• 实验二 K- 近邻算法及应用


    一、相关信息

    实验班级 https://edu.cnblogs.com/campus/ahgc/machinelearning
    实验要求 https://edu.cnblogs.com/campus/ahgc/machinelearning/homework/12004
    实验目标 争取自己能够大概弄懂k近邻算法的主要代码,并且尝试理解kd树的构造原理
    学号 3180701338

    二、实验信息

    【实验目的】

    1.理解K-近邻算法原理,能实现算法K近邻算法;

    2.掌握常见的距离度量方法;

    3.掌握K近邻树实现算法;

    4.针对特定应用场景及数据,能应用K近邻解决实际问题。

    【实验内容】

    1.实现曼哈顿距离、欧氏距离、闵式距离算法,并测试算法正确性。

    2.实现K近邻树算法;

    3.针对iris数据集,应用sklearn的K近邻算法进行类别预测。

    4.针对iris数据集,编制程序使用K近邻树进行类别预测。

    【实验报告要求】

    1.对照实验内容,撰写实验过程、算法及测试结果;

    2.代码规范化:命名规则、注释;

    3.分析核心算法的复杂度;

    4.查阅文献,讨论K近邻的优缺点;

    5.举例说明K近邻的应用场景。

    三、实验完成情况
    (1)实验主要代码及部分注释:
    距离度量

    import math   #导入这个math模块,就可以用模块里面的一些做数学运算的函数
    from itertools import combinations #itertools模块combinations(iterable, r)方法可以创建一个迭代器,
    #返回iterable中所有长度为r的子序列,返回的子序列中的项按输入iterable中的顺序排序。
    #注:迭代器itertools.combinations可以实现一组数据的所有排列组合。
    

    p = 1 曼哈顿距离
    p = 2 欧氏距离
    p = inf 闵式距离minkowski_distance

    def L(x, y, p=2):
        # x1 = [1, 1], x2 = [5,1]   这里的实例是两个二维特征 x1 = [1, 1], x2 = [5,1]
        if len(x) == len(y) and len(x) > 1: # 当两个特征的维数相等时,并且维度大于1时。
            sum = 0# 目前总的损失函数值为0
            for i in range(len(x)):# 用range函数来遍历x所有的维度,x与y的维度相等。
                sum += math.pow(abs(x[i] - y[i]), p)# math.pow( x, y )函数是计算x的y次方。
            return math.pow(sum, 1/p)# 距离公式。
        else:
            return 0
    

    例3.1

    x1 = [1, 1]
    x2 = [5, 1]
    x3 = [4, 4]
    
    # x1, x2
    for i in range(1, 5):
        r = { '1-{}'.format(c):L(x1, c, p=i) for c in [x2, x3]}
        # 一条语句循环两次x2、x3,当x2时,当前i产生一个值,当x3时,当前i产生一个值。
        print(min(zip(r.values(), r.keys())))
    

    注:r{keys:values}是字典的形式。
    注:当p=1时,先取,x1距离x2的距离、x1距离x3的距离,再取,最小的距离。
    注:当p=2时,先取,x1距离x2的距离、x1距离x3的距离,再取,最小的距离。
    注:当p=2时,先取,x1距离x2的距离、x1距离x3的距离,再取,最小的距离。
    注:当p=2时,先取,x1距离x2的距离、x1距离x3的距离,再取,最小的距离。

    python实现,遍历所有数据点,找出n个距离最近的点的分类情况,少数服从多数

    import numpy as np
    import pandas as pd
    import matplotlib.pyplot as plt
    %matplotlib inline
    from sklearn.datasets import load_iris
    from sklearn.model_selection import train_test_split
    from collections import Counter
    
