• 在笔记本电脑上搭建科学计算工作站


    本文在Creative Commons许可证下发布

    阅读须知:

    1. 本文在惠普Probook 4431S上搭建成功;
    2. 不推荐刚接触 Linux 的人使用 CentOS 发行版
    3. 本文尽量写的浅显易懂,但要求读者掌握 Linux 基础知识;
    4. 本文所有操作均在 CentOS 7 下完成,其他发行版或多或少与 CentOS 7 不同,因而仅供参考;
    5. 本文所安装的软件出于个人用于钻研量化程序及科学计算之目的,读者应自己判断,按需安装;

    安装 CentOS

    CentOS 7 的安装与其他 Linux 发行版的安装差不多,个别地方稍有不同。

    准备工作

    1. 准备材料
      • U 盘:容量 2GB 以上,用于制作 U 盘启动盘,因为在制作启动盘时会格式化 U 盘,所以 U 盘内不要包含重要资料
      • CentOS 7.2 LiveCD ISO 镜像文件
      • Universal USB installer:Windows 下的 U 盘启动盘制作工具
      • 一个已安装 Windows 的电脑:用于制作 U 盘启动盘
    2. 运行 Universal USB installer 并制作 U 盘启动盘
    3. 将 U 盘插入计算机,重启,进入 BIOS 选择从 U 盘启动,即可进入 CentOS 的 LiveCD
    4. 进入 LiveCD 后,点击桌面的 “Install to Hard Drive” 即可安装

    注:Linux 下可以通过 dd 命令制作启动盘,但由于对原理不够了解,偶尔会导致制作失败, 或制作成功后 U 盘容量有问题,还是用 Windows 下的 Universal USB installer 比较靠谱。

    安装过程

    1. 选择安装过程中使用的语言,这里应 使用英语,不要使用汉语。若安装界面使用汉语,最终安装的系统中会出现两个比较麻烦的问题:
      1. 家目录下的系统文件夹如 Downloads、Desktop 等会以中文表示,这使得在命令行 cd 变得很麻烦;
      2. 终端中某些字符用英文字体,某些字符用中文字体,效果非常差,需要自己修改终端字体方可;
    2. 选择区域和城市:Asia 和 Shanghai
    3. 键盘使用 English(US) 而不是 English(UK)
    4. Hostname 可以改也可以不改
    5. 安装的目的地,选择要使用的硬盘,在 “Other Storage Options” 处选择“I will configure partioning”,即手动分区

    分区

    CentOS7 的分区比较特别,比较合适的分区方法,如下:

    • 点击 “Click here to create them automatically”,即让安装程序帮忙分区
    • 默认的分区方案是使用 LVM,其好处在于 “当机器有多块硬盘时,在使用的时候看上去只有一块”
    • 默认的文件系统为 XFS 而不是以前常用的 EXT4;
    • 自动分区完成后,再根据自己的需求,手动修改分区细节(我自己的硬盘划分)
      • /boot :CentOS 自动分配,一定不要乱改;
      • / :根目录,合理使用并及时清理的话 15G 就够了,不过建议 30G 以上;
      • swap :与物理内存大小一致即可
      • /opt :个人习惯是将第三方软件都安装在 /opt 下,所以分了 70G
      • /home :余下的全部空间
    • 点击 “Begin to Install” 开始安装

    真正的安装

    1. 设置 root 密码
    2. 创建一般用户
    3. 等待安装完成
    4. 安装完成,重启
    5. 重启后,同意 License 即可

    对系统的若干修改

    给一般账号 root 权限

    默认情况下,一般账号是没有 root 权限的。为什么不直接用 root 账号,而是要给一般账号 root 权限呢?

