http://blog.csdn.net/baiyuliang2013/article/details/40426681
很多开发者，不管是个人或是公司都不太注重自己开发的应用的安全性，即是 否会被不法分子篡改代码，插入恶意代码，发一些垃圾广告，甚至盗用用户信息。包括我在内，也并不太在意，直到前几天在市场上发布的一款应用被盗版并上传到 了某些应用市场才发现问题的严重性！期初我并不知道该市场上的应用是盗版的，还在沾沾自喜呢，并且下载了一个装在了手机里，后来发现手机通知栏莫名其妙的 出现许多垃圾广告，还有一些应用我并没有安装，但却出现在了我的手机上，我纳闷了，长按通知栏信息可以显示发布该通知的应用的信息，进去一看竟然来自我的 应用，妈呀！这是怎么回事，我并没有上广告啊！于是，我就将此安装包反编译了下，一看原包里竟然多出了一个包叫做y6，并且清单文件中也加了许多代码包括 Service，Receiver之类的，最郁闷的是包名竟然被改了，最后我把植入的广告代码统统删除掉，包名也改回来后，重新打包，竟然又成功了，看到 这里，大家有何感想？？您在发布自己的应用时时候会考虑到这些？？
啰嗦了这么多，那么此时我们看看那些坏银是如何进行二次打包的！反编译大家应该都不陌生，apktool就可以了，但是如何修改或者插入代码，最后再回编 成apk呢？（注：对于此过程已经倒背如流的“大神”可以离开了）我们在用apktool反编译apk后生成的文件夹中包含了一个smali文件夹，如 图：
这个即是该应用的精华所在，所有代码都在这里了，打开之后看到的全是后缀为.smali的文件，再打开某一文件看看其代码，好像没怎么见过，对了，它便是Dalvik虚拟机指令语言，修改代码也是在这里修改的，大家可以百度下，普及一下知识，好了，下面将举一个简单的例子，包括利用apktool反编译——修改代码——回编译并签名——安装修改后的应用以测试等一系列过程：
1.利用利用apktool反编译apk：
首先我写了一个简单的例子，用Eclipse生成了一个测试apk（签名后的），主代码及运行结果如图：
MainActivity.java
接下来开始反编译：
将测试文件放进apktool文件夹中，并改名为123.apk，运行APKTool.cmd：
选择1反编译后，生成一文件夹名字为APK，打开文件夹及可看到如第一张图片所显示的目录了，打开smali文件夹并找到MainActivity.smali文件打开。找到如下代码：
这些代码其实和我们的源代码是一一对应的，源代码中有的，在这里都可以找到，只是smali用的是汇编语言，所以，想进行复杂的修改还是要去学学smali语法了。
2.修改代码：
因为此例比较简单，所以不会进行太复制的修改，我们把"test my application"修改为"哈哈，你的应用被破解啦"测试一下即可！
3.回编译：
修改完毕后保存，回到apktool根目录，打开刚才的cmd，选择2或3开始执行回编译，执行成功后记得按一下回车进行签名，重新签名的应用再安装的话是会报签名不一致错误的，所以需要把原来的卸载掉再重新安装，运行如图：
到此，二次打包成功！我在写这篇文章之前，也对几个游戏进行了反编并重新打包，里面所 付费的什么金币了钻石了再找到相应代码后都是可以修改的，不过有时在使用时修改后的金币或钻石时可能会联网检测，并带有签名参数，重新打包的签名肯定和原 签名是不一致的，这个其实要在再深入研究也是可以破解的！
看到这里，大家又有何感想呢？当我们发布一款应用时，一定要检查下我们的应用是否存在被二次打包的风险，可以用以上方法测试下，有问题的就要想办法加固了（注：只进行代码混淆是不能防止被二次打包的），不然被一些不法分子利用后，损失的不到是自己，公司也还包括用户的利益了，对自身的名誉也会造成一定的伤害！
回过头来，我们猜测一下开头提到的我的应用被安插恶意广告是怎么实现的？个人觉得，就是利用上面这种方法反编译后，把已经写好并生成的smali文件放进 了我的包里，然后在清单文件中进行一些配置，并修改了包名，最后重新打包（得出这个结果是有依据的，我对二次打包的apk又进行了一次反编译，并将其安插 的代码及配置代码全部删除，包名改回，第三次打包，安装后仍然没有任何问题，而且也去除了广告，除了签名不同外），最后再提一点就是二次打包是，清单文件 中的版本，版本号，包名都是可以修改的，这个大家一定要注意了！
最后附上apktool工具下载地址：http://download.csdn.net/detail/baiyuliang2013/8077501
说明：若使用时出现问题，可以尝试将其中的aapt.exe换成自己Eclipse中的aapt.exe。