    # data
    iris = load_iris() #导入库中的数据集
    df = pd.DataFrame(iris.data, columns=iris.feature_names)
    df['label'] = iris.target
    #定义实验中包含的鸢尾花的特征属性及其对应标签
    df.columns = ['sepal length', 'sepal width', 'petal length', 'petal width', 'label']
    # data = np.array(df.iloc[:100, [0, 1, -1]])
    
    df #查看数据集的内容
    

    绘制散点图如下

    plt.scatter(df[:50]['sepal length'], df[:50]['sepal width'], label='0')
    plt.scatter(df[50:100]['sepal length'], df[50:100]['sepal width'], label='1')
    plt.xlabel('sepal length')
    plt.ylabel('sepal width')
    plt.legend()
    
    data = np.array(df.iloc[:100, [0, 1, -1]])
    X, y = data[:,:-1], data[:,-1]
    X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=0.2)
    #train_test_split()函数
    

    注:train_test_split函数用于将矩阵随机划分为训练子集和测试子集。
    注:并返回划分好的训练集测试集样本和训练集测试集标签。
    注:X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=0.2)
    注:表示将数据集按照数据集X,y进行切割划分为训练集合测试集,
    浮点数表示测试集占总样本的百分比。

    class KNN:
        def __init__(self, X_train, y_train, n_neighbors=3, p=2):
            """
            parameter: n_neighbors 临近点个数
            parameter: p 距离度量
            """
            self.n = n_neighbors
            self.p = p
            self.X_train = X_train
            self.y_train = y_train
            
        def predict(self, X):
            # 取出n个点
            knn_list = []
            for i in range(self.n):
                dist = np.linalg.norm(X - self.X_train[i], ord=self.p)
                #np.linalg.norm函数
                #np.linalg.norm(x, ord=None, axis=None, keepdims=False)
                #① x: 表示矩阵(也可以是一维)
                #② ord:范数类型
                knn_list.append((dist, self.y_train[i]))
            
            for i in range(self.n, len(self.X_train)):# 取从第三个开始往后测试集的所有点。
                max_index = knn_list.index(max(knn_list, key=lambda x: x[0]))
                # 首先max函数里面选取出  knn_list 里面最大的距离数据
                # 然后取出它的索引存在 max_index
                dist = np.linalg.norm(X - self.X_train[i], ord=self.p)
                # 继续计算待分类点与其他训练集数据的欧式距离
                if knn_list[max_index][0] > dist:
                    knn_list[max_index] = (dist, self.y_train[i])
                    # 每次循环迭代knn_list的数据 目标是找到距离小的点
                    # 如果新的点比之前列表中的距离要小 那么就添加进去 因为比较的是最大点
                    # 要做的就是把距离大的点从列表中剔除出去
            
            # 统计
            knn = [k[-1] for k in knn_list]
            # 解析列表 把对应的类别放入新的列表
            # 则knn为数据形式 [1.0, 1.0, 1.0]
            count_pairs = Counter(knn)
            #  Counter类的目的是用来跟踪值出现的次数。它是一个无序的容器类型,以字典的键值对形式存储,其中元素作为key
            # 此处就是为了统计每个类别出现的次数,好方便后面最终确定待分类点属于哪一类。
            # 对应数据格式
            # Counter({1.0: 3})
            max_count = sorted(count_pairs, key=lambda x:x)[-1]
            #Lambda()函数
            #a = lambda x,y,z:(x+8)*y-z
            #print(a(5,6,8))
            #注:传入多个参数的lambda函数
            return max_count
            # 最后进行排序 得出出现次数最多的那个类别 作为最终的分类结果。
            # 因为 sorted返回的数据格式是列表形式 所以需要进行索引[-1][0]
            # 如  [1.0]
        def score(self, X_test, y_test):
            right_count = 0
            # 分类正确的次数 初始为 0
            n = 10
            for X, y in zip(X_test, y_test):
                label = self.predict(X)
                # print("预测类别为:{}".format(label))
                # print("实际类别为: {}".format(y))
                # print("")
                if label == y:# 如果分类正确
                    right_count += 1# 次数 +1
            return right_count / len(X_test) # 返回最终分类结果表现 正确次数/测试数据集总数。
    
    clf = KNN(X_train, y_train)
    
    clf.score(X_test, y_test)
    
    test_point = [6.0, 3.0]
    print('Test Point: {}'.format(clf.predict(test_point)))
    
