在许多应用中,数据可能分散在许多文件或数据库中,存储的形式也不利于分析。本部分关注可以聚合、合并、重塑数据的方法。
1、层次化索引
层次化索引(hierarchical indexing)是pandas的一项重要功能,它使你能在一个轴上拥有多个(两个以上)索引级别。抽象点说,它使你能以低纬度形式处理高纬度数据。我们来看一个简单的栗子:创建一个Series,并用一个由列表或数组组成的列表作为索引:
data = pd.Series(np.random.randn(9), index=[['a', 'a', 'a', 'b', 'b', 'c', 'c', 'd', 'd'], [1, 2, 3, 1, 3, 1, 2, 2, 3]]) print(data)
a 1 -1.624220 2 -1.061747 3 0.895593 b 1 -2.702315 3 -1.690189 c 1 2.608471 2 1.167507 d 2 0.139161 3 1.298629 dtype: float64
看到的结果是经过美化的带有MultiIndex索引的Series的格式。索引之间的“间隔”表示“直接使用上面的标签”:
print(data.index)
MultiIndex([('a', 1), ('a', 2), ('a', 3), ('b', 1), ('b', 3), ('c', 1), ('c', 2), ('d', 2), ('d', 3)], )
对于一个层次化索引的对象,可以使用所谓的部分索引,使用它选取数据子集的操作更简单:
print(data['b'])
1 0.543979 3 -0.454024 dtype: float64
print(data['b':'c'])
b 1 0.543979 3 -0.454024 c 1 -0.764155 2 -1.453191 dtype: float64
print(data.loc[['b', 'd']])
b 1 0.543979 3 -0.454024 d 2 0.954414 3 -0.683874 dtype: float64
有时甚至还可以在“内层”中进行选取:
print(data.loc[:, 2])
a 0.359590 c 0.508768 d 1.482796 dtype: float64
层次化索引在数据重塑和基于分组的操作(如透视表生成)中扮演着重要的角色。例如,可以通过unstack方法将这段数据重新安排到一个DataFrame中:
print(data.unstack())
1 2 3 a 2.218684 -0.383126 0.020178 b -1.468355 NaN -1.042682 c -0.291976 0.658995 NaN d NaN 0.402100 1.726501
unstack的逆运算是stack:
print(data.unstack().stack())
a 1 -0.606073 2 -0.597230 3 0.117367 b 1 0.438933 3 0.577631 c 1 -0.300920 2 -0.308119 d 2 -0.005924 3 -1.015638 dtype: float64
对于一个DataFrame,每条轴都可以有分层索引:
frame = pd.DataFrame(np.arange(12).reshape((4, 3)), index=[['a', 'a', 'b', 'b'], [1, 2, 1, 2]], columns=[['Ohio', 'Ohio', 'Colorado'], ['Green', 'Red', 'Green']]) print(frame)
Ohio Colorado Green Red Green a 1 0 1 2 2 3 4 5 b 1 6 7 8 2 9 10 11
各层都可以有名字(可以是字符串,也可以是别的Python对象)。如果指定了名称,它们就会显示在控制台输出:
frame.index.names = ['key1', 'key2'] frame.columns.names = ['state', 'color'] print(frame)
state Ohio Colorado color Green Red Green key1 key2 a 1 0 1 2 2 3 4 5 b 1 6 7 8 2 9 10 11
注意:小心区分索引名state、color与行标签。
有了部分列索引,因此可以轻松选取列分组:
print(frame['Ohio'])
color Green Red key1 key2 a 1 0 1 2 3 4 b 1 6 7 2 9 10
2、重排与分级排序
有时,你需要重新调整某条轴上各级别的顺序,或根据指定级别上的值对数据进行排序。swaplevel接受两个级别编号或名称,并返回一个互换了级别的新对象(但数据不会发生变化):
