关于TensorFlow读取数据,官网给出了三种方法:
- 供给数据(Feeding):在TensorFlow程序运行的每一步,让python代码来供给数据。
- 从文件读取数据:在TensorFlow图的起始,让一个输入管线从文件中读取数据。
- 预加载数据:在TensorFlow图中定义常量或变量来保存所有数据(仅适用于数据量比较小的情况)。
对于数据量较小而言,可能一般选择直接将数据加载进内存,然后再分batch输入网络进行训练(tip:使用这种方法时,结合yeild 使用更为简洁)。但是如果数据量较大,这样的方法就不适用了。因为太耗内存,所以这时最好使用TensorFlow提供的队列queue,也就是第二种方法:从文件读取数据。对于一些特定的读取,比如csv文件格式,官网有相关的描述,在这里我们学习一种比较通用的,高效的读取方法,即使用TensorFlow内定标准格式——TFRecords。
1,什么是TFRecords?
TensorFlow提供了一种统一的格式来存储数据,这个格式就是TFRecords。
为了高效的读取数据,可以将数据进行序列化存储,这样也便于网络流式读取数据,TFRecord就是一种保存记录的方法可以允许你讲任意的数据转换为TensorFlow所支持的格式,这种方法可以使TensorFlow的数据集更容易与网络应用架构相匹配。
TFRecord是谷歌推荐的一种常用的存储二进制序列数据的文件格式,理论上它可以保存任何格式的信息。下面是Tensorflow的官网给出的文档结构,整个文件由文件长度信息,长度校验码,数据,数据校验码组成。
uint64 length uint32 masked_crc32_of_length byte data[length] uint32 masked_crc32_of_data
但是对于我们普通开发者而言,我们并不需要关心这些,TensorFlow提供了丰富的API可以帮助我们轻松地读写TFRecord文件。
而 tf.Example 类就是一种将数据表示为{‘string’: value}形式的 message类型,TensorFlow经常使用 tf.Example 来写入,读取 TFRecord数据。
1.1 tf.Example 可以使用的数据格式
通常情况下,tf.Example中可以使用以下几种格式:
- tf.train.BytesList: 可以使用的类型包括 string和byte
- tf.train.FloatList: 可以使用的类型包括 float和double
- tf.train.Int64List: 可以使用的类型包括 enum,bool, int32, uint32, int64
TFRecord支持写入三种格式的数据:string,int64,float32,以列表的形式分别通过tf.train.BytesList,tf.train.Int64List,tf.train.FloatList 写入 tf.train.Feature,如下所示:
#feature一般是多维数组,要先转为list tf.train.Feature(bytes_list=tf.train.BytesList(value=[feature.tostring()])) #tostring函数后feature的形状信息会丢失,把shape也写入 tf.train.Feature(int64_list=tf.train.Int64List(value=list(feature.shape))) tf.train.Feature(float_list=tf.train.FloatList(value=[label]))
如果写成这样,可能大家更熟悉一点:
def _bytes_feature(value): """Returns a bytes_list from a string/byte.""" if isinstance(value, type(tf.constant(0))): value = value.numpy() # BytesList won't unpack a string from an EagerTensor. return tf.train.Feature(bytes_list=tf.train.BytesList(value=[value])) def _float_feature(value): """Return a float_list form a float/double.""" return tf.train.Feature(float_list=tf.train.FloatList(value=[value])) def _int64_feature(value): """Return a int64_list from a bool/enum/int/uint.""" return tf.train.Feature(int64_list=tf.train.Int64List(value=[value]))
通过上述操作,我们以dict的形式把要写入的数据汇总,并构建 tf.train.Features,然后构建 tf.train.Example。如下:
def get_tfrecords_example(feature, label): tfrecords_features = {} feat_shape = feature.shape tfrecords_features['feature'] = tf.train.Feature(bytes_list= tf.train.BytesList(value=[feature.tostring()])) tfrecords_features['shape'] = tf.train.Feature(int64_list= tf.train.Int64List(value=list(feat_shape))) tfrecords_features['label'] = tf.train.Feature(float_list= tf.train.FloatList(value=label)) return tf.train.Example(features=tf.train.Features(feature=tfrecords_features))
我们测试一下,来验证不同的数据格式需要使用不同的函数:
# tf.train.BytesList print(_bytes_feature(b'test_string')) print(_bytes_feature('test_string'.encode('utf8'))) # tf.train.FloatList print(_float_feature(np.exp(1))) # tf.train.Int64List print(_int64_feature(True)) print(_int64_feature(1)) 结果: bytes_list { value: "test_string" } bytes_list { value: "test_string" } float_list { value: 2.7182817459106445 } int64_list { value: 1 } int64_list { value: 1 }
把创建的tf.train.Example序列化下,便可以通过 tf.python_io.TFRecordWriter 写入 tfrecord文件中,如下:
#创建tfrecord的writer,文件名为xxx tfrecord_wrt = tf.python_io.TFRecordWriter('xxx.tfrecord') #把数据写入Example exmp = get_tfrecords_example(feats[inx], labels[inx]) #Example序列化 exmp_serial = exmp.SerializeToString() #写入tfrecord文件 tfrecord_wrt.write(exmp_serial) #写完后关闭tfrecord的writer tfrecord_wrt.close()
TFRecord 的核心内容在于内部有一系列的Example,Example 是protocolbuf 协议(protocolbuf 是通用的协议格式,对主流的编程语言都适用。所以这些 List对应到Python语言当中是列表。而对于Java 或者 C/C++来说他们就是数组)下的消息体。
一个Example消息体包含了一系列的feature属性。每一个feature是一个map,也就是 key-value 的键值对。key 取值是String类型。而value是Feature类型的消息体。下面代码给出了 tf.train.Example的定义:
message Example { Features features = 1; }; message Features{ map<string,Feature> featrue = 1; }; message Feature{ oneof kind{ BytesList bytes_list = 1; FloatList float_list = 2; Int64List int64_list = 3; } };
从上面的代码可以看出 tf.train.example 的数据结构是比较简洁的。tf.train.example中包含了一个从属性名称到取值的字典。其中属性名称为一个字符串,属性的取值为字符串(ByteList),实数列表(FloatList)或者整数列表(Int64List),举个例子,比如将一张解码前的图像存为一个字符串,图像所对应的类别编码存为整数列表,所以可以说TFRecord 可以存储几乎任何格式的信息。
2,为什么要用TFRecord?
TFRerecord也不是非用不可,但确实是谷歌官网推荐的文件格式。
- 1,它特别适合于TensorFlow,或者说就是为TensorFlow量身打造的。
- 2,因为TensorFlow开发者众多,统一训练的数据文件格式是一件很有意义的事情,也有助于降低学习成本和迁移成本。
TFRecords 其实是一种二进制文件,虽然它不如其他格式好理解,但是它能更好的利用内存,更方便赋值和移动,并且不需要单独的标签文件,理论上,它能保存所有的信息。总而言之,这样的文件格式好处多多,所以让我们利用起来。
3,为什么要生成自己的图片数据集TFrecords?
使用TensorFlow进行网格训练时,为了提高读取数据的效率,一般建议将训练数据转化为TFrecords格式。
使用tensorflow官网例子练习,我们会发现基本都是MNIST,CIFAR_10这种做好的数据集说事。所以对于我们这些初学者,完全不知道图片该如何输入。这时候学习自己制作数据集就非常有必要了。
4,如何将一张图片和一个TFRecord 文件相互转化
我们可以使用TFWriter轻松的完成这个任务。但是制作之前,我们要明确自己的目的。我们必须要想清楚,需要把什么信息存储到TFRecord 文件当中,这其实是最重要的。
下面我们将一张图片转化为TFRecord,然后读取一张TFRecord文件,并展示为图片。
4.1 将一张图片转化成TFRecord 文件
下面举例说明尝试把图片转化成TFRecord 文件。
首先定义Example 消息体。
Example Message { Features{ feature{ key:"name" value:{ bytes_list:{ value:"cat" } } } feature{ key:"shape" value:{ int64_list:{ value:689 value:720 value:3 } } } feature{ key:"data" value:{ bytes_list:{ value:0xbe value:0xb2 ... value:0x3 } } } } }
上面的Example表示,要将一张 cat 图片信息写进了 TFRecord 当中。而图片信息包含了图片的名字,图片的维度信息还有图片的数据,分别对应了 name,shape,content 3个feature。
下面我们尝试使用代码实现:
# _*_coding:utf-8_*_ import tensorflow as tf def write_test(input, output): # 借助于TFRecordWriter 才能将信息写入TFRecord 文件 writer = tf.python_io.TFRecordWriter(output) # 读取图片并进行解码 image = tf.read_file(input) image = tf.image.decode_jpeg(image) with tf.Session() as sess: image = sess.run(image) shape = image.shape # 将图片转换成string image_data = image.tostring() print(type(image)) print(len(image_data)) name = bytes('cat', encoding='utf-8') print(type(name)) # 创建Example对象,并将Feature一一对应填充进去 example = tf.train.Example(features=tf.train.Features(feature={ 'name': tf.train.Feature(bytes_list=tf.train.BytesList(value=[name])), 'shape': tf.train.Feature(int64_list=tf.train.Int64List(value=[shape[0], shape[1], shape[2]])), 'data': tf.train.Feature(bytes_list=tf.train.BytesList(value=[image_data])) } )) # 将example序列化成string 类型,然后写入。 writer.write(example.SerializeToString()) writer.close() if __name__ == '__main__': input_photo = 'cat.jpg' output_file = 'cat.tfrecord' write_test(input_photo, output_file)
上述代码注释比较详细,所以我们就重点说一下下面三点:
- 1,将图片解码,然后转化成string数据,然后填充进去。
- 2,Feature 的value 是列表,所以记得加上 []
- 3,example需要调用 SerializetoString() 进行序列化后才行
4.2 TFRecord 文件读取为图片
我们将图片的信息写入到一个tfrecord文件当中。现在我们需要检验它是否正确。这就需要用到如何读取TFRecord 文件的知识点了。
代码如下:
# _*_coding:utf-8_*_ import tensorflow as tf import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt def _parse_record(example_photo): features = { 'name': tf.FixedLenFeature((), tf.string), 'shape': tf.FixedLenFeature([3], tf.int64), 'data': tf.FixedLenFeature((), tf.string) } parsed_features = tf.parse_single_example(example_photo,features=features) return parsed_features def read_test(input_file): # 用dataset读取TFRecords文件 dataset = tf.data.TFRecordDataset(input_file) dataset = dataset.map(_parse_record) iterator = dataset.make_one_shot_iterator() with tf.Session() as sess: features = sess.run(iterator.get_next()) name = features['name'] name = name.decode() img_data = features['data'] shape = features['shape'] print("==============") print(type(shape)) print(len(img_data)) # 从bytes数组中加载图片原始数据,并重新reshape,它的结果是 ndarray 数组 img_data = np.fromstring(img_data, dtype=np.uint8) image_data = np.reshape(img_data, shape) plt.figure() # 显示图片 plt.imshow(image_data) plt.show() # 将数据重新编码成jpg图片并保存 img = tf.image.encode_jpeg(image_data) tf.gfile.GFile('cat_encode.jpg', 'wb').write(img.eval()) if __name__ == '__main__': read_test("cat.tfrecord")
下面解释一下代码:
1,首先使用dataset去读取tfrecord文件
2,在解析example 的时候,用现成的API:tf.parse_single_example
3,用 np.fromstring() 方法就可以获取解析后的string数据,记得把数据还原成 np.uint8
4,用 tf.image.encode_jepg() 方法可以将图片数据编码成 jpeg 格式
5,用 tf.gfile.GFile 对象可以把图片数据保存到本地
6,因为将图片 shape 写入了example 中,所以解析的时候必须指定维度,在这里 [3],不然程序会报错。
运行程序后,可以看到图片显示如下:
5,如何将一个文件夹下多张图片和一个TFRecord 文件相互转化
下面我们将一个文件夹的图片转化为TFRecord,然后再将TFRecord读取为图片。
5.1 将一个文件夹下多张图片转化为一个TFRecord文件
下面举例说明尝试把图片转化成TFRecord 文件。
# _*_coding:utf-8_*_ # 将图片保存成TFRecords import os import tensorflow as tf from PIL import Image import random import cv2 import numpy as np def _int64_feature(value): return tf.train.Feature(int64_list=tf.train.Int64List(value=[value])) # 生成字符串型的属性 def _bytes_feature(value): return tf.train.Feature(bytes_list=tf.train.BytesList(value=[value])) # 生成实数型的属性 def float_list_feature(value): return tf.train.Feature(float_list=tf.train.FloatList(value=value)) def read_image(filename, resize_height, resize_width, normalization=False): ''' 读取图片数据,默认返回的是uint8, [0, 255] :param filename: :param resize_height: :param resize_ :param normalization: 是否归一化到 [0.0, 1.0] :return: 返回的图片数据 ''' bgr_image = cv2.imread(filename) # print(type(bgr_image)) # 若是灰度图则转化为三通道 if len(bgr_image.shape) == 2: print("Warning:gray image", filename) bgr_image = cv2.cvtColor(bgr_image, cv2.COLOR_GRAY2BGR) # 将BGR转化为RGB rgb_image = cv2.cvtColor(bgr_image, cv2.COLOR_BGR2RGB) # show_image(filename, rgb_image) # rgb_image=Image.open(filename) if resize_width > 0 and resize_height > 0: rgb_image = cv2.resize(rgb_image, (resize_width, resize_height)) rgb_image = np.asanyarray(rgb_image) if normalization: rgb_image = rgb_image / 255.0 return