java -jar proguardgui.jar [-nosplash][configuration_file]
-nosplash参数：运行ProGuard时不显示开头动画。
configuration_file： ProGuard运行时加载的配置文件（如果你已经有一个通用的Proguard的配置文件，在这里调用，再针对项目做些修改）。
Input/Output标签：
这里选择需要混淆的代码目录和输出混淆后代码的目录以及项目所有需要的lib包。需混淆的代码可以已jar、war、ear、zip等格式打包，或者直接指定代码目录（此时注意要指定到代码的最上成package所在目录）。
“Add Input”添加需要混淆的代码。
“Add Output”指定输出路径和格式
“Edit”编辑设定
“Filter”过滤不需要的文件和包
“Remove”删除不需要的文件和包
“Move Up”“Move Down”将设定移动显示位置
“Move to libraries”移动到项目所需要的lib中
“Move to program”移动到项目中
下部的“Add”为添加项目所需要的lib包，如果是web项目把j2ee包也添加到lib中。
Shrinking、Optimization标签：
Proguard可以压缩和优化代码，将一些无用 类、字段和方法删除和优化代码。这里就不多说，
主要解释下Obfuscation标签。
“obfuscate”选上混淆机制才可用。
“Print mapping”输出映射文件，混淆前后的类名、方法名，属性名的对照。
“Apply mapping”应用映射文件，可以指定混淆后的类名、方法名，属性名。
“Obfuscation dictionary”混淆字典，指定混淆使用的字符。
“Overlord aggressively”优先重载
“Use unique class member names”使用唯一的类成员名称
“Default package”默认包名
“Use mixed-case class names”使用混合的类名，这样不同的类混淆后将使用同一类名。
“Keep attributes”指定需要保留属性的资源文件
“Rename SourceFile attribute”重命名资源文件属性
“Keep names”保留的名称
“Native method names”本地方法名称
“.class method names”指定需要保存方法名称的类
“Keep additional class names and class member names”保留（不需要混淆）的类名和成员名
点击“Add”或“Edit”编辑需要保留的类
“Comments”文本域可以对当前条目加上可选的注释。这个注释将标识列表中的这个条目并作为注释出现在配置文件中
“Keep classes and class members”保留类名和成员名
“Keep class members only”只保留成员名
“Keep classes and class members, if members are present”
“Access”访问修饰符，指定需要保留类的修饰符
“Class”指定类名，可以用“*”通配符进行指定比如“*Number*”
“Extends/implements class”继承和实现的类，此处需要指定类的完整路径，包括包名。
“Class members”要保留的成员
“Add field”添加需要保留的属性，通过指定修饰符，类型和名称来配置。
“Add method”添 加需要保留的属方法，通过指定修饰符，返回类型和名称来配置
Information（参数信息）标签：
“Consistency and correctness”连贯性和正确性
“Print seeds”打印日志
“verbose”详细信息
“Warn about missing libraries”缺少类库时发出警告
“Ignore warnings about missing libraries”忽略缺少类库的警告，有时缺少某些类库也可以混淆，Proguard提倡先消除所有的警告，然后混淆。
“Skip non-public library classes”跳过所有非公有类，加快加载lib速度。
“Skip non-public library class members”跳过所有非共有方法，加快解析lib速度
“Why are u keeping”
Process标签：
“View configuration”查看配置
“Save configuration”保存配置
Retrace（反追踪）标签
简单说下keep参数，这个是设定要保留不参与混淆的类和成员。
keepclass_specification保留指定的类和成员名称和内容
keepclassmembersclass_specification只保留指定的类成员名称和内容
keepclasseswithmembersclass_specification
keepnamesclass_specification保留类和成员名称，混淆内容
keepclassmembernamesclass_specification只保留成员名称，混淆内容
keepclasseswithmembernames class_specification
在使用过程中，我比较 喜欢建立几个抽象类，Keep，KeepClassMembers，
KeepClassesWithMembers，KeepNames，KeepClassMemberNames，
KeepClassesWithMemberNames，把需要混淆的核心代码单独打包，需要保留特定属性的类分别继承各个方法，这样设定混淆配置时就比较容易。