print(frame.swaplevel('key1', 'key2'))
state Ohio Colorado color Green Red Green key2 key1 1 a 0 1 2 2 a 3 4 5 1 b 6 7 8 2 b 9 10 11
而sort_index则根据单个级别中的值对数据进行排序。交换级别时,常常也会用到sort_index,这样最终结果就是按照指定顺序进行字母排序了:
print(frame.sort_index(level=1))
state Ohio Colorado color Green Red Green key1 key2 a 1 0 1 2 b 1 6 7 8 a 2 3 4 5 b 2 9 10 11
print(frame.swaplevel(0, 1).sort_index(level=0))
state Ohio Colorado color Green Red Green key2 key1 1 a 0 1 2 b 6 7 8 2 a 3 4 5 b 9 10 11
3、根据级别汇总统计
许多对DataFrame和Series的描述和汇总统计都有一个level选项,它用于指定在某条轴上求和的级别。再以上面那个DataFrame为例,我们可以根据行或列上的级别来进行求和:
print(frame.sum(level='key2'))
state Ohio Colorado color Green Red Green key2 1 6 8 10 2 12 14 16
print(frame.sum(level='color', axis=1))
color Green Red key1 key2 a 1 2 1 2 8 4 b 1 14 7 2 20 10
这其实是利用了pandas的groupy功能。
4、使用DataFrame的列进行索引
人们经常想要将DataFrame的一个或多个列当做行索引来用,或者可能希望将行索引变成DataFrame的列。以下面这个DataFrame为例:
frame = pd.DataFrame({'a': range(7), 'b': range(7, 0, -1), 'c': ['one', 'one', 'one', 'two', 'two', 'two', 'two'], 'd': [0, 1, 2, 0, 1, 2, 3]}) print(frame)
a b c d 0 0 7 one 0 1 1 6 one 1 2 2 5 one 2 3 3 4 two 0 4 4 3 two 1 5 5 2 two 2 6 6 1 two 3
DataFrame的set_index函数会将其一个或多个列转换为行索引,并创建一个新的DataFrame:
frame2 = frame.set_index(['c', 'd']) print(frame2)
a b c d one 0 0 7 1 1 6 2 2 5 two 0 3 4 1 4 3 2 5 2 3 6 1
默认情况下,那些列会从DataFrame中移除,但也可以将其保留下来:
print(frame.set_index(['c', 'd'], drop=False))
a b c d c d one 0 0 7 one 0 1 1 6 one 1 2 2 5 one 2 two 0 3 4 two 0 1 4 3 two 1 2 5 2 two 2 3 6 1 two 3
reset_index的功能跟set_index刚好相反,层次化索引的级别会被转移到列里面:
print(frame2.reset_index())
c d a b 0 one 0 0 7 1 one 1 1 6 2 one 2 2 5 3 two 0 3 4 4 two 1 4 3 5 two 2 5 2 6 two 3 6 1
5、合并数据集-数据库风格的DataFrame合并
pandas对象中的数据可以通过一些方式进行合并:
- pandas.merge可根据一个或多个键将不同DataFrame中的行连接起来。SQL或其他关系型数据库的用户对此应该回比较熟悉,因为它实现的就是数据库的join操作。
- pandas.concat可以沿着一条轴将多个对象叠到一起。
- 实例方法combine_first可以将重复数据编接在一起,用一个对象中的值填充另一个对象中的缺失值。
数据集的合并(merge)或连接(join)运算是通过一个或多个键将行衔接起来的。这些运算是关系型数据库的核心。pandas的merge函数是对数据应用这些算法的主要切入点:
df1 = pd.DataFrame({'key': ['b', 'b', 'a', 'c', 'a', 'a', 'b'], 'data1': range(7)}) df2 = pd.DataFrame({'key': ['a', 'b', 'd'], 'data2': range(3)}) print(df1) print(df2)