    • 日常工作中使用 root 账号,是非常糟糕且危险的习惯!无论是服务器还是个人电脑都是如此。
    • 安装软件时需要 root 权限,只能 su 切换到 root 账户再安装。对于习惯使用 sudo 的人来说,还是有些麻烦。

    假设账户名为 qliang27,要授予他 root 权限,则要修改配置文件 /etc/sudoers :

    $ su

    # echo 'qliang27 ALL=(ALL) ALL'>> /etc/sudoers # 向配置文件中加入语句

    # tail -1 /etc/sudoers  # 检查一下是否正确

    qliang27 ALL=(ALL) ALL

    其中 qliang27 为当前用户名。

    添加第三方源

    CentOS 由于很追求稳定性,所以官方源中自带的软件不多,因而需要一些第三方源,比如 EPEL、ATrpms、ELRepo、Nux Dextop、RepoForge 等。根据上面提到的软件安装原则,为了尽 可能保证系统的稳定性,此处大型第三方源只添加 EPEL 源、Nux Dextop 和 ELRepo 源。

    EPEL

    EPEL 即 Extra Packages for Enterprise Linux, 为 CentOS 提供了额外的 10000 多个软件包,而且在不替换系统组件方面下了很多功夫,因而可以放心使用。

    1

    sudo yum install epel-release

    执行完该命令后,在 /etc/yum.repos.d 目录下会多一个 epel.repo 文件。

    ELRepo

    ELRepo 包含了一些硬件相关的驱动程序,比如显卡、声卡驱动:

    sudo rpm --import https://www.elrepo.org/RPM-GPG-KEY-elrepo.org

    sudo rpm -Uvh http://www.elrepo.org/elrepo-release-7.0-2.el7.elrepo.noarch.rpm

    完成该命令后,在 /etc/yum.repos.d 目录下会多一个 elrepo.repo 文件。

    安装 yum-axelget

    yum-axelget 是 EPEL 提供的一个 yum 插件。使用该插件后用 yum 安装软件时可以并行下载,大大提高了软件的下载速度,减少了下载的等待时间:

    sudo yum install yum-axelget

    安装该插件的同时会安装另一个软件 axel。axel 是一个并行下载工具,在下载 http、ftp 等简单协议的文件时非常好用。

    第一次全面更新

    在进一步操作之前,先把已经安装的软件包都升级到最新版:

    sudo yum update

    要更新的软件包有些多,可能需要一段时间。不过有了 yum-axelget 插件,速度已经快了很多啦。

    重启

    第一次全面更新完之后建议重启。

    删除多余的 kernel

    在前面的 yum update 执行之后,可能会将 kernel 也一起更新,则在启动 CentOS 时启动项中会有很多项。

    确认当前使用的 kernel 版本号:

    $ uname -r

    3.10.0-123.9.3.el7.x86_64

    查找当前系统安装的所有 kernel:

    $ rpm -qa | grep kernel | sort

    kernel-3.10.0-123.8.1.el7.x86_64

    kernel-3.10.0-123.9.2.el7.x86_64

    kernel-3.10.0-123.9.3.el7.x86_64

    kernel-devel-3.10.0-123.8.1.el7.x86_64

    kernel-devel-3.10.0-123.9.2.el7.x86_64

    kernel-devel-3.10.0-123.9.3.el7.x86_64

    kernel-headers-3.10.0-123.9.3.el7.x86_64

    kernel-tools-3.10.0-123.9.3.el7.x86_64

    kernel-tools-libs-3.10.0-123.9.3.el7.x86_64

    可以看出有三个版本的 kernel,123.8.1、123.9.2 和 123.9.3。除了最新的 kernel 外,建议多保留一个旧 kernel,以免新 kernel 出现问题时可以通过旧 kernel 进入系统。因而此处删除 123.8.1 版本的 kernel:

    sudo yum remove kernel-3.10.0-123.8.1.el7.x86_64

    sudo yum remove kernel-devel-3.10.0-123.8.1.el7.x86_64

    基础开发环境

    GCC 系列

    sudo yum install gcc                     # C 编译器

    sudo yum install gcc-c++                 # C++ 编译器

    sudo yum install gcc-gfortran            # Fortran 编译器

    sudo yum install compat-gcc-44           # 兼容 gcc 4.4

    sudo yum install compat-gcc-44-c++       # 兼容 gcc-c++ 4.4

    sudo yum install compat-gcc-44-gfortran  # 兼容 gcc-fortran 4.4

    sudo yum install compat-libf2c-34        # g77 3.4.x 兼容库

    软件开发辅助工具

    sudo yum install make

    sudo yum install gdb     # 代码调试器

    sudo yum install cmake   # Cmake

    sudo yum install git     # 版本控制

    驱动程序

    显卡驱动

    Linux 默认只使用开源的显卡驱动,就我自己的惠普Probook 4431s目前的情况来看,开源驱动的效果还是不错的,但跟官方的 闭源驱动相比还是有一定差距。

    注意:目前的显卡驱动似乎有问题,安装后终端有时会出现屏幕闪烁、一屏文字上下重复跳动的情况, 稍微有些影响用 vim 写代码。是否要安装显卡驱动自己决定。

    NTFS 驱动

    CentOS 下默认无法挂载 NTFS 格式的硬盘。需安装 nfts-3g 即可实现即插即用:

    sudo yum install ntfs-3g

    进阶开发环境

    Java 环境

    Java 的一大特色在于跨平台,安装了 Java 运行环境,即可运行 Java 程序:

    sudo yum install java                        # java 运行环境

    Clang 系列

    Clang 可以认为是 GCC 的替代品,可以用于编译 C、C++、Objective-C 和 Objective-C++。其提供了更友好的 报错信息,在有些方面比 GCC 更友好,同时其提供了一个代码静态分析器,可以用于分析代码中可能出现的 bug 和内存溢出问题。

    sudo yum install clang             # clang 编译器

    sudo yum install clang-analyzer    # clang 静态分析器

    Intel 系列

    Intel 的大部分软件都是非开源且收费的,但同时部分软件也提供了 Linux 下的非商业免费版。 比如 icc、mkl 数学库以及代码性能分析工具等。

    还有一点需要注意的是,Intel 也提供了并行相关的几个命令,比如 mpicc、mpirun。所以 openmpi、mpich 和 intel 三者,在并行时只能用其中一个。

    并行计算

    并行可以用 openmpi,也可以用 mpich,二者的功能可以认为是完全相同的。由于二者提供了几乎一样的命令, 所以二者可以同时安装,但是不可以同时处于使用状态。

    openmpi

    安装 openmpi:

    sudo yum install openmpi openmpi-devel

    安装后,二进制文件位于 /usr/lib64/openmpi/bin 下,动态库文件位于 /usr/lib64/openmpi/lib 下,因而实际使用的话还需要额外的配置,在 .bashrc 中加入如下语句:

    export PATH=/usr/lib64/openmpi/bin/:${PATH}

    module load mpi/openmpi-x86_64

    PS:要使用 module 命令需要先安装 environment-modules 包。

    mpich

    安装 mpich:

    sudo yum install mpich mpich-devel

    安装后,二进制文件位于 /usr/lib64/mpich/bin 下,动态库文件位于 /usr/lib64/mpich/lib 下, 因而实际使用的话还需要额外的配置,在 .bashrc 中加入如下语句:

    export PATH=/usr/lib64/mpich/bin/:${PATH}

    module load mpi/mpich-x86_64

    脚本语言环境

    Perl

    CentOS 7.0 自带了 Perl 5.16.3(2013 年 03 月 11 日发布),目前的最新版本为 5.20.1(2014 年 09 月 14 日发布)。

