• Spark调研笔记第6篇


    本文主要记录我使用Spark以来遇到的一些典型问题及其解决的方法,希望对遇到相同问题的同学们有所帮助。

    1. Spark环境或配置相关

    Q: Sparkclient配置文件spark-defaults.conf中,spark.executor.memory和spark.cores.max应该怎样合理配置?
    A: 配置前,须要对spark集群中每一个节点机器的core和memory的配置有基本了解。比方由100台机器搭建的spark集群中。每一个节点的配置是core=32且memory=128GB,那么,向该集群提交应用时,应注意cores.max和executor.memory配置的”和谐”。详细而言,须要先预估应用涉及到的数据量和计算量。然后最大限度压榨单机core和memory,尽量避免core和memory配置比例失衡的情况。


    举个样例,若某个应用配置了cores.max=1000且executor.memory=512m。则这个配置比例明显不合理,由于每一个节点仅仅有32个cores,1000个cores须要占用集群32台机器,而每一个executor(即集群中的每一个节点)仅仅申请512MB内存,也即该应用占用的32台机器的所有cores。但仅仅占用0.5G*32=16GB内存,这意味着剩余的(128G-0.5G)*32=4080GB内存被浪费了。


    总之。合理的配置应该是在保证cores和memory都尽可能少的情况下。使得spark计算速度能满足业务需求。实际配置时,可将memory配置为机器最大阈值,cores的数目按实际计算量合理设定。尽量降低任务占用的节点数。

    Q:
    关于数据源与spark集群的问题,考虑这样的场景对spark性能的影响:数据源在位于南方的hdfs集群上,而spark集群位于北方机房。
    A: 数据源集群与spark计算集群物理距离较远的情况下,spark读入数据时会由非常大网络开销,对作业执行速度影响非常明显。因此,搭建集群时,要尽量让spark集群靠近数据源。



    Q:
    提交任务后。执行报错"spark java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space",怎样处理?
    A: 这个错误的引发原因较多,比方代码中global变量太大(如载入了大字典)或rdd.collect()太大。Spark的调度逻辑对transformations operations是lazy evaluation策略,即仅仅有遇到action operations时才会计算整个job chain上涉及到的transformations和action,而actions的输出假设不是写磁盘,就会输出到driver program,典型如sparkclient所在机器的终端。driver 的jvm默认heap space是数百MB,无法hold住由action返回的大数据集时。就会报OOM
    解决思路有2个:一个思路是改动代码逻辑。比方将超大变量拆分成多个变量后多步运行(如将大dict或set拆分成N个小的,每步运行完后,销毁当前的变量并构造新变量)。这个思路是典型的时间换空间。只是有时候业务逻辑不一定能做这样的拆分处理;还有一个思路是提交spark应用前。合理配置相关參数,如在spark-defaults.conf中添加配置项spark.driver.memory 12G。详细配置思路能够參考StackOverflow的这篇帖子

    Q:
    提交任务时sparkclient报错"No space left on device",例如以下图所看到的,怎样解决?
    A: 这是因为任务执行过程中。Sparkclient可能会在本机写暂时文件,默认情况下。它会写到/tmp文件夹,非常easy写满/tmp。从而导致报错。
    解决方法是在Sparkclientspark-defaults.conf中明白指定暂时文件的写入路径:
    spark.local.dir /home/slvher/tools/spark-scratch

    Q: Sparkclient提交任务后。spark job的日志默认是输出到console的。与用户print的调试日志混到一起,不方便调试。怎样配置使spark的内部日志单独打印到文件?
    A: Spark借助log4j打印日志。而log4j的打印行为能够通过在conf文件夹创建log4j.properties并进行配置来控制(建议拷贝conf/log4j.properties.template为log4j.properties来配置log4j的打印行为),详细配置方法能够參考log4j的官网文档,这里不赘述。

    2. Spark应用编程相关

    Q: 考虑这样的场景:待提交的Application包括多个python files,当中一个是main入口。其他都是自己定义的module files且它们之间有依赖关系,通过spark-submit(已用--py-files參数指定要上传的文件)提交任务时。报错"ImportError: No module named xxx",怎样解决?
    A: 通过--py-files參数上传的.py文件仅仅是上传而已,默认不会在集群节点python环境中将在这些文件里定义的module(s)增加解释器的search path。Spark文档Submiiting Applications事实上对这样的场景下提交任务的方式做了说明:
    For Python, you can use the --py-files argument of spark-submit to add .py, .zip or .egg files to be distributed with your application. If you depend on multiple Python files we recommend packaging them into a .zip or .egg.
    所以,正确的提交方法是,将除main入口以外的.py文件做成package(将这些文件放到某个文件夹下,并在该文件夹创建名为__init__.py的空文件)并打包成zip archives,然后通过--py-files上传这个zip包。

    由于python解释器默认能够处理zip archives的import场景,且由于上传的zip是个包括__init__.py的package。故集群节点机器上的python解释器会自己主动把它们增加对module的搜索路径中,这样就攻克了Import Error的问题。