    plt.scatter(df[:50]['sepal length'], df[:50]['sepal width'], label='0')
    plt.scatter(df[50:100]['sepal length'], df[50:100]['sepal width'], label='1')
    plt.plot(test_point[0], test_point[1], 'bo', label='test_point')
    plt.xlabel('sepal length')
    plt.ylabel('sepal width')
    plt.legend()
    

    scikitlearn(Scikit学习实例)

    from sklearn.neighbors import KNeighborsClassifier
    
    clf_sk = KNeighborsClassifier()
    clf_sk.fit(X_train, y_train)
    
    clf_sk.score(X_test, y_test)
    

    sklearn.neighbors.KNeighborsClassifier
    n_neighbors: 临近点个数
    p: 距离度量
    algorithm: 近邻算法,可选{'auto', 'ball_tree', 'kd_tree', 'brute'}
    weights: 确定近邻的权重

    kd树
    ① kd树是一个二叉树结构,它的每一个节点记载了【特征坐标,切分轴,指向左枝的指针,指向右枝的指针】。
    注:其中,特征坐标是线性空间 Rn 中的一个点 (x1,x2,…,xn)。
    注:切分轴由一个整数 r 表示,这里 1≤r≤n,是我们在 n 维空间中沿第 r 维进行一次分割。
    注:节点的左枝和右枝分别都是 kd 树。
    注:给定一个数据样本集 S⊆Rn 和切分轴 r,以下递归算法将构建一个基于该数据集的 kd 树,每一次循环制作一个节点:
    ② 如果 |S|=1 ( 样本集中元素只有一个 ),记录 S 中唯一的一个点为当前节点的特征数据,并且不设左枝和右枝。(|S| 指集合 S 中元素的数量)
    ③ 如果 |S|>1( 样本集中元素大于一个 )
    3.1将 S 内所有点按照第 r 轴坐标的大小进行排序。
    3.2选出该排列后的中位元素 ( 如果一共有偶数个元素,则选择中位左边或右边的元素,左随便哪一个都无所谓),作为当前节点的特征坐标,并且记录切分轴 r。
    3.3将 SL 设为在 S 中所有排列在中位元素之前的元素; SR 设为在 S 中所有排列在中位元素后的元素。
    3.4再设 r←(r+1)modn。

    # kd-tree每个结点中主要包含的数据结构如下
    class KdNode(object):
        def __init__(self, dom_elt, split, left, right):
            self.dom_elt = dom_elt # k维向量节点(k维空间中的一个样本点)
            self.split = split # 整数(进行分割维度的序号)
            self.left = left # 该结点分割超平面左子空间构成的kd-tree
            self.right = right # 该结点分割超平面右子空间构成的kd-tree
        
    class KdTree(object):
        def __init__(self, data):
            k = len(data[0]) # 数据维度
            
            def CreateNode(split, data_set): # 按第split维划分数据集exset创建KdNode
                if not data_set: # 数据集为空
                    return None
                # key参数的值为一个函数,此函数只有一个参数且返回一个值用来进行比较
                # operator模块提供的itemgetter函数用于获取对象的哪些维的数据,参数为需要获取的数据在对象
                # data_set.sort(key=itemgetter(split)) 
                # 按要进行分割的那一维数据排序
                # 对data_set按要进行分割的那一维(split维)的数据排序。
                data_set.sort(key=lambda x: x[split])
                split_pos = len(data_set) // 2 # //为Python中的整数除法
                median = data_set[split_pos] # 中位数分割点
                split_next = (split + 1) % k # cycle coordinates
                # split_next = (split + 1) % k  实际上就是 split_next = (split + 1),沿split + 1维进行分割。
                # 只是限制封顶为k,当为k的时候余数为0。
                
                # 递归的创建kd树
                return KdNode(median, split,
                              CreateNode(split_next, data_set[:split_pos]), # 创建左子树
                              CreateNode(split_next, data_set[split_pos + 1:])) # 创建右子树
            self.root = CreateNode(0, data) # 从第0维分量开始构建kd树,返回根节点
            