key data1 0 b 0 1 b 1 2 a 2 3 c 3 4 a 4 5 a 5 6 b 6 key data2 0 a 0 1 b 1 2 d 2
这是一种多对一的合并。df1中的数据有多个被标记为a和b的行,而df2中key列的每个值仅对应一行。对这些对象调用merge即可得到:
print(pd.merge(df1, df2))
key data1 data2 0 b 0 1 1 b 1 1 2 b 6 1 3 a 2 0 4 a 4 0 5 a 5 0
注意,我并没有指明要用哪个列进行连接。如果没有指定,merge就会将重叠列的列名当做键。不过,最好明确指定一下:
print(pd.merge(df1, df2, on='key'))
key data1 data2 0 b 0 1 1 b 1 1 2 b 6 1 3 a 2 0 4 a 4 0 5 a 5 0
如果两个对象的列名不同,也可以分别进行指定:
print(pd.merge(df3, df4, left_on='lkey', right_on='rkey'))
lkey data1 rkey data2 0 b 0 b 1 1 b 1 b 1 2 b 6 b 1 3 a 2 a 0 4 a 4 a 0 5 a 5 a 0
可能你已经注意到了,结果里面c和d以及与之相关的数据消失了。默认情况下,merge做的是“内连接”;结果中的键是交集。其他方式还有“left”、“right”以及“outer”。外连接求取的是键的并集,组合了左连接和右连接的效果:
print(pd.merge(df1, df2, how='outer'))
key data1 data2 0 b 0.0 1.0 1 b 1.0 1.0 2 b 6.0 1.0 3 a 2.0 0.0 4 a 4.0 0.0 5 a 5.0 0.0 6 c 3.0 NaN 7 d NaN 2.0
如下表对这些选项进行了总结:
选项 | 说明 |
inner | 使用两个表都有的键 |
left | 使用左表中所有的键 |
right | 使用右表中所有的键 |
outer | 使用两个表中所有的键 |
多对多的合并有些不直观。看下面的栗子:
df1 = pd.DataFrame({'key': ['b', 'b', 'a', 'c', 'a', 'b'], 'data1': range(6)}) print(df1)
key data1 0 b 0 1 b 1 2 a 2 3 c 3 4 a 4 5 b 5
df2 = pd.DataFrame({'key': ['a', 'b', 'a', 'b', 'd'], 'data2': range(5)}) print(df2)
key data2 0 a 0 1 b 1 2 a 2 3 b 3 4 d 4
print(pd.merge(df1, df2, on='key', how='left'))
key data1 data2 0 b 0 1.0 1 b 0 3.0 2 b 1 1.0 3 b 1 3.0 4 a 2 0.0 5 a 2 2.0 6 c 3 NaN 7 a 4 0.0 8 a 4 2.0 9 b 5 1.0 10 b 5 3.0
多对多连接产生的是行的笛卡尔积。由于左边的DataFrame有3个“b”行,右边的有2个,所以最终结果中就有6个“b”行。连接方式只影响出现在结果中的不同的键的值:
print(pd.merge(df1, df2, how='inner'))
key data1 data2 0 b 0 1 1 b 0 3 2 b 1 1 3 b 1 3 4 b 5 1 5 b 5 3 6 a 2 0 7 a 2 2 8 a 4 0 9 a 4 2
要根据多个键进行合并,传入一个由列名组成的列表即可:
print(pd.merge(left, right, on=['key1', 'key2'], how='outer'))
key1 key2 lval rval 0 foo one 1.0 4.0 1 foo one 1.0 5.0 2 foo two 2.0 NaN 3 bar one 3.0 6.0 4 bar two NaN 7.0
结果中会出现哪些键组合取决于所选的合并方式,你可以这样来理解:多个键形成一系列元组,并将其当做单个连接键。
注意:在进行列-列连接时,DataFrame对象中的索引会被丢弃。
对于合并运算需要考虑的最后一个问题是对重复列名的处理。虽然你可以手工处理列名重叠的问题,但merge有一个更实用的suffixes选项,用于指定附加到左右两个DataFrame对象的重叠列名上的字符串:
print(pd.merge(left, right, on='key1', suffixes=('_left', '_right')))
