解决：上网查了相关资料，说是需要重新烧录固件
方法：1.去ATMEL官网下载AT91-ISP下载软件AT91-ISP V1.13.exe，安装AT91-ISP V1.13.exe（默认设置），并在网上下载
J-Link V8.bin文件
2.打开J-Link仿真器，找到三对跳线的地方，旁边分别标有ERASE、JTAGSEL、TST
3.用USB线将J-Link与PC相连，然后短接标号为ERASE的这对跳线，时间1分钟以上！
4.断开这对跳线，再断开USB线缆
5.短接标号为TST的这对跳线，然后再连接USB线缆，1分钟以上后断开USB线缆，再断开这对跳线
6.打开刚刚安装好的AT91-ISP软件（SAM-PROG v2.4），点击Browse选择J-Link V8.bin文件，并勾选文件加密选项Set Security
7.此时连接USB线缆，windows就会发现新硬件，提示你装驱动，选择自动安装就可以了。（如果不安装驱动，下面更新固件第2步可能会出现Write Flash一直未无效的问题。这时AT91-ISP软件界面的Write Flash选项有效，点击该按钮烧录软件
8.待烧录完成后，烧录软件界面的Active Connection 后面的参数会变为1（也有可能不变成1）大概1分钟左右
9.烧录完成，断开USB线缆 仿真器复活了。EXIT退出烧写程序。现在你发现Jlink的指示灯现在变成红色，没有关系。重新连接Jlink指示灯绿色闪烁后常绿就可以用了
注：我用的J-Link里面的主控器型号是AT91SAM7S64