    # KDTree的前序遍历
    def preorder(root):
        print (root.dom_elt) # dom_elt 为 k维向量节点(k维空间中的一个样本点)
        if root.left: # 节点不为空
            preorder(root.left)
        if root.right:
            preorder(root.right)
    
    # 对构建好的kd树进行搜索,寻找与目标点最近的样本点:
    from math import sqrt
    from collections import namedtuple
    
    # 定义一个namedtuple,分别存放最近坐标点、最近距离和访问过的节点数
    result = namedtuple("Result_tuple", "nearest_point nearest_dist nodes_visited")
    
    def find_nearest(tree, point):
        k = len(point) # 数据维度
        def travel(kd_node, target, max_dist):
            if kd_node is None:
                return result([0] * k, float("inf"), 0) 
            # python中用float("inf")和float("-inf")表示正负
            # 即最近距离为无穷大,访问过的节点数为0
            nodes_visited = 1 # 如果节点不为空,此时的访问节点数为1。
            s = kd_node.split # 进行分割的维度
            pivot = kd_node.dom_elt # 进行分割的“轴”
            
            if target[s] <= pivot[s]: # 如果目标点第s维小于分割轴的对应值(目标离左子树更近)
                nearer_node = kd_node.left # 下一个访问节点为左子树根节点
                further_node = kd_node.right # 同时记录下右子树
            else: # 目标离右子树更近
                nearer_node = kd_node.right # 下一个访问节点为右子树根节点
                further_node = kd_node.left  # 同时记录下右子树
                
            temp1 = travel(nearer_node, target, max_dist) # 进行遍历找到包含目标点的区域
            
            nearest = temp1.nearest_point # 以此叶结点作为“当前最近点”
            dist = temp1.nearest_dist # 更新最近距离
            
            nodes_visited += temp1.nodes_visited
            
            if dist < max_dist:
                max_dist = dist # 最近点将在以目标点为球心,max_dist为半径的超球体内
            
            temp_dist = abs(pivot[s] - target[s]) # 第s维上目标点与分割超平面的距离
            if max_dist < temp_dist: # 判断超球体是否与超平面相交
                return result(nearest, dist, nodes_visited) 
            # 不相交则可以直接返回,不用继续判断
            # result是一个namedtuple函数。
    
            #----------------------------------------------------------------------
            # 计算目标点与分割点的欧氏距离
            temp_dist = sqrt(sum((p1 - p2) ** 2 for p1, p2 in zip(pivot, target)))
            if temp_dist < dist: 
                # 如果目标点与分割超平面的距离小于max_dist为半径的超球体。
                nearest = pivot # 更新最近点
                dist = temp_dist # 更新最近距离
                max_dist = dist # 更新超球体半径
                
            # 检查另一个子结点对应的区域是否有更近的点
            temp2 = travel(further_node, target, max_dist)
            
            nodes_visited += temp2.nodes_visited
            if temp2.nearest_dist < dist: # 如果另一个子结点内存在更近距离
                nearest = temp2.nearest_point # 更新最近点
                dist = temp2.nearest_dist # 更新最近距离
                return result(nearest, dist, nodes_visited)
    
            return travel(tree.root, point, float("inf")) # 从根节点开始递归
        # 此时的float("inf")表示最大距离max_dist为正无穷。
    

    例3.2

    data = [[2,3],[5,4],[9,6],[4,7],[8,1],[7,2]] # 获得数据集
    kd = KdTree(data) # 根据数据集,搭建一个KdTree
    preorder(kd.root) # KdTree前序遍历,查看是否KdTree搭建成功。
    
    from time import clock
    from random import random
    
    # 产生一个k维随机向量,每维分量值在0~1之间
    def random_point(k):
        return [random() for _ in range(k)]
    
    # 产生n个k维随机向量
    def random_points(k, n):
        return [random_point(k) for _ in range(n)]
    
    ret = find_nearest(kd, [3,4.5])
    print (ret)
    
    #注:ret为find_nearest()函数,函数最后返回的是距离最近的点、最近的距离,访问过的节点次数。
    
    N = 400000
    t0 = clock()
    kd2 = KdTree(random_points(3, N)) # 构建包含四十万个3维空间样本点的kd树
    ret2 = find_nearest(kd2, [0.1,0.5,0.8]) # 四十万个样本点中寻找离目标最近的点
    t1 = clock()
    print ("time: ",t1-t0, "s")  # 计算寻找的时间
    