key1 key2_left lval key2_right rval 0 foo one 1 one 4 1 foo one 1 one 5 2 foo two 2 one 4 3 foo two 2 one 5 4 bar one 3 one 6 5 bar one 3 two 7
如下表是merge函数的参数:
参数 | 说明 |
left | 参与合并的左侧DataFrame |
right | 参与合并的右侧DataFrame |
how | "inner"、"outer"、"left"、"right"其中之一。默认为"inner" |
on | 用于连接的列名。必须存在于左右两个DataFrame对象中。如果未指定,且其他连接键也未指定,则以left和right列名的交集作为连接集 |
left_on | 左侧DataFrame中用作连接键的列 |
right_on | 右侧DataFrame中用作连接键的列 |
left_index | 将左侧的行索引用作其连接键 |
right_index | 类似于left_index |
sort | 根据连接键对合并后的数据进行排序,默认为True。有时在处理大数据集时,禁用该选项可获得更好的性能 |
suffixes | 字符串值元组,用于追加到重叠名的末尾,默认为('_x','_y')。 |
copy | 设置为False,可以在某些特殊情况下避免将数据复制到结果数据结构中。默认总是复制 |
indicator添加特殊的列_merge,它可以指明每个行的来源,它的值有left_only、right_only或both,根据每行的合并数据的来源。
6、索引上的合并
有时候,DataFrame中的连接键位于其索引中。在这种情况下,你可以传入left_index=True或right_index= True(或两个都传)以说明索引应该被用作连接键:
left1 = pd.DataFrame({'key': ['a', 'b', 'a', 'a', 'b', 'c'], 'value': range(6)}) print(left1)
key value 0 a 0 1 b 1 2 a 2 3 a 3 4 b 4 5 c 5
right1 = pd.DataFrame({'group_val': [3.5, 7]}, index=['a', 'b']) print(right1)
group_val a 3.5 b 7.0
print(pd.merge(left1, right1, left_on='key', right_index=True))
key value group_val 0 a 0 3.5 2 a 2 3.5 3 a 3 3.5 1 b 1 7.0 4 b 4 7.0
由于默认的merge方法是求取连接键的交集,因此你可以通过外连接的方式得到它们的并集:
print(pd.merge(left1, right1, left_on='key', right_index=True, how='outer'))
key value group_val 0 a 0 3.5 2 a 2 3.5 3 a 3 3.5 1 b 1 7.0 4 b 4 7.0 5 c 5 NaN
对于层次化索引的数据,事情就有点复杂了,因为索引的合并默认是多键合并:
lefth = pd.DataFrame({'key1': ['Ohio', 'Ohio', 'Ohio', 'Nevada', 'Nevada'], 'key2': [2000, 2001, 2002, 2001, 2002], 'data': np.arange(5.)}) print(lefth)
key1 key2 data 0 Ohio 2000 0.0 1 Ohio 2001 1.0 2 Ohio 2002 2.0 3 Nevada 2001 3.0 4 Nevada 2002 4.0
righth = pd.DataFrame(np.arange(12).reshape((6, 2)), index=[['Nevada', 'Nevada', 'Ohio', 'Ohio', 'Ohio', 'Ohio'], [2001, 2000, 2000, 2000, 2001, 2002]],
columns=['event1', 'event2']) print(righth)
event1 event2 Nevada 2001 0 1 2000 2 3 Ohio 2000 4 5 2000 6 7 2001 8 9 2002 10 11
这种情况下,你必须以列表的形式指明用作合并键的多个列(注意用how='outer'对重复索引值的处理):
print(pd.merge(lefth, righth, left_on=['key1', 'key2'], right_index=True))
key1 key2 data event1 event2 0 Ohio 2000 0.0 4 5 0 Ohio 2000 0.0 6 7 1 Ohio 2001 1.0 8 9 2 Ohio 2002 2.0 10 11 3 Nevada 2001 3.0 0 1
