1、Windows下MySQL的配置文件是my.ini，一般会在安装目录的根目录。
2、Linux下MySQL的配置文件是my.cnf，一般会放在/etc/my.cnf，/etc/mysql/my.cnf。如果找不到，可以用find命令查找。
3、Linux用rpm包安装的MySQL是不会安装/etc/my.cnf文件的
至于为什么没有这个文件而MySQL却也能正常启动和作用，有两个说法：
第一种说法，my.cnf只是MySQL启动时的一个参数文件，可以没有它，这时MySQL会用内置的默认参数启动；
第二种说法，MySQL在启动时自动使用/usr/share/mysql目录下的my-medium.cnf文件，这种说法仅限于rpm包安装的MySQL。
解决方法：只需要复制一个/usr/share/mysql目录下的.cnf文件到/etc目录，并改名为my.cnf即可
第三点原文链接：http://blog.csdn.net/newb921/article/details/5178011