• 常用网站总结


    肿瘤研究领域最常用的数据库资源

      1、COSMIC:

        https://cancer.sanger.ac.uk/cosmic/browse/tissue?hn=carcinoma&in=t&sn=thyroid&ss=all

        主要记录与人类各种类型癌症相关的体细胞突变信息,这个数据库对于突变位点的信息记  录较为详细,包括文献出处、样品名称、组织类型、涉及到的癌症种类和具体的突变内容,这个库既

        有对某一基因突变现象的综合统计,也有对针对某一肿瘤组织或癌症细胞系的所有突变信息统计。这个数据库对学术是免费的,但是商业用途需要支付一定的费用。

      此网站的使用指南:http://www.php230.com/1494108961.html

      2、ClinVar

        http://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/ 

      3、HGMD

        http://www.hgmd.cf.ac.uk/ac/index.php

        人类基因突变数据库。从1996年开始,由英国Cardiff的医学遗传研究所维护,来源主要是文献上的由遗传所引起的疾病的种系变异。两年前的版本是免费的,但是有近两年的更新的版本需要收费。

      4、OMIM

        官网链接:http://www.omim.org/

        在线人类孟德尔遗传信息,从1960年开始,由约翰霍普金斯大学医学院的研究人员维护,有2万左右的人类基因和遗传疾病的详细目录。OMIM包含了支持基因与疾病关系和疾病机理的代表性基因变异。也是免费的。

      5、The Cancer Genome Atlas (TCGA)

      官网链接:http://cancergenome.nih.gov/

      由美国国立癌症研究所和国家人类基因组研究所(National Human Genome Research Institute,NHGRI)资助,关注与癌症的发生和发展相关的分子突变图谱。

    上面几个是最常用的,其实类似的数据库还有很多,它们各有侧重,参考《肿瘤生物信息学数据库》里面的资料,以下列表你一定用得上:

    疾病致病SNP位点查找:

      1、GCBI

      2、Springer link

      3、OPENi

      4、Pubmed

      5SCI-HUB 

      6、

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