”。

for (n in 1:length(productlink)){
        tryCatch({
        download.file(productlink[n],paste0(getwd(),"/html/",productid[n,],".html"),cacheOK = TRUE)
        },error=function(e){cat("ERROR :",conditionMessage(e),"
")})
        Sys.sleep(0.5) #增加了Sys.sleep(seconds)函数，让每一步循环都暂停一段时间。这个虽然会降低程序速度，但对于有访问限制的网站，不失为一个好的办法。
}

上述示例由两个重要函数构成，即tryCatch和cat

查阅函数，tryCatch属于base包，condition system。在R语言使用tryCatch进行简单的错误处理这篇博文里有tryCatch的简单示范如下：

result = tryCatch(
        {expr}, 
        warning = function(w) {warning-handler-code}, 
        error = function(e) { error-handler-code}, 
        finally = {cleanup-code}
        )

即如果warning时，对warning怎么处理，如果error时对error怎么处理。如果没有任何条件吻合，则最后会输出expr里的内容。如果有final项的话，则会同时输出finally项以及expr项

tryCatch({a<-"c"
        b<-"c"
        b==a},
        error=function(e){cat("hahaha",conditionMessage(e),"

")},
        finally={print("ccc")})

[1] "ccc"
[1] TRUE

tryCatch({a<-"c"

         cc==a}, #cc不存在
        error=function(e){cat("hahaha",conditionMessage(e),"

")},
        finally={print("ccc")})
hahaha object 'cc' not found 

对于代码示例，即为，download成功则返回download内容，不成功则返回error=function(e){cat("ERROR :",conditionMessage(e)," ")}

然后是cat函数。这个cat是一个输入输出值。这里等于，要求系统输出“ERROR :”+conditionMessage(e)的内容。然后用“”分行。

另外，在stackoverflow上的这篇问答,由mmann1123回答的问题里，我们看到了更为有趣的一个应用。

这里收缩起来，展开亦可阅读。

#!/usr/bin/env Rscript
# tryCatch.r -- experiments with tryCatch

# Get any arguments
arguments <- commandArgs(trailingOnly=TRUE)
a <- arguments[1]

# Define a division function that can issue warnings and errors
myDivide <- function(d, a) {
  if (a == 'warning') {
    return_value <- 'myDivide warning result'
    warning("myDivide warning message")
  } else if (a == 'error') {
    return_value <- 'myDivide error result'
    stop("myDivide error message")
  } else {
    return_value = d / as.numeric(a)
  }
  return(return_value)
}

# Evalute the desired series of expressions inside of tryCatch
result <- tryCatch({

  b <- 2
  c <- b^2
  d <- c+2
  if (a == 'suppress-warnings') {
    e <- suppressWarnings(myDivide(d,a))
  } else {
    e <- myDivide(d,a) # 6/a
  }
  f <- e + 100

}, warning = function(war) {

  # warning handler picks up where error was generated
  print(paste("MY_WARNING:  ",war))
  b <- "changing 'b' inside the warning handler has no effect"
  e <- myDivide(d,0.1) # =60
  f <- e + 100
  return(f)

}, error = function(err) {

  # warning handler picks up where error was generated
  print(paste("MY_ERROR:  ",err))
  b <- "changing 'b' inside the error handler has no effect"
  e <- myDivide(d,0.01) # =600
  f <- e + 100
  return(f)

}, finally = {

  print(paste("a =",a))
  print(paste("b =",b))
  print(paste("c =",c))
  print(paste("d =",d))
  # NOTE:  Finally is evaluated in the context of of the inital
  # NOTE:  tryCatch block and 'e' will not exist if a warning
  # NOTE:  or error occurred.
  #print(paste("e =",e))

}) # END tryCatch

print(paste("result =",result))

2)利用if语句以及stop语句。

即，如果某条件不成立，则停止程序，并输出stop里的内容。我这里主要用于检查原始product id是否输入正确。

if (!sum(check)==length(productlink)) {
        productlink<-NULL
        productid<-NULL
    stop("invalid productid please double check if any space or else in, and resave the file or the script will not run")
    }

3）处理使用data.frame批量读取数据时，元素因为不存在导致的data.frame报错。

譬如说以下示例，因为a不存在，而导致data.frame报错。

a<-NULL
b<-c("cc","dd")
data.frame(a,d)
> Error in data.frame(a, d) : 参数值意味着不同的行数: 0, 2

 因此，对于在循环里，需要先单独合成data.frame，再使用rbind把各个data.frame合成在一起时，可以考虑增加异常值的赋值。如下面两段，如果我拉的网页里不存在product name，则length(productname)==1为FALSE，直接输出“product not download or not existing”，那么这个字段就不是空值或者2-3个行，而是1行，之后合并为data.frame时就不会报错了。

data<-function(n){
        ####隐掉获得productname/price/category的代码
        if(!length(productname)==1) {productname="Product not download or not existing"}
        if (!length(price)==1) {
                        price=NA 
                        category<-"Product not download or not existing"
        }
        data.frame(productname,price,category)
        #这里合成data.frame，如果这三个行数不等（多为空值NULL，或者某个字段有2-3行所导致。
        #使用上面的IF判断赋值的好处是，最后出来的productname,price,category保证是1行，可以用data.frame合并。并且对异常值也有输出。

 由于处理第2/3类错误时我还不了解tryCatch函数。目前看下来，貌似tryCatch函数能做的事情更多？

写下来供以后写代码时参考。

另外，tryCatch在java,C里均有类似功效。看来R归根到底，还是脱离不了底层语言啊。

接下来4月的学习计划，学完一个就写一篇博文~~整理思路记录笔记。

1）rCurl包，以及它那个厚厚的英文说明书。希望最后能学会用它爬一些rvest无法爬的脚本网页，以及搜索框网页等

2）用R做金融时间序列分析（炼数成金的班）

3）跟着肖星老师重新复习财务分析知识（mooc课），在复习过去的财务知识后，再重新来看预测者网下的股票数据，尝试做一下挖掘与分析，至少从宏观上了解当前中国上市公司的布局与特点，为以后用R研究股票打打基础。

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