我的机器上最开始安装的是jdk1.6，后来因为工作需要又安装了jdk1.4。但是，环境变量我并未更改，还是指向jdk1.6的路径的。可是，在cmd窗口输入 Java -version 却得到是1.4.2。
查询环境变量：
1.我的电脑->属性->高级->环境变量
2. 系统环境变量(HKEY_LOCAL_MACHINE/SYSTEM/CurrentControlSet/Control/Session Manager/Environment)
当前用户环境变量(HKEY_CURRENT_USER/Environment)
2个设置完全是一样，都是指向1.6。
为了搞清楚问题的原因，通过查询相关的资料，原来是这样的：
JDK在安装的过程当中将在注册表会生成如下3个项目：
HKEY_LOCAL_MACHINE/SOFTWARE/JavaSoft/Java Development Kit
HKEY_LOCAL_MACHINE/SOFTWARE/JavaSoft/Java Plug-in
HKEY_LOCAL_MACHINE/SOFTWARE/JavaSoft/Java Runtime Environment
同 时，JDK安装程序将会把java.exe，javaw.exe，javareg.exe这3个可执行文件拷贝 到%SystemRoot%/system32目录下，由于%SystemRoot%/system32被操作系统缺省的设置为最高优先权的PATH搜索 路径，因此可保证用户在命令行任何目录下可运行java.exe来启动JVM。
查询HKEY_LOCAL_MACHINE/SOFTWARE/JavaSoft/Java Runtime Environment得知CurrentVersion=1.4。 于是我手动将它修改为1.6后，然后运行java -version得到以下结果：
Registry key 'Software/JavaSoft/Java Runtime Environment/
has value '1.6', but '1.4' is required.
Error: could not find java.dll
Error: could not find Java 2 Runtime Environment.
所以，不能简单的修改注册表的CurrentVersion值来达到更改运行的JRE。若人为的修改CurrentVersion，会使得不同版本的java.exe加载与己版本不符的java.dll及 jvm.dll，将引起难以预料的后果！
一 般地，当在系统中装了两套或多套版本的Java2 SDK，后面安装的Java2 SDK会将自己带的java.exe和javaw.exe拷贝到%SystemRoot%/system32目录下，从而覆盖先前版本的java.exe 和 javaw.exe，并且在注册表中改写CurrentVersion为后安装的版本。所以建议在安装Java2 SDK前，先卸载以前安装的版本。
以下是在我在系统中安装多个版本JDK的体验：
1、安装JDK1.5以上版本：这可以保证任何版本的ECLIPSE都可以安装（否则如果安装JDK为1.3而ECLIPSE为高版本的会提示JDK版本低，安装不了；有的如果先安装了高版本的JDK，但一段时间后卸载了高版本的JDK，那么电脑上只有低版本的JDK和高版本的ECLIPSE，则运行ECLIPSE时只会看到起动界面，而后消失）。
2、安装ECLIPSE，在安装了高版本的JDK后，一般ECLIPSE安装没有问题
3、视情况而定，看你要运行的程序是哪个JDK的（有的程序是之前开发的使用的JDK版本可能是1.3的），如我现在要运行JDK1.3下的程序，我会
（1）从别的电脑上拷贝已安装好的JDK1.3文件夹
（2）将PATH，CLASSPATH指该文件夹目录
（3）ECLIPSE/WINDOW/PREFERENCES/JAVA/INSTALLED JRES/在里面添加并勾选JDK1.3，并勾除JDK1.5的。
（4）将ECLIPSE/WINDOW/PREFERENCES/JAVA/COMPILER中的compliance设为1.3的版本即可。（如果选1.5可能会在命令环境编译正确，但eclipse报错：说java.lang.UnsupportedClassVersionError could not found main class），还有可能出错的就是在eclipse下默认包时编译正错，但使用自己创建的包时编译其中的类失败。
其实可以直接将环境变量中path的配置:%java_home%in放到最前面，然后可以修改java_home的值切换不同的jdk。
相关问题可以见：
http://www.blogjava.NET/zhyiwww/archive/2007/01/16/94235.html
http://blog.csdn.Net/ybyb14/archive/2007/05/09/1602230.asp