    (2)实验运行结果截图:






    (3)分析核心算法的复杂度:
    线性搜索时间复杂度较高,因而引入了kd树这一数据结构,能够一定程度上加快搜索效率;如果实例点是随是随机分布的,kd树搜索复杂度是O(logN),这里N是训练实例数,kd树更适合于训练实例数远大于空间维数时的k近邻搜索。但是当空间维数接近训练实例数时,它的效率会迅速下降,几乎接近线性扫描。

    (4)讨论K近邻算法的优缺点:
    i)优点
    1.简单易用
    2.没有显式的训练过程,在训练过程中仅仅是把训练样本保存起来,训练时间开销为0,是懒惰学习(lazy learning) 的著名代表 。
    3.预测效果好
    4.对异常值不敏感

    ii)缺点
    缺点1:效率低下
    原因:如果训练集有m个样本,n个特征,预测每一个新样本,需要计算与m个样本的距离,每计算一个距离,要使用n个时间复杂度,则计算m个样本的距离,使用m * n个时间复杂度;
    算法的时间复杂度:反映了程序执行时间随输入规模增长而增长的量级,在很大程度上能很好反映出算法的优劣与否。
    算法的时间复杂度与空间复杂度,参考:算法的时间复杂度和空间复杂度
    可以通过树结构对k近邻算法优化:KD-Tree、Ball-Tree,但即便进行优化,效率依然不高;

    缺点2:高度数据相关
    机器学习算法,就是通过喂给数据进行预测,理论上所有机器学习算法都是高度数据相关;
    k近邻算法对outlier更加敏感:比如三近邻算法,在特征空间中,如果在需要预测的样本周边,一旦有两个样本出现错误值,就足以使预测结果错误,哪怕在更高的范围里,在特征空间中有大量正确的样本;

    缺点3:预测的结果不具有可解释性
    按k近邻算法的逻辑:找到和预测样本比较近的样本,就得出预测样本和其最近的这个样本类型相同;
    问题:为什么预测的样本类型就是离它最近的样本的类型?
    很多情况下,只是拿到预测结果是不够的,还需要对此结果有解释性,进而通过解释推广使用,或者制作更多工具,或者以此为基础发现新的理论/规则,来改进生产活动中的其它方面——这些是kNN算法做不到的;

    缺点4:维数灾难
    维数灾难:随着维度的增加,“看似相近”的两个点之间的距离越来越大;
    例:[0, 0, 0, ...0]和[1, 1, 1,...1],按欧拉定理计算,元素个数越多,两点距离越大;
    方案:降维(PCA);

    (5)K近邻算法常见的应用场景:
    主要有:
    ①python中的文本自动分类
    ②社交网站的数据分类
    ③手写识别系统的数据分类
    ④聚类分析,多分类领域

    四、实验小结
    通过此次实验,可以看出:K值的选择会对K近邻算法的结果会产生重大影响。如果选择较小的K值,就相当于用较小的领域中的训练实例进行预测,“学习”近似误差会减小,只有与输入实例较近或相似的训练实例才会对预测结果起作用,与此同时带来的问题是“学习”的估计误差会增大,换句话说,K值的减小就意味着整体模型变得复杂,容易发生过拟合;如果选择较大的K值,就相当于用较大领域中的训练实例进行预测,其优点是可以减少学习的估计误差,但缺点是学习的近似误差会增大。这时候,与输入实例较远(不相似的)训练实例也会对预测器作用,使预测发生错误,且K值的增大就意味着整体的模型变得简单。K=N则完全不可取,因为此时无论输入实例是什么,都只是简单的预测它属于训练实例中最多的一类,模型过于简单,忽略了训练实例中大量的有用信息。
    所以在实际应用中,K值一般取一个比较小的数值,例如可以采用交叉验证法(一部分样本做训练集,一部分样本做测试集)来选择最优的K值。

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