• 用Cython加速Python程序以及包装C程序简单测试


    用Cython加速Python程序

    我没有拼错,就是Cython,C+Python=Cython!
    我们来看看Cython的威力,先运行下边的程序:

    import time
    
    def fib(n):
        if n==0:
            return 0
        if n==1:
            return 1
        return fib(n-1)+fib(n-2)
    t=time.time()
    print(fib(40))
    print(time.time()-t)
    
    $ python fib.py
    102334155
    59.367255449295044
    

    在我的渣渣笔记本上,用时59.3秒,差不多一分钟。当然,在你那可能比我快一点,这也很正常。
    好了,我们再试试Cython:

    $ cython fib.py --embed     
    $ gcc -O3 fib.c -I /usr/include/python3.5m/ -lpython3.5m
    $ ./a.out  
    102334155  
    14.487313747406006
    

    嗯,快了那么一点点,4倍左右;我解释一下前边的几句代码:
    首先,用cython命令把python生成c文件,也就是cython fib.py会生成一个fib.c的文件
    --embed参数就是自动生成一个main函数,以便让gcc生成可执行程序。
    接下来就是用gcc把fib.c编译成了个a.out程序,运行之,结果快了4倍(从60秒减少到15秒以内)。
    当然,这只是小试牛刀,区区4倍而已,这也太少了!
    接下来我吧这个文件复制成fib.pyx,并修改了一句代码:

    import time
    
    cdef int fib(int n):
        if n==0:
            return 0
        if n==1:
            return 1
        return fib(n-1)+fib(n-2)
    t=time.time()
    print(fib(40))
    print(time.time()-t)
    

    我只改了1句,就是把 def fib(n):改成了 cdef int fib(int n):,也就是加了一个类型,下边让我们见证奇迹:

    $ cython fib.pyx --embed
    $ gcc -O3 fib.c -I /usr/include/python3.5m/ -lpython3.5m 
    $ ./a.out 
    102334155
    0.45729994773864746
    

    没有看错,现在只需要0.45秒!性能提升了132倍。
    这个0.45秒算是什么样的速度呢?下边,我照猫画虎,写了基本相同的一段C程序:
    #include "stdio.h"
    #include "time.h"

    static int fib(int n){
        if(n==0)
                return 0;
        if(n==1)
                return 1;
        return fib(n-1)+fib(n-2);
    }
    int main(){
        clock_t t=clock();
        printf("%d
    ",fib(40));
        printf("%f sec
    ",(clock()-t)/1000.0/1000.0);
    }
    

    这个跟python写的基本一模一样,只是换成了C语法,然后:

    $ gcc -O3 fib.c  
    $ ./a.out  
    102334155  
    0.452981 sec  
    

    天,只比刚才Cython的程序慢了0.005秒(我觉得这已经是误差了)
    是不是感觉Cython碉堡了?(基本用Python的语法,实现了C的速度。
    其实,这才刚刚开始。毕竟虽然Python代码写起来比C溜好多,但以前的C代码怎么办?并且,一些C实现的算法
    用Cython改写也不是特别方便,能不能直接拿来就用呢?当然能,并且也可以很6。
    比如上边的那个fib函数,我已经用C写完了,怎么整合到Python里边呢?
    首先,我先把C里边的main函数去掉,改成下边的样子:

    #include "stdio.h"
    #include "time.h"
    
    static int fib(int n){
        if(n==0)
                return 0;
        if(n==1)
                return 1;
        return fib(n-1)+fib(n-2);
    }
    

    其实这时,我们已经可以用gcc编译成一个链接库,用ctypes调用了,然而在Cython看来,
    这太(调)不(用)清(麻)真(烦),我们只需要2句代码:

    cdef extern from "fib.c": 
        int fib(int)
    
    def fibf(n):
        return fib(n)
    

    虽然是4行,其实也就是2句无疑:)
    第一句我先把fib函数从C文件里边导入,然后又定义了一个fibf的函数,把导进来的函数又调用了一下。
    cdef的作用,就是把外部函数导出为cython能调用的函数,def的作用就是定义python能调用的函数了。
    把这个文件保存成fibf.pyx,然后:

    cython fibf.pyx
    gcc fibf.c -shared -fPIC -I /usr/include/python3.5m -lpython3.5m -o fibf.so -O3
    

    把这个文件编译成了一个fibf.so文件
    然后写了下边的python代码测试:

    $cat test.py 
    import time
    import fibf 
    t=time.time()
    print(fibf.fibf(40))
    print(time.time()-t)
    
    
    python test.py 
    102334155
    0.47469592094421387
    

    也就是说,2句代码,就把一个C语言写的代码。包装成了一个python能直接import的库。是不是方便极了……
    反正个人觉得比ctypes方便。

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