前提：HDFS fsck确保hbase根目录下文件没有损坏丢失，如果有，则先进行corrupt block移除。
切记：一定要在所有Region都上线之后再修复，否则修复之后可能出现重复Region。
步骤1. hbase hbck 检查输出所有ERROR信息，每个ERROR都会说明错误信息。
步骤2. hbase hbck -fixTableOrphans 先修复tableinfo缺失问题，根据内存cache或者hdfs table 目录结构，重新生成tableinfo文件。
步骤3. hbase hbck -fixHdfsOrphans 修复regioninfo缺失问题，根据region目录下的hfile重新生成regioninfo文件。
步骤4. hbase hbck -fixHdfsOverlaps 修复region重叠问题，merge重叠的region为一个region目录，并从新生成一个regioninfo。
步骤5. hbase hbck -fixHdfsHoles 修复region缺失，利用缺失的rowkey范围边界，生成新的region目录以及regioninfo填补这个空洞。
步骤6. hbase hbck -fixMeta 修复meta表信息，利用regioninfo信息，重新生成对应meta row填写到meta表中，并为其填写默认的分配regionserver。
步骤7. hbase hbck -fixAssignments 把这些offline的region触发上线，当region开始重新open 上线的时候，会被重新分配到真实的RegionServer上 , 并更新meta表上对应的行信息。
其他hbase修复集群命令：
新版本的 hbck 可以修复各种错误，修复选项是：
（1）-fix，向下兼容用，被-fixAssignments替代
（2）-fixAssignments，用于修复region assignments错误
（3）-fixMeta，用于修复meta表的问题，前提是HDFS上面的region info信息有并且正确。
（4）-fixHdfsHoles，修复region holes（空洞，某个区间没有region）问题
（5）-fixHdfsOrphans，修复Orphan region（hdfs上面没有.regioninfo的region）
（6）-fixHdfsOverlaps，修复region overlaps（区间重叠）问题
（7）-fixVersionFile，修复缺失hbase.version文件的问题
（8）-maxMerge <n> （n默认是5），当region有重叠是，需要合并region，一次合并的region数最大不超过这个值。
（9）-sidelineBigOverlaps ，当修复region overlaps问题时，允许跟其他region重叠次数最多的一些region不参与（修复后，可以把没有参与的数据通过bulk load加载到相应的region）
（10）-maxOverlapsToSideline <n> （n默认是2），当修复region overlaps问题时，一组里最多允许多少个region不参与
由于选项较多，所以有两个简写的选项
（11） -repair，相当于-fixAssignments -fixMeta -fixHdfsHoles -fixHdfsOrphans -fixHdfsOverlaps -fixVersionFile -sidelineBigOverlaps
（12）-repairHoles，相当于-fixAssignments -fixMeta -fixHdfsHoles -fixHdfsOrphans
新版本的 hbck
（1）缺失hbase.version文件
加上选项 -fixVersionFile 解决
（2）如果一个region即不在META表中，又不在hdfs上面，但是在regionserver的online region集合中
加上选项 -fixAssignments 解决
（3）如果一个region在META表中，并且在regionserver的online region集合中，但是在hdfs上面没有
加上选项 -fixAssignments -fixMeta 解决，（ -fixAssignments告诉regionserver close region），（ -fixMeta删除META表中region的记录）
（4）如果一个region在META表中没有记录，没有被regionserver服务，但是在hdfs上面有
加上选项 -fixMeta -fixAssignments 解决，（ -fixAssignments 用于assign region），（ -fixMeta用于在META表中添加region的记录）
（5）如果一个region在META表中没有记录，在hdfs上面有，被regionserver服务了
加上选项 -fixMeta 解决，在META表中添加这个region的记录，先undeploy region，后assign
（6）如果一个region在META表中有记录，但是在hdfs上面没有，并且没有被regionserver服务
加上选项 -fixMeta 解决，删除META表中的记录
（7）如果一个region在META表中有记录，在hdfs上面也有，table不是disabled的，但是这个region没有被服务
加上选项 -fixAssignments 解决，assign这个region
（8）如果一个region在META表中有记录，在hdfs上面也有，table是disabled的，但是这个region被某个regionserver服务了
加上选项 -fixAssignments 解决，undeploy这个region
（9）如果一个region在META表中有记录，在hdfs上面也有，table不是disabled的，但是这个region被多个regionserver服务了
加上选项 -fixAssignments 解决，通知所有regionserver close region，然后assign region
（10）如果一个region在META表中，在hdfs上面也有，也应该被服务，但是META表中记录的regionserver和实际所在的regionserver不相符
加上选项 -fixAssignments 解决
（11）region holes
需要加上 -fixHdfsHoles ，创建一个新的空region，填补空洞，但是不assign 这个 region，也不在META表中添加这个region的相关信息
（12）region在hdfs上面没有.regioninfo文件
-fixHdfsOrphans 解决
（13）region overlaps
需要加上 -fixHdfsOverlaps
说明：
（1）修复region holes时，-fixHdfsHoles 选项只是创建了一个新的空region，填补上了这个区间，还需要加上-fixAssignments -fixMeta 来解决问题，（ -fixAssignments 用于assign region），（ -fixMeta用于在META表中添加region的记录），
所以有了组合拳 -repairHoles 修复region holes，相当于-fixAssignments -fixMeta -fixHdfsHoles -fixHdfsOrphans
（2） -fixAssignments，用于修复region没有assign、不应该assign、assign了多次的问题
（3）-fixMeta，如果hdfs上面没有，那么从META表中删除相应的记录，如果hdfs上面有，在META表中添加上相应的记录信息
（4）-repair 打开所有的修复选项，相当于-fixAssignments -fixMeta -fixHdfsHoles -fixHdfsOrphans -fixHdfsOverlaps -fixVersionFile -sidelineBigOverlaps
新版本的hbck从（1）hdfs目录（2）META（3）RegionServer这三处获得region的Table和Region的相关信息，根据这些信息判断并repair
借鉴：https://www.cnblogs.com/quchunhui/p/9583746.html
https://blog.csdn.net/liliwei0213/article/details/53639275