由于个人dreamhost即将到期问题，购买了一台VPS。
配置了一个CentOS 6.4 Linux 服务器，用Nginx+php-fpm搭建的环境。
这些都是废话，下面是重点：
当搭建后配置phpmyadmin4.0.4.1后，打开页面发现只有一个Logo，没有语言选择和登录框，尝试了很多方法，一开始以为是环境没搭建好，但是测试一切感觉正常。
实在没办法，开始考虑是否是代码有问题，然后查看源代码发现也没问题，但是在Chrome浏览时候调试器有报错，情况大概是js脚本载入不完全，
然后我开始分析js的载入机制。原来phpmyadmin载入脚本实际是调用了一个php去载入，给php传递需要载入的脚本名称，php进行拼合输出。
这时候开窍了，我将完整地址输入，将文件保存出来，发现文件大小刚好是128K，让我想到了可能是缓存问题。然后寻找nginx配置文件发现以下代码：
fastcgi_buffer_size 64k; fastcgi_buffers 4 64k; fastcgi_busy_buffers_size 128k; fastcgi_temp_file_write_size 128k;
修改后重启nginx，打开phpmyadmin，一切OK
由于载入CSS的时候也用的同样模式，内部css有部分有些错乱，清理了一次缓存后重新打开一切正常。
至此，问题解决。