现在官方的Cocos Studio已经支持打包apk文件，写该随笔的时候还没试过官方的打包功能，所以就按自己的学习顺序先把打包的心得写下。
问题及最终解决方案：
其中耗时最长的问题就是ndk-r10改成ndk-r9d后一直编译不通过；
最终解决办法是删除项目路径下/proj.android/obj/local/armeabi目录下的所有文件。(当时因为使用cocos2dx2.2.3版本源码学习才遇到该问题，可能cocos2dx最新版本已无该问题)。
另外发现其他编译出错，如No rule to make target，也可以删除该目录试试。
发现问题过程：
初学Cocos2dx，了解了下windows平台编译android包的流程：
1.需要以下软件包：
1) adt(eclipse集成环境可用于编译android项目)
2) ndk(一系列工具可按linux下makefile格式编译c和c++的动态库，然后自动将so和java应用打包为apk)
3) cygwin(提供windows下可用的linux命令，如make，这些命令用于ndk的编译工作，Cygwin还有很多其他作用，因为这里只是供ndk使用，所以不赘述)
笔者当初下载Cygwin的时候是2.87(x64)版本，使用的163的镜像，下完发现如果全安装需要20多G的硬盘空间。后来通过查资料知道供ndk使用只需要将Devel点为install，其他都为default即可。
第一次笔者使用的ndk版本是r10，后来有问题改为r9d。
2.添加环境变量
1) 在系统环境变量PATH中追缴加Cygwin\bin;
2) 新建环境变量NDK_ROOT，值为ndk所在路径
添加完后就可以编译了。笔者此时编译的时候遇到一个问题(对于比较干净的系统应该不会遇到这个问题)，提示我出错，错误信息如下：
ERROR: You are using a non-Cygwin compatible Make program.
Currently using: C:/MinGW/bin/make
To solve the issue, follow these steps:
1. Ensure that the Cygwin 'make' package is installed.
NOTE: You will need GNU Make 3.81 or later!
2. Define the GNUMAKE environment variable to point to it, as in:
export GNUMAKE=/usr/bin/make
3. Call 'ndk-build' again.
开始查了半天没找到解决方法，后来仔细看发现Currently using:C:/MinGW/bin/make。这个make并不是Cygin/bin下面的make，然后我想起来之前配置eclipse c++环境使用了MINGW，暂时从Path中删除该值，问题解决。
3.编译及运行
此时编译成功，于是拿着我的android跑跑看看，结果一运行程序立刻停止响应，从LogCat看到的错误:
SharedLibrary : libcocos2dcpp.so undefined reference to 'rand'
网上查查发现大多数使用r10都有这个问题，没有实际的解决方案，于是重新下载了ndk r9d的包，修改NDK_ROOT环境变量后再次编译，这次的结果是编译不通过，编译的时候就报上面的rand错误。仔细检查后发现编译的时候虽然开始提示是用的r9d的环境，但是编译还是会用到r10的路径，不知道为什么。于是把r10移动到其他地方，然后把项目路径下/proj.android/obj/local/armeabi目录清空。再次编译，程序终于可以正常运行在Android手机上了。
其他解决方法：
1.重装系统后，有可能编译失败，大多是因为重装系统后一些文件夹没有读写权限造成的，这时可以删除proj.android目录下的一些临时文件夹试试（包括assets,bin,libs,obj,res）。
2.有一些权限问题怎么删除文件都无法解决的，可以修改"build_native.sh"
第60行：
cp -rf "$file" "$APP_ANDROID_ROOT"/assets
-->cp -rfp "$file" "$APP_ANDROID_ROOT"/assets
第64行：
cp "$file" "$APP_ANDROID_ROOT"/assets
--> cp -p "$file" "$APP_ANDROID_ROOT"/assets
引用自：http://www.oschina.net/question/1252613_137222