    系统自带 Perl

    系统自带 Perl,就目前来看,版本不算老,基本够用。官方源和 EPEL 源中提供了 1000 多个模块,可以直接用 yum 安装:

    sudo yum install perl-Parallel-ForkManager  # 并行模块

    若源中没有已打包好的模块,也可以使用 perl 自带的 cpan 来安装模块。

    优先级:yum > cpan。

    plenv 管理新版本

    若需要使用最新版本的 perl,可以使用 plenv 安装新版本的 perl,并使用 plenv 提供的 cpanm 命令安装模块:

    cpanm install Parallel::ForkManager # 并行模块

    Python

    CentOS 7.0 自带 Python 2.7.5,目前 Python 2 的最新版本为 2.7.8,Python 3 的最新版本为 3.4.2。

    系统自带 Python

    系统自带的 Python 2.7.5,基本已经够用,Python 2 常用的模块在官方源或 EPEL 源中也有有编译好的包, 因而直接通过 yum 安装即可:

    sudo yum install python-matplotlib  # 2D 绘图库

    sudo yum install PyQt4  # Qt4 的 Python 绑定

    sudo yum install numpy  # 数组操作库

    sudo yum install scipy  # 科学计算库

    sudo yum install python-requests  # 网页请求

    sudo yum install python-docopt  # 命令行参数分析器

    sudo yum install gdal-python    # gdal 的 Python 绑定

    pyenv 管理 Python3

    Python2 与 Python3 之间是不完全兼容的,而我以 Python3 为主,所以需要安装一个 Python3。

    首先,安装 pyenv 来管理多个 Python 版本,然后利用 pyenv 安装 anaconda3 (即 Python3.4)。anaconda 自带了众多科学计算所需的包,免去了安装的麻烦,对于其他包, 则可以利用 Python 自带的 pip 安装:

    pip install requests

    pip install docopt

    编程相关软件

    编辑器

    写代码的时候选一个好用的编辑器很重要,用的比较多的编辑器如下:

    1. vim
    2. emacs
    3. atom
    4. sublime text 3
    5. Visual Studio Code

    IDE

    日常软件

    Office 套件

    LibreOffice

    大多数 Linux 发行版都自带 LibreOffice:

    sudo yum install libreoffice

    LibreOffice 与 Microsoft Office 的兼容性不太好,操作界面与 MS Office 也有较大差异,让人不太习惯。

    WPS Office

    若在 Linux 下对于文档处理有更高一些的要求,可以尝试目前还处于测试版的 WPS Office for Linux。 WPS Office 的兼容性以及界面都比 LibreOffice 要好很多,值得期待,当然还是不能做到完全兼容 MS Office。

    PS/PDF 阅读器

    系统自带的 evince 阅读器,可以打开 PS 和 PDF 文件,基本足够日常的使用了。

    zathura

    zathura 可以查看 PS、PDF、djvu 格式的文件,可以作为 evince 的替代品:

    sudo yum install zathura zathura-plugins-all

    ghostscript

    sudo yum install ghostscript

    master-pdf-editor

    官方网站: https://code-industry.net/free-pdf-editor/

    sudo yum localinstall http://get.code-industry.net/public/master-pdf-editor3-3.2.62-1.x86_64.rpm

    TeX Live 2015

    系统是自带了 TeXLive,版本较老,还是安装最新版比较好。

    Mendeley

    Mendeley 是一个跨平台的文献管理软件,其内部自带了一个可以添加注释的 PDF 阅读器。

    下载 Generic Linux (64 bits):http://www.mendeley.com/download-mendeley-desktop

    安装:

    tar -xvf mendeleydesktop-1.12.3-linux-x86_64.tar.bz2  # 解压

    sudo mv mendeleydesktop /opt  # 复制到 / opt 下

    cd /opt/mendeleydesktop/bin   # cd 进去

    ./install-mendeley-link-handler.sh /opt/mendeleydesktop/bin/mendeleydesktop

    sudo yum install qtwebkit  # 安装依赖包

    注销重新登陆,在 Application->Education 下即可看到 mendeley 的相关项目。不过是 没有软件的图标的,强迫症不能忍,用下面的命令解决:

    cp /opt/mendeleydesktop/share/icons/hicolor/128x128/apps/mendeleydesktop.png ~/.local/share/icons/

