• poj2778 DNA Sequence(AC自动机+矩阵快速幂)


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    题目大意:基因序列仅含AGCT四个英语字母,有m个病毒,长度不超过10,现在要制造一个长度为n的基因序列,问有多少种方案,使得我的基因序列不含有病毒子串。

    样例输入:

    4 3

    AT

    AC

    AG

    AA

      首先对于所有病毒先跑AC自动机,然后可以得到一张图,对于AC自动机建立的trie树,我们可以看做是一张图,起点在空串上,每个点加上一个新字母之后可以到达一个新的点。而这张图上,有部分点是不能经过的非法点,分别是字符串末尾和fail指针为非法点的点。

      以样例为例,建出来的图是这样的:

       其中,2,3,4,5点位非法点,0,1为合法点。根据AC自动机上trie树的转移方案,可以得到任意两点之间的转移方案,即路径数,采用邻接矩阵表示,mat[i][j]表示i->j路径数,样例表示为:

      

    egin{pmatrix}
    3 & 1 & 0 & 0 & 0 & 0\
    0 & 0 & 1 & 1 & 1 & 1\
    3 & 1 & 0 & 0 & 0 & 0\
    3 & 1 & 0 & 0 & 0 & 0\
    3 & 1 & 0 & 0 & 0 & 0\
    3 & 1 & 0 & 0 & 0 & 0
    end{pmatrix}

    而由于部分点是不可选的非法点,因此我们将和这些点相邻的点删除,矩阵变为了

    egin{pmatrix}
    3 & 1 & 0 & 0 & 0 & 0\
    0 & 0 & 0 & 9 & 0 & 0\
    0 & 0 & 0 & 0 & 0 & 0\
    0 & 0 & 0 & 0 & 0 & 0\
    0 & 0 & 0 & 0 & 0 & 0\
    0 & 0 & 0 & 0 & 0 & 0
    end{pmatrix}

      随后要用到离散数学的知识,对于这个矩阵的n次方,所得到的矩阵matrix,matrix[i][j]表示i->j走过n步路之后的方案数。因此,只需要求该矩阵的n次方,随后将第一行加起来即可,矩阵快速幂求解即可。最后贴上AC代码:

    #include<iostream>
    #include<queue>
    #include<cstring>
    using namespace std;
    typedef long long ll;
    typedef long double ld;
    typedef unsigned long long ull;
    typedef pair <ll,ll> pii;
    #define rep(i,x,y) for(int i=x;i<y;i++)
    #define rept(i,x,y) for(int i=x;i<=y;i++)
    #define per(i,x,y) for(int i=x;i>=y;i--)
    #define all(x) x.begin(),x.end()
    #define pb push_back
    #define fi first
    #define se second
    #define mes(a,b) memset(a,b,sizeof a)
    #define mp make_pair
    #define dd(x) cout<<#x<<"="<<x<<" "
    #define de(x) cout<<#x<<"="<<x<<"
    "
    #define debug() cout<<"I love Miyamizu Mitsuha forever.
    "
    const int inf=0x3f3f3f3f;
    const int maxn=205;
    const int mod=100000;
    int id(char ch)
    {
        if(ch=='A') return 0;
        if(ch=='G') return 1;
        if(ch=='C') return 2;
        if(ch=='T') return 3;
    }
    
    class Trie
    {
        public:
            Trie()
            {
                cnt=1;
            }
            int cnt; 
            int trie[maxn][5];
            int fail[maxn];
            bool bad[maxn];
            void insert(string s)
            {
                int len=s.size();
                int pos=0;
                rep(i,0,len)
                {
                    int next=id(s[i]);
                    if(!trie[pos][next]) trie[pos][next]=cnt++;
                    pos=trie[pos][next];
                }
                bad[pos]=1;
            }
            void getfail()
            {
                queue<int> q;
                rep(i,0,4)
                {
                    if(trie[0][i])
                    {
                        fail[trie[0][i]]=0;
                        q.push(trie[0][i]);
                    }
                }
                while(!q.empty())
                {
                    int pos=q.front();
                    q.pop();
                    bad[pos]|=bad[fail[pos]];
                    rep(i,0,4)
                    {
                        if(trie[pos][i])
                        {
                            fail[trie[pos][i]]=trie[fail[pos]][i];
                            q.push(trie[pos][i]);
                        }
                        else
                        {
                            trie[pos][i]=trie[fail[pos]][i];
                        }
                    }
                }
                rept(i,0,cnt)
                {
                    rep(j,0,4)
                        if(!trie[i][j])
                        {
                            trie[i][j]=trie[fail[i]][j];
                        }
                }
            }
    }t;
    class matrix
    {
        public:
            ll arrcy[105][105];
            int row,column;
            matrix()
            {
                memset(arrcy,0,sizeof arrcy);
                column=row=0;
            }
            friend matrix operator *(matrix s1,matrix s2)
            {
                int i,j;
                matrix s3;
                for (i=0;i<s1.row;i++)
                {
                    for (j=0;j<s2.column;j++)
                    {
                        for (int k=0;k<s1.column;k++)
                        {
                            s3.arrcy[i][j]+=s1.arrcy[i][k]*s2.arrcy[k][j];
                            s3.arrcy[i][j]%=mod;
                        }
                    }
                }
                s3.row=s1.row;
                s3.column=s2.column;
                return s3;
            }
            void show()
            {
                for(int i=0;i<row;i++)
                {
                    for (int j=0;j<column;j++)
                        cout<<arrcy[i][j]<<" ";
                    cout<<endl;
                }
            }
    }mat;
    matrix quick_pow(matrix s1,long long n)
    {
        matrix mul=s1,ans;
        ans.row=ans.column=s1.row;
        memset(ans.arrcy,0,sizeof ans.arrcy);
        for(int i=0;i<ans.row;i++)
            ans.arrcy[i][i]=1;
        while(n)
        {
            if(n&1) ans=ans*mul;
            mul=mul*mul;
            n>>=1;
        }
        return ans;
    }
    string s;
    int main()
    {
        ios::sync_with_stdio(false);
        cin.tie(0);
        int n,len;
        cin>>n>>len;
        rep(i,0,n)
        {
            cin>>s;
            t.insert(s);
        }
        t.getfail();
        mat.row=mat.column=t.cnt;
        rept(i,0,t.cnt)
        {
            if(t.bad[i]) continue;
            rep(j,0,4)
            {
                if(!t.bad[t.trie[i][j]]) mat.arrcy[i][t.trie[i][j]]++;
            }
        }
    //    mat.show();
        mat=quick_pow(mat,len);
        int ans=0;
        rept(i,0,t.cnt) ans=(ans+mat.arrcy[0][i])%mod;
        cout<<ans<<"
    ";
        return 0;
    }
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