• python读取.set文件


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    简介

    本案例主要介绍如何读取eeglab示例文件.set.
    .set文件记录的是采集的信息,主要内容包括通道数,事件数,开始时间与结束时间等。

    知识点

    mne中使用mne.io.read_raw_eeglab()读取.set文件;

    read_raw_eeglab()函数介绍:

    mne.io.read_raw_eeglab(input_fname,
                           montage='deprecated',
                           eog=(), 
                           preload=False, 
                           uint16_codec=None,
                           verbose=None)  
    

    参数解读

    input_fname:.set文件的存放路径;  
    montage='deprecated':该参数已经舍弃了。在0.19版本中,它的功能可以通过set_montage方法来实现;  
    eog:指定eog通道的通道名称或索引,如果设置为auto,则使用包含eog和eye的通道名称。默认情况为空元组;  
    preload:类型 str或者bool 如果为True,则数据将预加载到内存中,以满足更快速的索引;  
    uint16_codec:类型 str | None 允许指定读取字符数组时应用的编解码器(比如,"latin1"或者"utf-8")
    

    案例

    #导入工具库
    import mne
    import matplotlib.pyplot as plt
    
    1. 利用mne.io.read_raw_eeglab来读取.set文件
    """
    通过mne.io.read_raw_eeglab来读取.set文件
    得到原始数据对象
    """
    raw = mne.io.read_raw_eeglab("Eeglab_data.set",preload=False)
    
    1. 绘制从第5s开始,5s时间窗口长的原始数据
    """
    绘制从第5s开始,5s时间窗口长的原始数据
    
    start:指定开始绘制的时间
    duration:要绘制的时间窗口
    
    从该图中可以看出每个通道的数据波动情况
    可以通过设置duration的大小来放大或缩小
    
    这个有点类似于eeglab中,放大缩小功能。
    这里相同大小的窗口显示更短时间的数据,相当于eeglab中的选中数据进行放大,
    反之,即缩小。
    """
    raw.plot(start=5, duration=5)
    plt.show()
    

    """
    设置duration=1,相当于放大
    """
    raw.plot(start=5, duration=1)
    plt.show()
    

    1. 通常raw的数据访问方式如下:
      data, times = raw[picks, time_slice]

    picks:是根据条件挑选出来的索引;
    time_slice:时间切片

    想要获取raw中所有数据,以下两种方式均可:
    data,times=raw[:]
    data,times=raw[:,:]

    """
    获取1-3秒内的EEG数据
    获取前5条 时间从1秒开始到3秒为止的数据
    raw[:5,int(sfreq*1):int(sfreq*3)]
    """
    
    sfreq=raw.info['sfreq']
    data,times=raw[:5,int(sfreq*1):int(sfreq*3)]
    plt.plot(times,data.T)
    plt.title("Sample channels")
    

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  • 原文地址:https://www.cnblogs.com/RoseVorchid/p/11978623.html
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