• pandas(七)数据规整化:清理、转换、合并、重塑之合并数据集


    pandas对象中的数据可以通过一些内置的方式进行合并:

     pandas.merge 可根据一个或多个键将不同的DataFrame中的行连接起来。

    pandas.concat可以沿着一条轴将多个对象堆叠到一起

    实例的方法conbine_first 可以将重复的数据编接到一起,用一个对象中的值填充另一个对象的缺失值。

    数据库风格的DataFrame合并

    In [51]: df1 = DataFrame({'key':['b','b','a','c','a','a','b'],'data1':range(7)})
    In [53]: df2 = DataFrame({'key':['a','b','d'],'data2':range(3)})
    
    In [54]: df1
    Out[54]:
       data1 key
    0      0   b
    1      1   b
    2      2   a
    3      3   c
    4      4   a
    5      5   a
    6      6   b
    
    In [55]: df2
    Out[55]:
       data2 key
    0      0   a
    1      1   b
    2      2   d
    
    In [56]: pd.merge(df1,df2)
    Out[56]:
       data1 key  data2
    0      0   b      1
    1      1   b      1
    2      6   b      1
    3      2   a      0
    4      4   a      0
    5      5   a      0

    默认不显式指明用哪个键进行连接的时候,merge会将重叠列的列名当做键。不过,最好显式的指明:

    In [57]: pd.merge(df1,df2,on = 'key')

    如果两个列的列名不同,可以分别指定

    In [58]: df4 = DataFrame({'key-r':['a','b','d'],'data2':range(3)})
    
    In [59]: df3 = DataFrame({'key-l':['b','b','a','c','a','a','b'],'data1':range(7)})
    
    
    In [63]: pd.merge(df3,df4,left_on = 'key-l',right_on = 'key-r')
    Out[63]:
       data1 key-l  data2 key-r
    0      0     b      1     b
    1      1     b      1     b
    2      6     b      1     b
    3      2     a      0     a
    4      4     a      0     a
    5      5     a      0     a

    默认情况下,merge做的是‘inner’连接,merge还有left、right和outer:

    In [64]: pd.merge(df1,df2,how='outer')
    Out[64]:
       data1 key  data2
    0    0.0   b    1.0
    1    1.0   b    1.0
    2    6.0   b    1.0
    3    2.0   a    0.0
    4    4.0   a    0.0
    5    5.0   a    0.0
    6    3.0   c    NaN
    7    NaN   d    2.0

    如果要根据多个键进行合并,传入一个由列名组成的列表即可。

    In [65]: left = DataFrame({'key1':['a','a','b'],'key2':['one','two','one'],'lrow':[1,2,3]})
    
    In [66]: right = DataFrame({'key1':['a','a','b','b'],'key2':['one','one','one','two'],'rrow':[4,5,6,7]})
    
    In [67]: pd.merge(left,right,on = ['key1','key2'])
    Out[67]:
      key1 key2  lrow  rrow
    0    a  one     1     4
    1    a  one     1     5
    2    b  one     3     6

    如果合并的列中存在重复的列,可以指定重复的列的后缀进行区分

    In [68]: pd.merge(left,right,on = ['key1'])
    Out[68]:
      key1 key2_x  lrow key2_y  rrow
    0    a    one     1    one     4
    1    a    one     1    one     5
    2    a    two     2    one     4
    3    a    two     2    one     5
    4    b    one     3    one     6
    5    b    one     3    two     7
    #指定列名
    In [71]: pd.merge(left,right,on = ['key1'],suffixes=['_eft','_right'])
    Out[71]:
      key1 key2_eft  lrow key2_right  rrow
    0    a      one     1        one     4
    1    a      one     1        one     5
    2    a      two     2        one     4
    3    a      two     2        one     5
    4    b      one     3        one     6
    5    b      one     3        two     7

     索引上的合并

    有时候,DataFrame中的连接键位于其索引中,merge可以通过left_index = True 或 right_index =True 来讲索引应用于连接键。

