• annData格式


    1.例子

     1.1 obs

     一维观测的注释,是数据框类型的。通过.运算符访问

     访问其中的一个属性,就通过普通的dataframe来访问:

     1.2 var

     一维的针对特征的注释,返回数据框类型。

    1.3 uns

    无结构的标注,有序字典。

    这个uns的部分不是针对行/列的,而是针对行和列标注的参数的(暂时这么理解),在上述中pbmc的obs中有louvain观测,那么在uns中就是运行louvain算法的参数。是以哈希形式存储的。

    1.4 obsm

     对观测的多维的注释,它是可变的ndarray,长度为n_obs,维度为2至多维。这里的m指的就是multi-dim多个维度的,和obs一个维度可以都放在一个数据框下不同。

     如上,2至多维的ndarray

    1.5 varm

     描述特征的,与obsm相对。

     1.6 obsp

     针对观测的配对的注释,前两维都是n_obs,

     比如点与点之间的距离和连通性。

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  • 原文地址:https://www.cnblogs.com/BlueBlueSea/p/13959111.html
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