print(pd.merge(lefth, righth, left_on=['key1', 'key2'], right_index=True, how='outer'))
key1 key2 data event1 event2 0 Ohio 2000 0.0 4.0 5.0 0 Ohio 2000 0.0 6.0 7.0 1 Ohio 2001 1.0 8.0 9.0 2 Ohio 2002 2.0 10.0 11.0 3 Nevada 2001 3.0 0.0 1.0 4 Nevada 2002 4.0 NaN NaN 4 Nevada 2000 NaN 2.0 3.0
同时使用合并双方的索引也没问题:
left2 = pd.DataFrame([[1., 2.], [3., 4.], [5., 6.]], index=['a', 'c', 'e'], columns=['Ohio', 'Nevada']) right2 = pd.DataFrame([[7., 8.], [9., 10.], [11., 12.], [13., 14.]], index=['b', 'c', 'd', 'e'], columns=['Missouri', 'Alabama']) print(left2) print(right2)
Ohio Nevada a 1.0 2.0 c 3.0 4.0 e 5.0 6.0 Missouri Alabama b 7.0 8.0 c 9.0 10.0 d 11.0 12.0 e 13.0 14.0
DataFrame还有一个便捷的join实例方法,它能更方便地实现按索引合并。它还可用于合并多个带有相同或相似索引的DataFrame对象,但要求没有重叠的列。在上面那个例子中,我们可以编写:
print(left2.join(right2, how='outer'))
Ohio Nevada Missouri Alabama a 1.0 2.0 NaN NaN b NaN NaN 7.0 8.0 c 3.0 4.0 9.0 10.0 d NaN NaN 11.0 12.0 e 5.0 6.0 13.0 14.0
因为一些历史版本的遗留原因,DataFrame的join方法默认使用的是左连接,保留左边表的行索引。它还支持在调用的DataFrame的列上,连接传递的DataFrame索引:
print(left1.join(right1, on='key'))
key value group_val 0 a 0 3.5 1 b 1 7.0 2 a 2 3.5 3 a 3 3.5 4 b 4 7.0 5 c 5 NaN
最后,对于简单的索引合并,你还可以向join传入一组DataFrame,下一节会介绍更为通用的concat函数,也能实现此功能:
print(left2.join([right2, another]))
Ohio Nevada Missouri Alabama New York Oregon a 1.0 2.0 NaN NaN 7.0 8.0 c 3.0 4.0 9.0 10.0 9.0 10.0 e 5.0 6.0 13.0 14.0 11.0 12.0
print(left2.join([right2, another], how='outer'))
Ohio Nevada Missouri Alabama New York Oregon a 1.0 2.0 NaN NaN 7.0 8.0 c 3.0 4.0 9.0 10.0 9.0 10.0 e 5.0 6.0 13.0 14.0 11.0 12.0 b NaN NaN 7.0 8.0 NaN NaN d NaN NaN 11.0 12.0 NaN NaN f NaN NaN NaN NaN 16.0 17.0
7、轴向连接
另一种数据合并运算也被称作连接(concatenation)、绑定(binding)或堆叠(stacking)。Numpy的concatenation函数可以用NumPy数组来做:
arr = np.arange(12).reshape((3, 4)) print(arr)
[[ 0 1 2 3] [ 4 5 6 7] [ 8 9 10 11]]
print(np.concatenate([arr, arr], axis=1))
[[ 0 1 2 3 0 1 2 3] [ 4 5 6 7 4 5 6 7] [ 8 9 10 11 8 9 10 11]]
对于pandas对象(如Series和DataFrame),带有标签的轴使你能够进一步推广数组的连接运算。具体点说,你还需要考虑以下这些东西:
- 如果对象在其他轴上的索引不同,我们应该合并这些轴的不同元素还是只使用交集?
- 连接的数据集是否需要在结果对象中可识别?