    In [73]: left = DataFrame({'key':['a','b','a','a','b','c'],'value':range(6)})
    In [75]: right = DataFrame({'group_val':[3.5,7]},index=['a','b'])
    
    In [76]: pd.merge(left,right,left_on = 'key',right_index= True)
    Out[76]:
      key  value  group_val
    0   a      0        3.5
    2   a      2        3.5
    3   a      3        3.5
    1   b      1        7.0
    4   b      4        7.0

    对于层次化的索引,需要对应的left_on = ['key1','key2'] , right_index = True

    pandas的数据合并

    轴向连接

    另一种合并运算也叫做连接、绑定或堆叠。

    numpy有一个用于原始合并Numpy数组的concatenation函数

    >>> arr = np.arange(12).reshape(3,4)

    >>> arr

    array([[ 0,  1,  2,  3],

           [ 4,  5,  6,  7],

           [ 8,  9, 10, 11]])

    >>> np.concatenate([arr,arr])

    array([[ 0,  1,  2,  3],

           [ 4,  5,  6,  7],

           [ 8,  9, 10, 11],

           [ 0,  1,  2,  3],

           [ 4,  5,  6,  7],

           [ 8,  9, 10, 11]])

    >>> np.concatenate([arr,arr],axis =1)

    array([[ 0,  1,  2,  3,  0,  1,  2,  3],

           [ 4,  5,  6,  7,  4,  5,  6,  7],

           [ 8,  9, 10, 11,  8,  9, 10, 11]])

    pandas的concat函数提供了解决类似上述数组的链接操作。并且能够解决下述问题:

    1、如果各个对象其他轴上的索引不同,合并的时候是采用交集还是并集。

    2、结果对象中的分组需要各不相同吗?

    3、用于连接的轴的重要性。

    以Series为例

    >>> s1 = Series(['0','1'],index = ['a','b'])

    >>> s2 = Series([2,3,4],index = ['c','d','e'])

    >>> s3 = Series({'f':5,'g':6})

    >>> s1

    a    0

    b    1

    dtype: object

    >>> s3

    f    5

    g    6

    dtype: int64

    >>> pd.concat((s1,s2,s3))

    a    0

    b    1

    c    2

    d    3

    e    4

    f    5

    g    6

    dtype: object

    >>> 

    默认情况下concat是在axis=0轴上工作的,生成一个新的Series。如果设定axis =1,就会生成一个DataFrame对象。

    >>> pd.concat((s1,s2,s3),axis=1)

         0    1    2

    a    0  NaN  NaN

    b    1  NaN  NaN

    c  NaN  2.0  NaN

    d  NaN  3.0  NaN

    e  NaN  4.0  NaN

    f  NaN  NaN  5.0

    g  NaN  NaN  6.0

    上面的情况,都是另外一条轴上没有重叠

    如果另外一条轴上有重叠的话,会发生什么呢?

    >>> s4

    a    00000

    b    11111

    f        5

    g        6

    dtype: object

    >>> pd.concat((s1,s4),axis =1)

         0      1

    a    0  00000

    b    1  11111

    f  NaN      5

    g  NaN      6

    默认是取并集的,如果是要取交集,只需要传入join = ‘inner’

    >>> pd.concat((s1,s4),axis =1,join='inner')

       0      1

    a  0  00000

    b  1  11111

    你可以通过join_axes指定要在其他轴上使用的索引。

    >>> pd.concat((s1,s4),axis =1,join_axes = (['a','c','b','e'],))

         0      1

    a    0  00000

    c  NaN    NaN

    b    1  11111

    e  NaN    NaN

    在连接轴上创建一个层次化索引。用keys参数。

    >>> 

    >>> result = pd.concat([s1,s1,s3],keys = ['one','two','three'])

    >>> result

    one    a    0

           b    1

    two    a    0

           b    1

    three  f    5

           g    6

    dtype: object

    如果定义axis的话,就会形成一个DataFrame对象,并且将keys作为列头。

    对于DataFrame也一样,只不过会生成层次化索引,默认是行索引。

    In [12]: df1 = DataFrame(np.arange(6).reshape(3,2),index = ['a','b','c'],columns = ['one','two'])

