先说结论：
（1）php-fpm.conf（或者其他conf文件）中的配置优先级高于php.ini，即在php服务运行时，php-fpm的配置会覆盖php.ini中的相同的配置。
但是： disable_functions 或者 disable_classes 在 php.ini 之中定义的值不会被覆盖掉，但是会将新的设置附加在原有值的后面。
（2）php-fpm.conf（或者其他conf文件）中使用 php_admin_value 或者 php_admin_flag 定义的值，不能被 PHP 代码中的 ini_set() 覆盖。
（3） ini_set() 可以修改php.ini定义好的配置，如运行内存限制值
即在大部分配置上，优先级是：php-fpm.conf > ini_set( ) > php.ini
如php运行内存限制，假设在php.ini中设置memory_limit = 256M，而在php-fpm配置中设置php_admin_value[memory_limit] = 64M，那么phpinfo()显示的内存限制会是64M，256M的配置是没有生效的。
更新php.ini或者php-fpm.conf后要重启相应服务。
PS：phpinfo()得到的配置信息，就是当前服务的信息。