- 连接轴中保存的数据是否需要保留?许多情况下,DataFrame默认的整数标签最好在连接时删掉。
pandas的concat函数提供了一种能够解决这些问题的可靠方式。将给出一些例子来讲解其使用方式。假设有三个没有重叠索引的Series:
s1 = pd.Series([0, 1], index=['a', 'b']) s2 = pd.Series([2, 3, 4], index=['c', 'd', 'e']) s3 = pd.Series([5, 6], index=['f', 'g']) print(pd.concat([s1, s2, s3]))
a 0 b 1 c 2 d 3 e 4 f 5 g 6 dtype: int64
默认情况下,concat是在axis=0上工作的,最终产生一个新的Series。如果传入axis=1,则结果就会变成一个DataFrame:
print(pd.concat([s1, s2, s3], axis=1, sort=True))
0 1 2 a 0.0 NaN NaN b 1.0 NaN NaN c NaN 2.0 NaN d NaN 3.0 NaN e NaN 4.0 NaN f NaN NaN 5.0 g NaN NaN 6.0
这种情况下,另外的轴上没有重叠,从索引的有序并集(外连接)上就可以看出来。传入join='inner'即可得到它们的交集:
s4 = pd.concat([s1, s3]) print(s4)
a 0 b 1 f 5 g 6 dtype: int64
print(pd.concat([s1, s4], axis=1, sort=True))
0 1 a 0.0 0 b 1.0 1 f NaN 5 g NaN 6
print(pd.concat([s1, s4], axis=1, sort=True, join='inner'))
0 1 a 0 0 b 1 1
在这个栗子中,f和g标签消失了,是因为使用的是join='inner'选项。
也可以通过join_axes指定要在其他轴上使用的索引:
print(pd.concat([s1, s4], axis=1, join_axes=[['a', 'c', 'b', 'e']]))
0 1 a 0.0 0.0 c NaN NaN b 1.0 1.0 e NaN NaN
不过有个问题,参与连接的片段在结果中区分不开。假设你想要在连接轴上创建一个层次化索引。使用keys参数即可达到这个目的:
result = pd.concat([s1, s2, s3], keys=['one', 'two', 'three']) print(result)
one a 0 b 1 two c 2 d 3 e 4 three f 5 g 6 dtype: int64
print(result.unstack())
a b c d e f g one 0.0 1.0 NaN NaN NaN NaN NaN two NaN NaN 2.0 3.0 4.0 NaN NaN three NaN NaN NaN NaN NaN 5.0 6.0
如果沿着axis=1对Series进行合并,则keys就会变成DataFrame的列头:
print(pd.concat([s1, s2, s3], axis=1, keys=['one', 'two', 'three'], sort=False))
one two three a 0.0 NaN NaN b 1.0 NaN NaN c NaN 2.0 NaN d NaN 3.0 NaN e NaN 4.0 NaN f NaN NaN 5.0 g NaN NaN 6.0
同样的逻辑也适用于DataFrame对象:
df1 = pd.DataFrame(np.arange(6).reshape(3, 2), index=['a', 'b', 'c'], columns=['one', 'two']) df2 = pd.DataFrame(5+np.arange(4).reshape((2, 2)), index=['a', 'c'], columns=['three', 'four']) print(df1) print(df2)
one two a 0 1 b 2 3 c 4 5 three four a 5 6 c 7 8
print(pd.concat([df1, df2], axis=1, keys=['level1', 'level2'], sort=False))
level1 level2 one two three four a 0 1 5.0 6.0 b 2 3 NaN NaN c 4 5 7.0 8.0
如果传入的不是列表而是一个字典,则字典的键就会被当做keys选项的值:
print(pd.concat({'level1': df1, 'level2': df2}, axis=1, sort=False))
level1 level2 one two three four a 0 1 5.0 6.0 b 2 3 NaN NaN c 4 5 7.0 8.0
此外还有两个用于管理层次化索引创建方式的参数。举个栗子,我们可以用names参数命名创建的轴级别:
print(pd.concat([df1, df2], axis=1, keys=['level1', 'level2'], sort=False, names=['upper', 'lower']))
upper level1 level2 lower one two three four a 0 1 5.0 6.0 b 2 3 NaN NaN c 4 5 7.0 8.0
最后一个关于DataFrame的问题是,DataFrame的行索引不包含任何相关数据:
df1 = pd.DataFrame(np.random.randn(3, 4), columns=['a', 'b', 'c', 'd']) df2 = pd.DataFrame(np.random.randn(2, 3), columns=['b', 'd', 'a']) print(df1) print(df2)
