在以前的版本中可以用如下方法：
1.软件安装：
双击install_protege.exe安装protege3.1；
双击graphviz-2.14.1.exe安装graphviz-2.14.1；
将owlseditor-build15.zip解压缩后拷贝到protege安装目录下的plugins中；
2.软件配置：
启动Protege，新建一个owl文件类型的工程，然后进入菜单project->configure选中了Owlstab，按确定后就打开了owl-s editor编辑视图.
进入菜单project->configure选中了OWLVizTab，按确定后就打开了OWLVizTab视图。在OWLVizTab视图中，有一个option选项，直接选择dot的位置进行设置。
在最新版本protege4.0中现在还是beta版本我至今还不知道怎么安装owl-s editor插件，无奈下只好装了protege3.2.1来使用，但是感觉4.0在使用上比较方便好用些，纯属各人感觉了 呵呵！owl-s editor没找见和4.0配套的，不知道以后还更新不。有知道这个的给留言啊，还是希望用4.0来做owl-s editor啊