• K-近邻算法python实现


    内容主要来源于机器学习实战这本书。加上自己的理解。

    1.KNN算法的简单描写叙述

     K近期邻(k-Nearest Neighbor。KNN)分类算法能够说是最简单的机器学习算法了。

    它採用測量不同特征值之间的距离方法进行分类。

    它的思想非常easy:假设一个样本在特征空间中的k个最相似(即特征空间中最邻近)的样本中的大多数属于某一个类别。则该样本也属于这个类别。

    下图是大家引用的一个最经典演示样例图。

    比方上面这个图,我们有两类数据,各自是蓝色方块和红色三角形,他们分布在一个上图的二维中间中。

    那么假如我们有一个绿色圆圈这个数据,须要推断这个数据是属于蓝色方块这一类。还是与红色三角形同类。怎么做呢?我们先把离这个绿色圆圈近期的几个点找到。因为我们觉得离绿色圆圈近期的才对它的类别有推断的帮助。那究竟要用多少个来推断呢?这个个数就是k了。

    假设k=3。就表示我们选择离绿色圆圈近期的3个点来推断,因为红色三角形所占比例为2/3。所以我们觉得绿色圆是和红色三角形同类。假设k=5。因为蓝色四方形比例为3/5,因此绿色圆被赋予蓝色四方形类。从这里能够看到。k的值选取非常重要的。

     KNN算法中。所选择的邻居都是已经正确分类的对象。

    该方法在定类决策上仅仅根据最邻近的一个或者几个样本的类别来决定待分样本所属的类别。

    因为KNN方法主要靠周围有限的邻近的样本,而不是靠判别类域的方法来确定所属类别的。因此对于类域的交叉或重叠较多的待分样本集来说。KNN方法较其它方法更为适合。

           该算法在分类时有个基本的不足是。当样本不平衡时。如一个类的样本容量非常大。而其它类样本容量非常小时。有可能导致当输入一个新样本时。该样本的K个邻居中大容量类的样本占多数。

    因此能够採用权值的方法(和该样本距离小的邻居权值大)来改进。该方法的还有一个不足之处是计算量较大。由于对每个待分类的文本都要计算它到全体已知样本的距离。才干求得它的K个近期邻点。

    眼下经常使用的解决方法是事先对已知样本点进行剪辑,事先去除对分类作用不大的样本。

    该算法比較适用于样本容量比較大的类域的自己主动分类,而那些样本容量较小的类域採用这样的算法比較easy产生误分。

           总的来说就是我们已经存在了一个带标签的数据比对库,然后输入没有标签的新数据后。将新数据的每一个特征与样本集中数据相应的特征进行比較。然后算法提取样本集中特征最相似(近期邻)的分类标签。一般来说,仅仅选择样本数据库中前k个最相似的数据。

    最后,选择k个最相似数据中出现次数最多的分类。

    其算法描写叙述例如以下:

    1)计算已知类别数据集中的点与当前点之间的距离;

    2)依照距离递增次序排序;

    3)选取与当前点距离最小的k个点;

    4)确定前k个点所在类别的出现频率;

    5)返回前k个点出现频率最高的类别作为当前点的预測分类。

    二:python程序部分

    2.1 python导入数据

    def createDataSet(): 
        group = array([[1.0,1.1],[1.0,1.0],[0,0],[0,0.1]])
        labels = ['A','A','B','B']
        return group, labels
    


    创建了数据集和标签。

    依据上面说到的算法描写叙述中五个步骤K-近邻算法核心部分程序:

    def classify0(inX, dataSet, labels, k):
        dataSetSize = dataSet.shape[0]
        diffMat = tile(inX, (dataSetSize,1)) - dataSet  # tile :construct array by repeating inX dataSetSize times
        sqDiffMat = diffMat**2
        sqDistances = sqDiffMat.sum(axis=1) 
        distances = sqDistances**0.5  # get distance 
        sortedDistIndicies = distances.argsort()  # return ordered array's index    
        classCount={}          
        for i in range(k):
            voteIlabel = labels[sortedDistIndicies[i]]
            classCount[voteIlabel] = classCount.get(voteIlabel,0) + 1
        sortedClassCount = sorted(classCount.iteritems(), key=operator.itemgetter(1), reverse=True)
        return sortedClassCount[0][0] 
    