a b c d 0 -0.285165 1.850042 -0.313016 0.405468 1 0.248911 -1.143353 1.629733 0.065551 2 1.219122 -0.761709 1.458502 -0.459100 b d a 0 0.186271 -1.150992 1.228888 1 -0.827791 0.302782 -0.939113
在这种情况下,传入ignore_index=True即可:
print(pd.concat([df1, df2], ignore_index=True, sort=False))
a b c d 0 -0.285165 1.850042 -0.313016 0.405468 1 0.248911 -1.143353 1.629733 0.065551 2 1.219122 -0.761709 1.458502 -0.459100 3 1.228888 0.186271 NaN -1.150992 4 -0.939113 -0.827791 NaN 0.302782
参数对应表:
参数 | 说明 |
objs | 参与连接的pandas对象的列表或字典。唯一必须的参数 |
axis | 指明连接的轴向,默认为0 |
join | "inner"、"outer"其中之一,默认为"outer"。指明其他轴向上的索引是按交集(inner)还是并集(outer)进行合并 |
join_axes | 指明用于其他n-1条轴的索引,不执行并集/交集运算 |
keys | 与连接对象有关的值,用于形成连接轴向上的层次化索引。可以是任意值的列表或数组、元组数组、数组列表 |
levels | 指定用作层次化索引各级别上的索引,如果设置了keys的话 |
names | 用于创建分层级别的名称,如果设置了keys和levels的话 |
verify_integrity | 检查结果对象轴上的重复情况,如果发现则引发异常。默认(False)允许重复 |
ignore_index | 不保留连接轴上的索引,产生一组新索引range(total_length) |
8、合并重叠数据
还有一种数据组合问题不能用简单的合并(merge)或连接(concatenation)运算来处理。比如说,你可能有索引全部或部分重叠的两个数据集。举个栗子,我们使用NumPy的where函数,它表示一种等价于面向数组的if-else:
a = pd.Series([np.nan, 2.5, np.nan, 3.5, 4.5, np.nan], index=['f', 'e', 'd', 'c', 'b', 'a']) b = pd.Series(np.arange(len(a), dtype=np.float64), index=['f', 'e', 'd', 'c', 'b', 'a']) b[-1] = np.nan print(a) print(b)
f NaN e 2.5 d NaN c 3.5 b 4.5 a NaN dtype: float64 f 0.0 e 1.0 d 2.0 c 3.0 b 4.0 a NaN dtype: float64
print(np.where(pd.isnull(a), b, a))
[0. 2.5 2. 3.5 4.5 nan]
这里需要说明的一个函数是np.where(condition, a, b)意思是当调教成立的时候取值为a,否则取值为b!
Series有一个combine_first方法,实现的也是一样的功能,还带有pandas的数据对齐:
print(b[:-2].combine_first(a[2:]))
a NaN b 4.5 c 3.0 d 2.0 e 1.0 f 0.0 dtype: float64
对于DataFrame,combine_first自然也会在列上做同样的事情,因此你可以将其看做:用传递对象中的数据为调用对象的缺失数据“打补丁”:
df1 = pd.DataFrame({'a': [1., np.nan, 5., np.nan], 'b': [np.nan, 2., np.nan, 6.], 'c': range(2, 18, 4)}) df2 = pd.DataFrame({'a': [5., 4., np.nan, 3., 7.], 'b': [np.nan, 3., 4., 6., 8.]}) print(df1) print(df2)
a b c 0 1.0 NaN 2 1 NaN 2.0 6 2 5.0 NaN 10 3 NaN 6.0 14 a b 0 5.0 NaN 1 4.0 3.0 2 NaN 4.0 3 3.0 6.0 4 7.0 8.0
print(df1.combine_first(df2))
a b c 0 1.0 NaN 2.0 1 4.0 2.0 6.0 2 5.0 4.0 10.0 3 3.0 6.0 14.0 4 7.0 8.0 NaN
9、重塑层次化索引
有许多用于重新排列表格型数据的基础运算。这些函数也称作为重塑(reshape)或轴向旋转(pivot)运算。
层次化索引为DataFrame数据的重排任务提供了一种具有良好一致性的方式。主要功能有二:
- stack:将数据的列“旋转”为行;
- unstack:将数据的行“旋转”为列。
如下将通过一系列的范例来讲解这些操作。接下来看一个简单的DataFrame,其中的行列索引均为字符串数组:
data = pd.DataFrame(np.arange(6).reshape(2, 3), index=pd.Index(['Ohio', 'Colorado'], name='state'), columns=pd.Index(['one', 'two', 'three'], name='number')) print(data)
number one two three state Ohio 0 1 2 Colorado 3 4 5
对该数据使用stack方法即可将列转换为行,得到一个Series:
