对于复杂的系统的建模或者协议的建模，各种颜色集的定义以及变量的声明很重要，要区分明确，对于函数行业进程的定义更加复杂。CPN对协议的描述只适合简单逻辑性的协议分析，如果协议包括复杂的算法，那么CPN就不适合做协议的建模分析，
1、实例
现在我们使用CPN来建模一个 灰姑娘和继母的故事， 继母要求灰姑娘将不同的谷物分开，当灰姑娘去跳舞的时候 小老鼠分离这些谷物。
首先我们需要定义颜色集 和变量，
colset p=unit with pumpkin;
colset c=unit with Cinderella;
colset g=with rice | wheat | oat;
colset m=unit with mouse;
colset f=unit with Fairy;
var x: c;
var y: g;
var z: f;
var u: p;
var v: m;
初始的状态如下面
后续执行的步骤图见下面：
因为谷物设置的较多，所以我们直接看部分执行状态 如下图，很多步骤都是在循环
2、状态空间分析
因为我么设置的谷物数量太大，导致状态空间爆炸问题，所以说CPN Tools对 状态空间爆炸问题 只能是人工的干预减少，但是没有办法解决。 那么对复杂的协议分析 也会出现状态空间爆炸问题，导致协议不能分析。
所以说CPN Tools只呢个分析简单的 逻辑性的协议，而不能用来分析含有发杂计算的协议