    不知道是不是编码设置问题,凝视没法写成中文,仅仅能是英文。

    K-近邻算法书上应用到了改进约会站点的配对效果上面详细流程:

    准备数据部分:从文本文件里解析数据,文本中说到3种特征:飞行里程、玩游戏时间、消费冰淇淋数量。我不知道作者为什么选择这三种特征,好像跟约会配对没什么毛关系。

    这部分用到非常多numpy中处理矩阵的函数。

    def file2matrix(filename):
        fr = open(filename)
        numberOfLines = len(fr.readlines())         #get the number of lines in the file
        returnMat = zeros((numberOfLines,3))        #prepare matrix to return
        classLabelVector = []                       #prepare labels return   
        fr = open(filename)
        index = 0
        for line in fr.readlines():
            line = line.strip() # delete character like tab or backspace 
            listFromLine = line.split('	')
            returnMat[index,:] = listFromLine[0:3] # get 3 features
            classLabelVector.append(int(listFromLine[-1])) # get classify result 
            index += 1
        return returnMat,classLabelVector

    处理数据中涉及到数据值的归一化。

    意思就是说上面约会配对有三个特征,可是会发现飞行距离这个数值远远大于其他两个,为了体现3个特征同样的影响力,对数据进行归一化。

    def autoNorm(dataSet):
        minVals = dataSet.min(0) # select  least value in column
        maxVals = dataSet.max(0)
        ranges = maxVals - minVals
        normDataSet = zeros(shape(dataSet))
        m = dataSet.shape[0]
        normDataSet = dataSet - tile(minVals, (m,1))
        normDataSet = normDataSet/tile(ranges, (m,1))   #element wise divide
        return normDataSet, ranges, minVals


    另外一个应用是在手写识别系统。

    类似于前面约会站点应用,准备数据时须要进行图像到向量转换,然后调用K-近邻的核心算法实现。

    以下是全部的代码综合和測试代码:主函数里加入了一些matplotlib绘图測试代码

    '''
    kNN: k Nearest Neighbors
    
    Input:      inX: vector to compare to existing dataset (1xN)
                dataSet: size m data set of known vectors (NxM)
                labels: data set labels (1xM vector)
                k: number of neighbors to use for comparison (should be an odd number)
                
    Output:     the most popular class label
    
    '''
    from numpy import *
    import operator
    from os import listdir
    import matplotlib
    import matplotlib.pyplot as plt
    
    
    def classify0(inX, dataSet, labels, k):
        dataSetSize = dataSet.shape[0]
        diffMat = tile(inX, (dataSetSize,1)) - dataSet  # tile :construct array by repeating inX dataSetSize times
        sqDiffMat = diffMat**2
        sqDistances = sqDiffMat.sum(axis=1) 
        distances = sqDistances**0.5  # get distance 
        sortedDistIndicies = distances.argsort()  # return ordered array's index    
        classCount={}          
        for i in range(k):
            voteIlabel = labels[sortedDistIndicies[i]]
            classCount[voteIlabel] = classCount.get(voteIlabel,0) + 1
        sortedClassCount = sorted(classCount.iteritems(), key=operator.itemgetter(1), reverse=True)
        return sortedClassCount[0][0] 
    
    def createDataSet(): 
        group = array([[1.0,1.1],[1.0,1.0],[0,0],[0,0.1]])
        labels = ['A','A','B','B']
        return group, labels
    
    def file2matrix(filename):
        fr = open(filename)
        numberOfLines = len(fr.readlines())         #get the number of lines in the file
        returnMat = zeros((numberOfLines,3))        #prepare matrix to return
        classLabelVector = []                       #prepare labels return   
        fr = open(filename)
        index = 0
        for line in fr.readlines():
            line = line.strip() # delete character like tab or backspace 
            listFromLine = line.split('	')
            returnMat[index,:] = listFromLine[0:3] # get 3 features
            classLabelVector.append(int(listFromLine[-1])) # get classify result 
            index += 1
        return returnMat,classLabelVector
        
    def autoNorm(dataSet):
        minVals = dataSet.min(0) # select  least value in column
        maxVals = dataSet.max(0)
        ranges = maxVals - minVals
        normDataSet = zeros(shape(dataSet))
        m = dataSet.shape[0]
        normDataSet = dataSet - tile(minVals, (m,1))
        normDataSet = normDataSet/tile(ranges, (m,1))   #element wise divide
        return normDataSet, ranges, minVals
       