result = data.stack() print(result)
state number Ohio one 0 two 1 three 2 Colorado one 3 two 4 three 5 dtype: int32
对于一个层次化索引的Series,你可以用unstack将其重排为一个DataFrame:
print(result.unstack())
number one two three state Ohio 0 1 2 Colorado 3 4 5
默认情况下,unstack操作的是最内层(stack也是如此)。传入分层级别的编号或名称即可对其它级别进行unstack操作:
print(result.unstack(0))
state Ohio Colorado number one 0 3 two 1 4 three 2 5
print(result.unstack('state'))
state Ohio Colorado number one 0 3 two 1 4 three 2 5
如果不是所有的级别值都能在各分组中找到的话,则unstack操作可能会引入缺失数据:
s1 = pd.Series([0, 1, 2, 3], index=['a', 'b', 'c', 'd']) s2 = pd.Series([4, 5, 6], index=['c', 'd', 'e']) data2 = pd.concat([s1, s2], keys=['one', 'two']) print(data2)
one a 0 b 1 c 2 d 3 two c 4 d 5 e 6 dtype: int64
print(data2.unstack())
a b c d e one 0.0 1.0 2.0 3.0 NaN two NaN NaN 4.0 5.0 6.0
stack默认会滤除缺失数据,因此该运算是可逆的:
print(data2.unstack().stack())
one a 0.0 b 1.0 c 2.0 d 3.0 two c 4.0 d 5.0 e 6.0 dtype: float64
print(data2.unstack().stack(dropna=False))
one a 0.0 b 1.0 c 2.0 d 3.0 e NaN two a NaN b NaN c 4.0 d 5.0 e 6.0 dtype: float64
在对DataFrame进行unstack操作时,作为旋转轴的级别将会成为结果中的最低级别:
df = pd.DataFrame({'left': result, 'right': result + 5}, columns=pd.Index(['left', 'right'], name='side')) print(df)
side left right state number Ohio one 0 5 two 1 6 three 2 7 Colorado one 3 8 two 4 9 three 5 10
print(df.unstack())
side left right number one two three one two three state Ohio 0 1 2 5 6 7 Colorado 3 4 5 8 9 10
当调用stack,我们可以指明轴的名字:
print(df.unstack('state').stack('side'))
state Colorado Ohio number side one left 3 0 right 8 5 two left 4 1 right 9 6 three left 5 2 right 10 7
10、将“宽格式”旋转为“长格式”
旋转DataFrame的逆运算是pandas.melt。它不是将一列转换到多个新的DataFrame,而是合并多个列成为一个,产生一个比输入长的DataFrame。看一个栗子:
df = pd.DataFrame({'key': ['foo', 'bar', 'baz'], 'A': [1, 2, 3], 'B': [4, 5, 6], 'C': [7, 8, 9]}) print(df)
key A B C 0 foo 1 4 7 1 bar 2 5 8 2 baz 3 6 9
key列可能是分组指标,其它的列是数据值。当使用pandas.melt,我们必须指明哪些列是分组指标。下面使用key作为唯一的分组指标:
print(pd.melt(df, ['key']))
key variable value 0 foo A 1 1 bar A 2 2 baz A 3 3 foo B 4 4 bar B 5 5 baz B 6 6 foo C 7 7 bar C 8 8 baz C 9
使用pivot,可以重塑回原来的样子:
reshaped = melted.pivot('key', 'variable', 'value')
print(reshaped)
variable A B C key bar 2 5 8 baz 3 6 9 foo 1 4 7
因为pivot的结果从列创建了一个索引,用作行的标签,我们可以使用reset_index将数据移回列:
print(reshaped.reset_index())
variable key A B C 0 bar 2 5 8 1 baz 3 6 9 2 foo 1 4 7
你还可以指定列的子集,作为值的列:
print(pd.melt(df, id_vars=['key'], value_vars=['A', 'B']))
key variable value 0 foo A 1 1 bar A 2 2 baz A 3 3 foo B 4 4 bar B 5 5 baz B 6
pandas.melt也可以不用分组指标:
print(pd.melt(df, value_vars=['A', 'B', 'C']))
variable value 0 A 1 1 A 2 2 A 3 3 B 4 4 B 5 5 B 6 6 C 7 7 C 8 8 C 9