Hihocoder-1052-基因工程

Hihocoder-1052-基因工程

#1052 : 基因工程

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单点时限:1000ms

内存限制:256MB

描述

小Hi和小Ho正在进行一项基因工程实验。他们要修改一段长度为N的DNA序列，使得这段DNA上最前面的K个碱基组成的序列与最后面的K个碱基组成的序列完全一致。  

例如对于序列"ATCGATAC"和K=2,可以通过将第二个碱基修改为"C"使得最前面2个碱基与最后面两个碱基都为"AC"。当然还存在其他修改方法，例如将最后一个碱基改为"T"，或者直接将最前面两个和最后面两个碱基都修改为"GG"。

小Hi和小Ho希望知道在所有方法中，修改碱基最少的方法需要修改多少个碱基。

输入

第一行包含一个整数T(1 <= T <= 10)，代表测试数据的数量。

每组测试数据包含2行，第一行是一个由"ATCG"4个大写字母组成的长度为N(1 <= N <= 1000)的字符串。第二行是一个整数K(1 <= K <= N)。

输出

对于每组数据输出最少需要修改的碱基数量。

样例输入

2  
ATCGATAC  
2  
ATACGTCT
6 

样例输出

1  
3   

题解：

对字符串的处理，发现有个规律；

（1）， 当前k个字符和后k个字符没有相交， 则计算前后两串的不同字符的数量。 

（2）， 当有相交时候， 发现： 设string总长为 len， 要求的K长度的字符匹配， 那么， 前面部分的前缀为 len-k， 然后可以发现， 后面的字符都是这len-k的循环。

然后直接根据 len - k 这个循环节去count就ok了。

#include <iostream> 
#include <cstdio> 
#include <cstdlib> 
#include <cstring> 
using namespace std; 
const int MAXN = 1005; 

int main(){
	int test_num, k, cnt, elem, total, cur_max, len;  
	char st[MAXN]; 
	int vis[26]; 
	scanf("%d", &test_num); 
	while(test_num--){
		scanf("%s", &st); 
		scanf("%d", &k); 
		len = strlen(st); 
		cnt = 0; 
		if(len >= 2*k){
			for(int i=0; i<k; ++i){
				if(st[i] != st[len+i-k]){
					cnt++; 
				}
			}
		}else if(k >= len){
			cnt = 0;
		}else{
			elem = len - k; 
			for(int i=0; i<elem; ++i){
				memset(vis, 0, sizeof(vis)); 
				cur_max = 0; total = 0; 
				for(int j=i; j<len; j+=elem){
					vis[ st[j]-'A' ] += 1; 
					total++; 
					if(vis[ st[j]-'A' ] > cur_max){
						cur_max = vis[ st[j]-'A' ]; 
					}
				}
				cnt += (total - cur_max); 
			}
		}
		printf("%d
", cnt);
	}
	return 0; 
}