    def datingClassTest():
        hoRatio = 0.50      #hold out 10%
        datingDataMat,datingLabels = file2matrix('E:PythonMachine Learning in ActiondatingTestSet2.txt')       #load data setfrom file
        normMat, ranges, minVals = autoNorm(datingDataMat)
        m = normMat.shape[0]
        print m
        numTestVecs = int(m*hoRatio)
        errorCount = 0.0
        for i in range(numTestVecs):
            classifierResult = classify0(normMat[i,:],normMat[numTestVecs:m,:],datingLabels[numTestVecs:m],3)
            print "the classifier came back with: %d, the real answer is: %d" % (classifierResult, datingLabels[i])
            if (classifierResult != datingLabels[i]): errorCount += 1.0
        print "the total error rate is: %f" % (errorCount/float(numTestVecs))
        print errorCount
    def classifyperson():
        resultList = ['not at all','in small doses','in large doses']
        percentTats = float(raw_input('percentage time spent on games ?'))
        ffmiles = float(raw_input('frequent flier miles per year?

    ')) iceCream = float(raw_input('liters of ice cream consumed each year?')) datingDataMat,datingLabels = file2matrix('E:PythonMachine Learning in ActiondatingTestSet2.txt') #load data setfrom file normMat, ranges, minVals = autoNorm(datingDataMat) inArr = array([ffmiles,percentTats,iceCream]) classifierResult = classify0((inArr-minVals)/ranges,normMat,datingLabels,3) print "your probably like this person :" , resultList[classifierResult-1] def img2vector(filename): returnVect = zeros((1,1024)) fr = open(filename) for i in range(32): lineStr = fr.readline() for j in range(32): returnVect[0,32*i+j] = int(lineStr[j]) return returnVect def handwritingClassTest(): hwLabels = [] trainingFileList = listdir('E:/PythonMachine Learning in Action/trainingDigits') #load the training set m = len(trainingFileList) trainingMat = zeros((m,1024)) for i in range(m): fileNameStr = trainingFileList[i] fileStr = fileNameStr.split('.')[0] #take off .txt classNumStr = int(fileStr.split('_')[0]) hwLabels.append(classNumStr) trainingMat[i,:] = img2vector('E:/PythonMachine Learning in Action/trainingDigits/%s' % fileNameStr) testFileList = listdir('E:/PythonMachine Learning in Action/testDigits') #iterate through the test set errorCount = 0.0 mTest = len(testFileList) for i in range(mTest): fileNameStr = testFileList[i] fileStr = fileNameStr.split('.')[0] #take off .txt classNumStr = int(fileStr.split('_')[0]) vectorUnderTest = img2vector('E:/PythonMachine Learning in Action/testDigits/%s' % fileNameStr) classifierResult = classify0(vectorUnderTest, trainingMat, hwLabels, 3) print "the classifier came back with: %d, the real answer is: %d" % (classifierResult, classNumStr) if (classifierResult != classNumStr): errorCount += 1.0 print " the total number of errors is: %d" % errorCount print " the total error rate is: %f" % (errorCount/float(mTest)) if __name__=='__main__': #classifyperson() datingClassTest() dataSet, labels = createDataSet() testX = array([1.2, 1.0]) k = 3 outputLabel = classify0(testX, dataSet, labels, 3) print "Your input is:", testX, "and classified to class: ", outputLabel testX = array([0.1, 0.3]) outputLabel = classify0(testX, dataSet, labels, 3) print "Your input is:", testX, "and classified to class: ", outputLabel handwritingClassTest() datingDataMat,datingLabels = file2matrix('E:PythonMachine Learning in ActiondatingTestSet2.txt') print datingDataMat print datingLabels[0:20] fig = plt.figure() ax = fig.add_subplot(111) ax.scatter(datingDataMat[:,1],datingDataMat[:,2],15.0*array(datingLabels),15.0*array(datingLabels)) plt.show()


    这里要注意:

     trainingFileList = listdir('E:/PythonMachine Learning in Action/trainingDigits')      

    调用这个函数时路径写法。假设不想复杂指定路径简单就把目录和knn.py文件放在一起。



     

     

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