    Google Chrome 浏览器

    默认的浏览器是 Firefox,还是更喜欢 Chrome 浏览器。

    Google 官方源在国内可能无法正常访问,故而添加 Fedora 中文社区提供的镜像源:

    sudo wget http://repo.fdzh.org/chrome/google-chrome-mirrors.repo -P /etc/yum.repos.d/

    安装:

    sudo yum install google-chrome-stable

    Opera 浏览器

    也可以选择 Opera 浏览器。

    下载地址:http://www.opera.com/download/guide/?os=linux

    选择 CentOS RPM package 进行下载。下载完成后,执行:

    sudo yum localinstall opera-12.16-1860.x86_64.rpm

    想要卸载的话,就执行:

    sudo yum remove opera

    Flash 插件

    Flash 插件主要是看在线视频的时候要用。Google 浏览器自带了 Flash 插件,所以这里安装的 flash 插件主要是为了 firefox。

    sudo rpm -ivh http://linuxdownload.adobe.com/adobe-release/adobe-release-x86_64-1.0-1.noarch.rpm

    sudo rpm --import /etc/pki/rpm-gpg/RPM-GPG-KEY-adobe-linux

    sudo yum install flash-plugin

    解压软件

    解压 7z 或 zip 格式需要 p7zip,由 EPEL 提供:

    sudo yum install p7zip

    解压 rar 格式可以使用 unar,该软件位于 EPEL 源中:

    sudo yum install unar

    FTP 客户端

    FTP 客户端,还是有界面的 filezilla 比较方便些。

    sudo yum install filezilla

    效率类软件

    这一类工具能够在不同方面提高科研的效率,也提高了使用者的体验。

    终端模拟器

    Gnome 自带的终端模拟器是 gnome-terminal。经常会需要开十几个终端,切换和管理起来比较麻烦。

    terminator

    terminator 有很多功能,我只用到了终端分割的功能。 Ctrl+Shift+O 对终端水平分隔, Ctrl+Shift+E 对终端垂直分隔, Alt + 上下左右 可以在各子终端中切换。terminator 由 Nux Dextop 提供:

    sudo yum install terminator

    zsh 与 oh my zsh

    Linux 下有很多 shell,比如最常见的 bash,除此之外还有 csh、ksh。zsh 也是一个 shell。

    zsh 的特点在于:

    • 语法基本完全兼容于 bash,一般用户完全体会不到其区别
    • zsh 提供命令补全特性,比 bash 的补全要更好用
    • 可配置性强

    完全不经配置的 zsh 已经很好用了,一般用户也没必要花时间研究配置。 oh my zsh 是一群人一起维护的一套 zsh 配置文件。 直接用这个配置文件,稍稍了解一点会有更好的体验。

    安装 zsh:

    sudo yum install zsh

    安装 oh my zsh:

    curl -L http://install.ohmyz.sh | sh

    上面的命令,做了如下几件事情:

    • 下载 oh my zsh 到 ~/.oh-my-zsh
    • 备份已有的 zsh 配置文件 ~/.zshrc ,并复制新的 .zshrc 文件
    • 将当前用户的默认 shell 由 bash 改成 zsh

    第三步中,会报错如下: chsh: "/usr/bin/zsh" is not listed in /etc/shells. ,需要手动修改默认 shell:

    chsh -s /bin/zsh

    chsh 命令修改的是 login shell,因而需要退出当前用户并重新登陆,以后用户的默认 shell 就从 bash 变成了 zsh,所有的配置都不用写到 .bashrc 而要写到 .zshrc 中。

    在 .zshrc 中可以选择喜欢的主题,以及适当数量的插件。下面列出我在用的插件:

    1. git

    该插件为 git 的众多常用命令提供了更简单的别名,比如 git status 的别名是 gst, 大大减少了击键数。但该插件中 git mergetool --no-prompt 的别名是 gmt, 与 GMT 软件冲突,需要将该插件的目录 git 复制到 custom/plugins 下,然后删除其中的 gmt 别名;

