一、需求确定问题
小程序是可以作为服务号的辅助没错，有的品牌甚至依靠小程序提升了不少业务量。但如果盲目选择开发了一个用户不需要、使用量不够高的小程序，投入使用后，前期付出的人力物力得不到相应的回报，那就得不偿失了。
所以开发小程序时遇到的第一个难题，就是要确定需求：企业需不需要小程序、需要什么类型的小程序。小程序更适合线上线下需要紧密结合的品牌，更适合那些高频次、用完即走、功能需求不是非常复杂的品牌方，比如摩拜单车、麦当劳、肯德基、今日头条等。所以开发小程序时对小程序的定位、要求都要考虑清楚。
二、产品原生问题
小程序发布至今才半年多，虽然因为开发程序少，门槛低得到一众好评，但毕竟是初生牛犊，仍然具有或多或少的原生问题。
接口：小程序目前已经开放近 50 个入口，但其不支持朋友圈分享仍然是不少开发者与品牌方的心病。
安全：目前不少金融类小程序因为存在支付安全隐患已经被叫停，目前小程序如摩拜单车、麦当劳、星巴克等都属于快消类，既然涉及到消费，在用户资金安全这一块则需要强大的安全系统作支持。
速度：作为app瘦身版的小程序，若打开速度过慢，非常影响用户体验。
兼容性：目前通过开发工具开发的小程序并没有与手机做到所建即所得，简单讲就是开发的小程序在 IOS 和安卓上的会出现显示不同的情况。
提供的组件不完善：例如 WebView、ImageView 都不可用，通常 HTML5、IOS、安卓可以直接使用 WebView，但小程序需要通过开发者利用小程序提供的组件自行封装方可使用。
对第三方插件不友好：小程序的脚本语言仅支持原生 Javascr1pt，很多优秀的第三方框架暂时还不能使用。
这些原生问题是所有小程序都在面临的难题，但小程序的进化速度会让这些问题逐渐消失，我们可以继续保持关注。
三、开发团队问题
一般来说，一个标准的微信小程序开发团队人员构成如下：
产品经理：规划整个开发流程，安排各人员工作保证项目的正常开发；
UI 设计师：设计产品界面，对产品 UI 终效果负责；
前端工程师：在UI设计出界面图，将其以代码的形式实现；
后端工程师后端框架的搭建，和前端一前一后一起将产品的整个框架搭建出来；
测试人员：负责产品的全面测试，找出系统不合理的地方以及 bug 。
四、开发成本问题
客观来说，上线君认为小程序的开发成本包含时间成本与人力成本两大部分。
时间成本：
正常来说一个小程序项目开始开发到后上线所需时间是 20 天，这个时间受团队成员技术水平的影响，如果是经验不足的团队那么这个开发周期也会大大拉长，如果是刚刚组建的团队那么前期磨合也需要一定的时间，这也会大大影响到项目的开发进度。
人力成本：
对于普通中小企业来说，要自己组建一支小程序开发团队无论从时间成本还是人力成本来看，都是一桩不太划算的投入。随着品牌方对于小程序开发的需求量的与日俱增，市场上涌现出一大批优秀的开发团队或者企业。
五、小程序推广问题
小程序上线后，要面临的第一个问题就是推广。小程序中推广上主要有四个难点： 无粉丝、无文章推送、无小程序商店、无朋友圈分享功能。它没有自我展示与推广的平台，也无法通过朋友圈分享传播。
所以品牌方若想推广自己的小程序，则需要借助广撒小程序码，服务号引导、文章推送广告来实现。
六、监测问题
由于没有粉丝，无法转发朋友圈等种种限制，小程序的监测看上去有些难。但是目前微信提供了基础统计功能“小程序助手”，可以实时监测到小程序的各项指标，方便运营与开发人员作出相应的调整与提升。
综上所述，虽然小程序目前存在一些问题，但它正是开启互联网下一个时代的起点，而且它正在迅速完善自己。在大众越来越注重体验的今天，如何用好小程序，是每一个品牌都需要认真对待的。