使用mpich搭建MPI集群
1. 下载mpich
wget http://www.mpich.org/static/downloads/3.3/mpich-3.3.tar.gz
2. 解压
tar xzf mpich-3.3.tar.gz
3. 创建mpi的安装路径
/home/omnisky/xy/MPI
4. 进入解压后文件
cd mpich-3.3
5. 指定安装文件夹
./configure --prefix=/home/omnisky/xy/MPI --disable-fortran
6. 构建make文件并运行makefile进行安装
sudo make
sudo make install
7. 配置.bashrc
vim ~/.bashrc
写入:
export MPI_ROOT=/home/omnisky/xy/MPI
export PATH=$MPI_ROOT/bin:$PATH
8. source一下
source ~/.bashrc
9. 测试mpihello.c
编译:mpicc -o mpihello mpihello.c
运行:
至此,单机(150机器)配置完毕。
集群:
1. 修改150上的用户名
vim /etc/hostname
修改为master
2. 修改hosts文件
3. 配置免密
ssh-keygen
cd ~/.ssh
cat id_rsa.pub >> authorized_keys
chmod 600 authorized_keys
scp authorized_keys omnisky@192.168.207.122:/home/omnisky/.ssh/.
ssh 192.168.207.122 #(若是找不到用户名:ssh 用户名@192.168.207.122)
登陆成功即可
4. 编写servers文件(servers只需要放在运行程序的主节点就可以,是一个配置文件)
vim servers
运行如下:
这里:(冒号)后边数字意思是CPU核数,比如上边设置为2,在后边的mpirun命令中如果要创建4个进程,就会在master上先创建2个进程,然后再在omnisky上创建2个进程。
使用MPI运行矩阵代码:
参考程序: