1．存储结构
MyISAM：每个MyISAM在磁盘上存储成三个文件，每一个文件的名字均以表名开始。扩展名支出文件类型。.frm文件存储表定义，.MYD（mydata）文件存储表的数据，.MYI（myindex）文件存储表的索引
InnoDB：所有的表都存储在一个数据文件中（也有可能是多个文件，或者是独立的表文件），InnoDB表的大小只受限于操作系统文件的大小，一般为2G
2．存储空间
MyISAM：可以被压缩，存储空间较小。支持三种不同的存储格式：静态表、动态表、压缩表
InnoDB：需要更多的内存和存储，会在主内存中建立其专用的缓冲池用来高速缓冲数据和索引，但是不支持全文索引
3．事务支持（事务的四大特性：原子性，一致性，隔离性，持久性）
MyISAM：强调的是性能，每次查询均具有原子性，其执行速度比InnoDB类型更快，但是不提供事务支持
InnoDB：提供事务支持，外部键等高级数据库功能，是具有事务（commit）、回滚（rollback）和崩溃修复功能（crash recovery capabilities）的事务安全（transcation-safe）型表
4．CURD增删改查操作（create，update，read，delete）
MyISAM:如果执行大量的select操作，MyISAM是更好的选择，因为不支持行级锁，但是在增删的时候效率就会差好多，因为MyISAM支持表级锁。相反的是InnoDB支持行级锁但是不支持表级锁，所以删除插入的时候只需要锁定行就行，效率比较MyISAM高。
InnoDB：如果执行大量的insert和update，处于对于性能的考虑，应该使用InnoDB。
Delete从性能上来看InnoDB更优秀，但是delete from table的时候，InnoDB不会重新建立表，而是一行一行的删除，所以在InnoDB表上如果要清空保存有大量数据的表，最好使用truncate table命令
5．外键
MyISAM：不支持
InnoDB：支持