杀掉lock进程最快的方法是重启mysql，像你这种情况，1000多sql锁住了，最好是重启
如果不允许重启，我提供一个shell脚本，生成 kill id命令杀掉lock线程，如下：
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#!/bin/bash
mysql -u root -e "show processlist"|grep -i "Locked" >> locked.txt;
for line in awk '{print $1}' locked.txt
do
echo "kill $line;">>kill_lock.sql
done
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执行完脚本后，会生成kill_lock.sql文件，内容类似如下：
kill 1;
kill 2;
kill 3;
-------------------这些对应的都是lock的sessionid，直接复制文件里的内容，然后在mysql里执行就ok 了
至于排查哪条sql引起的，这个有点难了，不过你可以尝试开启慢查日志和无索引日志来确认比较耗时的查询，避免再次出现堵塞