    1. 命令补全插件: pip, pyenv
    2. sudo:按两下 ESC 即可在当前命令前加上 sudo
    3. yum:为常见的 yum 命令提供别名

    autojump

    autojump 是一个非常智能的目录快速切换的工具。简单演示如下:

    $ pwd

    /home/qi

    $ cd Desktop

    $ cd /opt

    $ cd /usr/local

     

    # 用 j 命令迅速从 / usr/local 跳转到与 des 匹配的目录,这里只有 Desktop 可以匹配

    $ j des

    $ pwd

    /home/qi/Desktop

    用法差不多就这样,具体看项目主页。

    安装:

    sudo yum install autojump

    sudo yum install autojump-zsh

    中文输入法

    由于使用的是全英文安装,所以默认是没有中文输入法的。

    在“Application”->“Settings”->“Region & Language” 中将“Chinese(Intelligent Pinyin)”添加到“Input Sources” 中即可使用中文输入法。默认使用“Shift”键切换中文输入法。

    等宽字体

    编程要用等宽字体,这点是常识了。一款适合编程的等宽字体,至少要满足如下几个要求:

    1. 易于区分 “1”、“i” 和“l”
    2. 易于区分 “0”、“o” 和“O”
    3. 易于区分中文下的左引号和右引号
    4. 美观

    目前选择的 Source Code Pro。将解压后的字体文件放在 ~/.fonts 目录下,并修改终端、gedit 以及其他编辑器、IDE 等的默认字体。

    虚拟机

    有时候可能需要在 Windows 下做一些操作,如果机器性能足够好的话,可以安装虚拟机。

    VirtualBox 虚拟机

    VirtuabBox 的安装:

    wget http://download.virtualbox.org/virtualbox/rpm/rhel/virtualbox.repo

    sudo mv virtualbox.repo /etc/yum.repos.d/

    sudo yum install VirtualBox-5.1

    需要注意两点:

    • 若机器性能不够,虚拟机的使用体验会非常差,所以不建议在老机器上使用;
    • 更新 kernel 之后需要执行 sudo /sbin/rcvboxdrv setup ;
    • 在 VirtualBox 安装虚拟系统后,记得使用 “设备”->“安装增强功能”,使用效果会更好;

    gnome-boxes

    gnome-boxes 是 GNOME3 开发的一个虚拟机工具,使用体验不如 VirtualBox:

    sudo yum install gnome-boxes

    Wine

    Wine 是一个可以让 Windows 程序运行在 Linux 下的软件。类似虚拟机,但跟虚拟机又不太一样:

    sudo yum install wine

    同步网盘

    网盘根据功能大概可以分为两类:同步网盘和备份网盘。既然是同步网盘,Linux 下 的客户端必不可少。就目前已知的情况来看,CentOS7 下能使用的同步网盘只有三个: Dropbox、MEGA 和坚果云。

    我主要用同步网盘将 Linux 机器上的 PDF 文献同步到 iPad 上。

    Dropbox

    又是一个被墙的工具,熟练掌握科学上网技巧的人可以使用,一般人还是不要用了。

    wget https://www.dropbox.com/download?dl=packages/fedora/nautilus-dropbox-1.6.2-1.fedora.x86_64.rpm

    sudo rpm -i nautilus-dropbox-1.6.2-1.fedora.x86_64.rpm

    坚果云

    国内的全平台同步网盘,不限空间,但限制每月上传流量 1G,下载流量 3G。

    # 坚果云依赖于 notify-python

    sudo yum install notify-python

    # 下载

    wget https://jianguoyun.com/static/exe/installer/fedora/nautilus_nutstore_amd64.rpm

    sudo rpm -i nautilus_nutstore_amd64.rpm

    工具软件

    视频下载工具

    you-getyoutube-dl 是两个用于从视频网站上下载视频文件的工具。其中,后者支持的网站更多,但前者对国内的视频网站支持更好。

    pip install you-get

    pip install youtube-dl

    # EPEL 中提供了 youtube-dl 包,因而也可以使用 yum 安装。一般来说,pip 安装的版本更新一些

    PDF 处理工具

    cpdf 是一个跨平台的 PDF 处理工具,可以完成常见的 PDF 合并、 切割、加密解密、书签、水印等功能。

    下载已编译好的 二进制包, 解压,并将与自己的平台对应的二进制文件复制到 ${HOME}/bin 目录下即可使用。

    BT 软件

    transmission 是 Linux 下常用的 Torrent 下载软件:

