位点特异性重组 和 DNA转座
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教材 Molecular biology of the gene 7th edition J.D. Watson et. al
很多重要DNA重排是由两类重要遗传重组造成的
- 保守位点特异性重组CSSR
- 两端特定序列之间
- 需要重组酶
- 形成联会复合体
- 转座重组 transpositional recombination
- 不一定特定
一、保守性位点特异性重组
1、CSSR的三种类型
- 不同分子间的重组造成插入
- 同分子，通向位点间的重组造成缺失
- 同分子，反向位点间的重组造成颠倒
2、位点特异性重组酶通过一个蛋白质-DNA的共价中间体对DNA进行切割并重新连接
特异性重组酶的两个家族
- 丝氨酸重组酶
- 酪氨酸（tyr）重组酶
3、位点特异性重组的生物学作用
- 1、λ整合酶催化病毒基因在宿主细胞染色体上整合切除
- 2、Hin重组酶颠倒一段DNA片段，特定基因开始表达
- 3、重组酶将多聚环状DNA变成单体
二、转座
- 转座相关序列可以占据物种基因组很大部分
- 分为有发生复制的移位 和 不发生复制的移位
1、三类基本转座子
- DNA转座子
- 类病毒反转录转座子
- 多聚腺苷酸反转录转座子
2、转座子包括自主转座子和非自主转座子
- 自主转座子有反向重复序列和转座酶基因
- 类病毒反转录转座子还带有 逆转录酶
- 非自主转座子只有反向重复序列
3、像基因的 聚腺苷反转录转座子
- 没有末端重复序列：
- ORF1 ORF2 编码反转录酶，核酸内切酶复合体
4、 DNA转座的剪切-粘贴 机制
4、DNA转座中，断裂转移链的多种机制
- TnsA酶切
- 自攻击
5、DNA复制性转座
6、类病毒反转录转座子 和 反转录病毒 通过一个RNA中间体实现转座
7、聚腺苷反转录转座子通过靶位点引导反转录转座
8、转座子及其调控的实例
①对拷贝数的限制
- 当转座酶Tn10的 mRNA转录过多，会和反向DNA配对抑制
- 转座酶mRNA 少时，不会配对，高效翻译蛋白
②靶位点免疫：避免转座到转座子自身上
③小而富含基因的基因组 会有位点偏好性转座
- 避免插入到重要区域
④LINE因子可以促进自身（poly-A转座子）转座，还能转座细胞mRNA
- 转座的mRNA在基因组形成加工后的假基因
三、V (D) J 重组
- 编码抗体的基因通过重组，表达各种各样的抗体蛋白
复习题：
- CSSR 与转座的区别
- CSSR的三种类型
- CSSR酶的两个家族，作用特点
- 转座的三类基本子，结构特点
- polyA转座子的结构特点
- 自主转座子与非自主转座子的区别
- DNA转座的剪切-粘贴机制
- 转移时，单链切割后，断裂剩下的单链的三种机制
- DNA复制性转座的过程
- 类病毒反转录转座子的转座过程
- polyA转座子的过程
- 转座子对拷贝数的限制的调控
- 靶位点免疫调控
- V(D) J 重组的机制