无耻的转载一下别人的吧。
这个文件相当于一个应用程序量级的 全局文件，比如你想写一个变量在项目中的所有文件中都能读取是就写在这里面
Application["name"] = "zhangran";
在随便一个cs文件中可以 var name = Application["name"]; 来得到。
Session[''mySession"] = "yaoyaocheckout"; 也是类似。
另外该文件还可以一切启动时需要运行的代码，或者是事件。
详细看下文吧：
http://www.cnblogs.com/jianshao810/archive/2011/02/03/1948912.html