    In [13]: df2 =DataFrame(np.arange(4).reshape(2,2),index= ['a','c'],columns = ['three','four'])

    In [14]: df1

    Out[14]:

       one  two

    a    0    1

    b    2    3

    c    4    5

    In [15]: df2

    Out[15]:

       three  four

    a      0     1

    c      2     3

    In [16]: pd.concat([df1,df2],keys = ['item1','item2'])

    Out[16]:

             four  one  three  two

    item1 a   NaN  0.0    NaN  1.0

          b   NaN  2.0    NaN  3.0

          c   NaN  4.0    NaN  5.0

    item2 a   1.0  NaN    0.0  NaN

          c   3.0  NaN    2.0  NaN

    In [17]: pd.concat([df1,df2],keys = ['item1','item2'],axis = 1)

    Out[17]:

      item1     item2

        one two three four

    a     0   1   0.0  1.0

    b     2   3   NaN  NaN

    c     4   5   2.0  3.0

    如果传入的不是一个列表,而是一个字典,则字典的键就会被当做keys选项的值

    In [21]: pd.concat({'level1':df1,'level2':df2},axis =1)

    Out[21]:

      level1     level2

         one two  three four

    a      0   1    0.0  1.0

    b      2   3    NaN  NaN

    c      4   5    2.0  3.0

    此外,还有两个管理层次化索引创建方式的参数,name和levels

    连接轴上的索引与分析工作无关的话,可以用ignore_index忽略即可。

    In [25]: df1 = DataFrame(np.random.randn(3,4),columns=['a','b','c','d'])

    In [26]: df2 = DataFrame(np.random.randn(2,3),columns = ['b','d','a'])

    In [27]: pd.concat([df1,df2])

    Out[27]:

              a         b         c         d

    0 -0.859642 -0.637505 -0.830966  0.378526

    1 -0.614132  1.692308  0.600534 -0.879568

    2 -0.004405 -1.271789 -0.825860  0.528685

    0 -1.219479 -0.626997       NaN -2.449499

    1  0.366940  1.175266       NaN  0.434918

    In [28]: pd.concat([df1,df2],ignore_index = True)

    Out[28]:

              a         b         c         d

    0 -0.859642 -0.637505 -0.830966  0.378526

    1 -0.614132  1.692308  0.600534 -0.879568

    2 -0.004405 -1.271789 -0.825860  0.528685

    3 -1.219479 -0.626997       NaN -2.449499

    4  0.366940  1.175266       NaN  0.434918

    合并重叠数据:

    有索引或部分索引重叠的两个数据集。如果要合并这两个数据集,可用Series和DataFrame的combine_first方法

    In [32]: a = Series([np.nan,2.5,np.nan,3.5,4.5,np.nan],index = ['f','e','d','c','b','a'])

    In [33]: b =Series(np.arange((len(a)),dtype = np.float64),index = ['f','e','d','c','b','a'])

    In [34]: b[:-2]

    Out[34]:

    f    0.0

    e    1.0

    d    2.0

    c    3.0

    dtype: float64

    In [35]: a[2:]

    Out[35]:

    d    NaN

    c    3.5

    b    4.5

    a    NaN

    dtype: float64

    In [36]: b[:-2].combine_first(a[2:])

    Out[36]:

    a    NaN

    b    4.5

    c    3.0

    d    2.0

    e    1.0

    f    0.0

    dtype: float64

    In [37]: b

    Out[37]:

    f    0.0

    e    1.0

    d    2.0

    c    3.0

    b    4.0

    a    5.0

    dtype: float64

    In [38]: b.combine_first(a)

    Out[38]:

    f    0.0

    e    1.0

    d    2.0

    c    3.0

    b    4.0

    a    5.0

    dtype: float64

    In [39]: a.combine_first(b)

    Out[39]:

    f    0.0

    e    2.5

    d    2.0

    c    3.5

    b    4.5

    a    5.0

    dtype: float64

    combine_first方法可以给调用者的缺失值数据“打补丁”,即用被调用者的非na值代替调用者的缺失值。

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