    sudo yum install transmission

    在 “Application”->“Internet”-> 中可以启动 transmission。

    uGet

    http://ugetdm.com/

    uGet 是 Linux 下的一个下载工具,支持 HTTP、HTTPS、FTP、Torrent 等,支持多连接,并可以监视剪贴板:

    sudo yum --enablerepo=epel-testing install uget aria2

    截图软件 shutter

    GNOME 自带了截图工具。 PrtScn 为截取整个屏幕; Alt+PrtScn 为截取当前窗口; Shift+PrtScn 为自定义截屏区域。

    shutter 是一个功能更强大的截图工具,支持不同的截图方式、 图片格式,还支持图片的简单编辑与注释:

    sudo yum install shutter

    可以通过 修改快捷键使 shutter 成为默认的截图工具

    其他工具

    sudo yum install nfs-utils     # 挂载 NFS 文件系统所必须

    sudo yum install xclip         # 终端的文本复制工具

    sudo yum install ImageMagick   # 其中的 import 和 convert 命令很有用

    sudo yum install dos2unix unix2dos  # Windows 和 Linux 换行符互相转换

    sudo yum install meld          # 图形界面下的文件差异比较工具

    娱乐

    影音播放器

    Nux Dextop 提供了 mplayer ,可以用于播放常见格式的音频和视频:

    sudo yum install mplayer

    统计计算环境——Microsoft R Open

    Before installing Microsoft R Open on RedHat/CentOS, disable SELinux.

    1. Log in as root or a user with sudo privileges. If the latter, precede commands requiring root privileges with sudo.

    2. Make sure R is not running. Stop every R process prior to installing Microsoft R Open. You may need to close your IDE.

    3. Download the Microsoft R Open installer.

    4. Change to the directory where you downloaded the Microsoft R Open installer bundle.

    5. Untar the installer bundle as follows:

      tar -xf microsoft-r-open-3.3.2.tar.gz
    6. Go to the microsoft-r-open directory as follows:

      cd microsoft-r-open/
    7. Install Microsoft R Open as follows:

      sudo ./install.sh
    8. Follow the installer's onscreen prompts.

    9. To enable the optional multi-threaded performance for Microsoft R Open, select the MKL installation option and accept the end-user license agreement.

    10. When the Microsoft R Open installation is complete, run R in a terminal to begin interacting with R.

    Important!
    • After installing, the default R path is updated to point to R installed with Microsoft R Open 3.3.2, which is under lib64/R/bin/R.
    • The CRAN repository points to a snapshot from November 1, 2016. This means that every user of Microsoft R Open has access to the same set of CRAN package versions. To get packages from another date, use the checkpoint package, installed with Microsoft R Open.
    • Download and configure an IDE, such as RStudio

    参考

    1. ELRepo 官方网站
    2. CentOS Yum 软件库样例

     

  • 相关阅读:
    pycharm 安装第三方库报错:AttributeError: 'module' object has no attribute 'main'
    CentOS7.x 设置显示vi/vim行号
    centos下使用yum 安装pip
    kubelet服务启动失败,错误代码255
    服务器时间设置
    解决umount.nfs: /data: device is busy 问题
    vim修改权限: E45: 已设定选项 'readonly' (请加 ! 强制执行)
    Postgresql 截取字符串
    《算法竞赛进阶指南》0x31质数 阶乘分解质因数
    《算法竞赛进阶指南》0x31质数 POJ2689 Prime Distance
  • 原文地址:https://www.cnblogs.com/evilqliang/p/6141858.html
Copyright © 2020-2023  润新知