    Q: 怎样查看函数中通过print打印的调试信息?
    A: Spark应用在传给spark operations api的函数中print的调试信息在本地driver program端是看不到的,由于这些函数是在集群节点上运行的。故这些print信息被打印到了为作业分配的节点机器上,须要从spartk master的http查看接口找到提交的应用,然后去应用运行节点的stderr中看看。

    Q: PySpark的API中。map和flatMap有何差别?
    A: 从函数行为来看。它们都是接受一个自己定义函数f,然后对RDD中的每一个元素调用这个函数。关键差别在于自己定义函数f的类型:map接受的函数返回一个普通value;而flatMap接受的函数必须返回一个iterable value,即返回值必须可用于迭代,然后flatMap会对这个iterable value做flat操作(迭代这个value并flat成list)。能够借助以下的demo来理解。

    在spark集群上的运行结果例如以下:

    以下对输出的每行结果稍做解释:
    a. 代码第18行,rdd.flatMap接受的函数參数是test_flatmap_v1,而后者返回值是一个可迭代的generator object。故flatMap对返回值做flat操作后。generator object的每一个element作为终于flattened结果的element。


    b. 代码第19行,rdd.flatMap接受的函数參数是test_flatmap_v2,而后者返回值一个set。因为这个set本身是iterable的,故flatMap对set做flat操作后,set中的每一个element做完终于flattened结果的element。
    特别注意:若return的value不支持iterate(如int型),则flatMap会不错。

    感兴趣的话。能够亲自试验下。


    c. 代码第20行,因为map不要求其函数參数的返回值是否iterable,也不会对iterable的value做flat操作。它仅仅是将return value本身作为终于结果的一个element,因此它的输出结果也就非常easy理解了。



    Q: 对rdd运行cache有何注意事项?
    A: 关于rdd persist对性能优化的原理。能够查看这里Persisting RDD in Spark。但并非全部的persist/cache操作都与spark性能正相关。在persist前,最好遵循以下的原则:
    a) rdd会被多次使用时再考虑cache
    b) rdd需cache时。尽量对"靠近"算法的rdd做cache,而不要cache读入的raw数据
    c) cache的rdd不再使用时。尽快调用unpersist释放其占用的集群资源(主要是memory) 

    Q: 怎样在传给spark transformations操作的函数中訪问共享变量?
    A: 依据官网Programming Guide文档说明(參见这里),当作为參数传给spark操作(如map或reduce)的函数在远程机器的节点上运行时,函数中使用到的每一个变量的副本(separate copies)也会被复制到这些节点上以便函数訪问。假设这些变量在节点上被改动,那这些改动不会被反传回spark driver program,即在实现业务代码时。应由实现者保证这些变量的仅仅读特性。由于在不同任务间维护通用的、支持读/写的共享变量会减少spark效率。
    举个样例,以下的代码说明了怎样在传给spark操作的函数中借助全局变量实现共享訪问:


    Q: 除通过global variable共享变量外。spark还支持什么方式共享变量?
    A: Spark还支持broadcast变量和accumulators这两种共享变量的方式。当中。broadcast同意开发人员在spark集群的每一个节点上保持变量的一份仅仅读cache,本质上,broadcast变量也是global变量,仅仅只是它是由开发人员显式分发到集群节点上的,而非spark依据每一个task调用的函数对变量的訪问情况自己主动拷贝。至于accumulators。顾名思义,它仅仅支持add操作,详细语法可參考spark programming guide关于accumulators部分的说明。

    Q: broadcast变量与普通global变量有何关系?各自的适用场合?
    A: 实际上。broadcast变量是一种global变量,它们均能够实如今分布式节点中运行函数时共享变量。当中,普通global变量是随着spark对task的调度依据实际情况由spark调度器负责拷贝至集群节点的,这意味着若有需訪问某global变量的多个task运行时,每一个task的运行均有变量拷贝过程。而broadcast变量则是由开发人员主动拷贝至集群节点且会一直cache直至用户主动调用unpersist或整个spark作业结束。
    PS: 实际上。即使调用unpersist也不会马上释放资源。它仅仅是告诉spark调度器资源能够释放。至于何时真正释放由spark调度器决定。參见SPARK-4030
    结论:若共享变量仅仅会被某个task使用1次,则使用普通global变量共享方式就可以。若共享变量会被先后运行的多个tasks訪问,则broadcast方式会节省拷贝开销。
    再次提醒:若使用了broadcast方式共享变量,则开发人员应在确定该变量不再须要共享时主动调用unpersist来释放集群资源。

    3. 其他注意事项
    Q:
    还有其它注意事项吗?
    A: 上面提到的仅仅是最常见的问题。实际编写复杂Spark应用时,怎样高效利用spark集群的其他注意事项。强烈推荐參考Notes on Writing Complex Spark Applications这篇文章(Google Docs需翻墙訪问)。


    【參考资料】
    1. StackOverflow: spark java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space
    2. Spark Doc: Submitting Applications
    3. Spark Programming Guide: Shared Variables
    4. Spark Issues: [SPARK-4030] "destroy" method in Broadcast should be public
    5. [GoogleDoc] Notes on Writing Complex Spark Applications

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