rgb_image def load_labels_file(filename, labels_num=1, shuffle=False): ''' 载图txt文件,文件中每行为一个图片信息,且以空格隔开,图像路径 标签1 标签2 如 test_image/1.jpg 0 2 :param filename: :param labels_num: labels个数 :param shuffle: 是否打乱顺序 :return: images type-> list :return:labels type->lis ''' images = [] labels = [] with open(filename) as f: lines_list = f.readlines() # print(lines_list) # ['plane\0499.jpg 4 ', 'plane\0500.jpg 4 '] if shuffle: random.shuffle(lines_list) for lines in lines_list: line = lines.rstrip().split(" ") # rstrip 删除 string 字符串末尾的空格. ['plane\0006.jpg', '4'] label = [] for i in range(labels_num): # labels_num 1 0 1所以i只能取1 label.append(int(line[i + 1])) # 确保读取的是列表的第二个元素 # print(label) images.append(line[0]) # labels.append(line[1]) # ['0', '4'] labels.append(label) # print(images) # print(labels) return images, labels def create_records(image_dir, file, output_record_dir, resize_height, resize_width, shuffle, log=5): ''' 实现将图像原始数据,label,长,宽等信息保存为record文件 注意:读取的图像数据默认是uint8,再转为tf的字符串型BytesList保存,解析请需要根据需要转换类型 :param image_dir:原始图像的目录 :param file:输入保存图片信息的txt文件(image_dir+file构成图片的路径) :param output_record_dir:保存record文件的路径 :param resize_height: :param resize_ PS:当resize_height或者resize_width=0是,不执行resize :param shuffle:是否打乱顺序 :param log:log信息打印间隔 ''' # 加载文件,仅获取一个label images_list, labels_list = load_labels_file(file, 1, shuffle) writer = tf.python_io.TFRecordWriter(output_record_dir) for i, [image_name, labels] in enumerate(zip(images_list, labels_list)): image_path = os.path.join(image_dir, images_list[i]) if not os.path.exists(image_path): print("Error:no image", image_path) continue image = read_image(image_path, resize_height, resize_width) image_raw = image.tostring() if i % log == 0 or i == len(images_list) - 1: print("-----------processing:%d--th------------" % (i)) print('current image_path=%s' % (image_path), 'shape:{}'.format(image.shape), 'labels:{}'.format(labels)) # 这里仅保存一个label,多label适当增加"'label': _int64_feature(label)"项 label = labels[0] example = tf.train.Example(features=tf.train.Features(feature={ 'image_raw': _bytes_feature(image_raw), 'height': _int64_feature(image.shape[0]), 'width': _int64_feature(image.shape[1]), 'depth': _int64_feature(image.shape[2]), 'label': _int64_feature(label) })) writer.write(example.SerializeToString()) writer.close() def get_example_nums(tf_records_filenames): ''' 统计tf_records图像的个数(example)个数 :param tf_records_filenames: tf_records文件路径 :return: ''' nums = 0 for record in tf.python_io.tf_record_iterator(tf_records_filenames): nums += 1 return nums if __name__ == '__main__': resize_height = 224 # 指定存储图片高度 resize_width = 224 # 指定存储图片宽度 shuffle = True log = 5 image_dir = 'dataset/train' train_labels = 'dataset/train.txt' train_record_output = 'train.tfrecord' create_records(image_dir, train_labels, train_record_output, resize_height, resize_width, shuffle, log) train_nums = get_example_nums(train_record_output) print("save train example nums={}".format(train_nums))
5.2 将一个TFRecord文件转化为图片显示
因为图片太多,所以我们这里只展示每个文件夹中第一张图片即可。
代码如下:
# _*_coding:utf-8_*_ # 将图片保存成TFRecords import os import tensorflow as tf from PIL import Image import random import cv2 import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt def read_records(filename,resize_height, resize_width,type=None): ''' 解析record文件:源文件的图像数据是RGB,uint8,[0,255],一般作为训练数据时,需要归一化到[0,1] :param filename: :param resize_height: :param resize_ :param type:选择图像数据的返回类型 None:默认将uint8-[0,255]转为float32-[0,255] normalization:归一化float32-[0,1] centralization:归一化float32-[0,1],再减均值中心化 :return: ''' # 创建文件队列,不限读取的数量 filename_queue = tf.train.string_input_producer([filename]) # 为文件队列创建一个阅读区 reader = tf.TFRecordReader() # reader从文件队列中读入一个序列化的样本 _, serialized_example = reader.read(filename_queue) # 解析符号化的样本 features = tf.parse_single_example( serialized_example, features={ 'image_raw': tf.FixedLenFeature([], tf.string), 'height': tf.FixedLenFeature([], tf.int64), 'width': tf.FixedLenFeature([], tf.int64), 'depth': tf.FixedLenFeature([], tf.int64), 'label': tf.FixedLenFeature([], tf.int64) } ) # 获得图像原始的数据 tf_image = tf.decode_raw(features["image_raw"], tf.uint8) tf_height = features['height'] tf_width = features['width'] tf_depth = features['depth'] tf_label = tf.cast(features['label'], tf.int32) #PS 回复原始图像 reshpe的大小必须与保存之前的图像shape一致,否则报错 # 设置图像的维度 tf_image = tf.reshape(tf_image, [resize_height, resize_width, 3]) # 恢复数据后,才可以对图像进行resize_images:输入 uint 输出 float32 # tf_image = tf.image.resize_images(tf_image, [224, 224]) # 存储的图像类型为 uint8 tensorflow训练数据必须是tf.float32 if type is None: tf_image = tf.cast(tf_image, tf.float32) # 【1】 若需要归一化的话请使用 elif type == 'normalization': # 仅当输入数据是 uint8,才会归一化 [0 , 255] tf_image = tf.cast(tf_image, tf.float32) * (1. / 255.0) elif type=='centralization': # 若需要归一化,且中心化,假设均值为0.5 请使用 tf_image = tf.cast(tf_image, tf.float32) * (1. / 255.0) - 0.5 # 这里仅仅返回图像和标签 return tf_image, tf_label def show_image(title, image): ''' 显示图片 :param title: 图像标题 :param image: 图像的数据 :return: ''' plt.imshow(image) plt.axis('on') # 关掉坐标轴 为 off plt.title(title) # 图像题目 plt.show() def disp_records(record_file,resize_height, resize_width,show_nums=4): ''' 解析record文件,并显示show_nums张图片,主要用于验证生成record文件是否成功 :param tfrecord_file: record文件路径 :return: ''' # 读取record 函数 tf_image, tf_label = read_records(record_file, resize_height, resize_width, type='normalization') # 显示前4个图片 init_op = tf.global_variables_initializer() # init_op = tf.initialize_all_variables() with tf.Session() as sess: sess.run(init_op) coord = tf.train.Coordinator() threads = tf.train.start_queue_runners(sess=sess, coord=coord) for i in range(show_nums): # 在会话中取出image和label image, label = sess.run([tf_image, tf_label]) # image = tf_image.eval() # 直接从record解析的image是一个向量,需要reshape显示 # image = image.reshape([height,width,depth]) print('shape:{},tpye:{},labels:{}'.format(image.shape, image.dtype, label)) # pilimg = Image.fromarray(np.asarray(image_eval_reshape)) # pilimg.show() show_image("image:%d"%(label), image) coord.request_stop() coord.join(threads) if __name__ == '__main__': resize_height = 224 # 指定存储图片高度 resize_width = 224 # 指定存储图片宽度 shuffle = True log = 5 image_dir = 'dataset/train' train_labels = 'dataset/train.txt' train_record_output = 'train.tfrecord' # 测试显示函数 disp_records(train_record_output, resize_height, resize_width)
部分代码解析:
5.3,加入队列
with tf.Session() as sess: sess.run(init_op) coord = tf.train.Coordinator()
# 启动队列 threads = tf.train.start_queue_runners(sess=sess, coord=coord) for i in range(show_nums): # 在会话中取出image和label image, label = sess.run([tf_image, tf_label])
注意,启动队列那条code不能忘记,不然会卡死,这样加入后,就可以做到和tensorflow官网一样的二进制数据集了。
6,生成分割多个record文件
当图片数据很多时候,会导致单个record文件超级巨大的情况,解决方法就是,将数据分成多个record文件保存,读取时,只需要将多个record文件的路径列表交给“tf.train.string_input_producer”,
完整代码如下:(此处来自 此博客)
# -*-coding: utf-8 -*- import tensorflow as tf import numpy as np import os import cv2 import math import matplotlib.pyplot as plt import random from PIL import Image ########################################################################## def _int64_feature(value): return tf.train.Feature(int64_list=tf.train.Int64List(value=[value])) # 生成字符串型的属性 def _bytes_feature(value): return tf.train.Feature(bytes_list=tf.train.BytesList(value=[value])) # 生成实数型的属性 def float_list_feature(value): return tf.train.Feature(float_list=tf.train.FloatList(value=value)) def show_image(title,image): ''' 显示图片 :param title: 图像标题 :param image: 图像的数据 :return: ''' # plt.figure("show_image") # print(image.dtype) plt.imshow(image) plt.axis('on') # 关掉坐标轴为 off plt.title(title) # 图像题目 plt.show() def load_labels_file(filename,labels_num=1): ''' 载图txt文件,文件中每行为一个图片信息,且以空格隔开:图像路径 标签1 标签2,如:test_image/1.jpg 0 2 :param filename: :param labels_num :labels个数 :return:images type->list :return:labels type->list ''' images=[] labels=[] with open(filename) as f: for lines in f.readlines(): line=lines.rstrip().split(' ') label=[] for i in range(labels_num): label.append(int(line[i+1])) images.append(line[0]) labels.append(label) return images,labels def read_image(filename, resize_height, resize_width): ''' 读取图片数据,默认返回的是uint8,[0,255] :param filename: :param resize_height: :param resize_ :return: 返回的图片数据是uint8,[0,255] ''' bgr_image = cv2.imread(filename) if len(bgr_image.shape)==2:#若是灰度图则转为三通道 print("Warning:gray image",filename) bgr_image = cv2.cvtColor(bgr_image, cv2.COLOR_GRAY2BGR) rgb_image = cv2.cvtColor(bgr_image, cv2.COLOR_BGR2RGB)#将BGR转为RGB # show_image(filename,rgb_image) # rgb_image=Image.open(filename) if resize_height>0 and resize_width>0: rgb_image=cv2.resize(rgb_image,(resize_width,resize_height)) rgb_image=np.asanyarray(rgb_image) # show_image("src resize image",image) return rgb_image def create_records(image_dir,file, record_txt_path, batchSize,resize_height, resize_width): ''' 实现将图像原始数据,label,长,宽等信息保存为record文件 注意:读取的图像数据默认是uint8,再转为tf的字符串型BytesList保存,解析请需要根据需要转换类型 :param image_dir:原始图像的目录 :param file:输入保存图片信息的txt文件(image_dir+file构成图片的路径) :param output_record_txt_dir:保存record文件的路径 :param batchSize: 每batchSize个图片保存一个*.tfrecords,避免单个文件过大 :param resize_height: :param resize_ PS:当resize_height或者resize_width=0是,不执行resize ''' if os.path.exists(record_txt_path): os.remove(record_txt_path) setname, ext = record_txt_path.split('.') # 加载文件,仅获取一个label images_list, labels_list=load_labels_file(file,1) sample_num = len(images_list) # 打乱样本的数据 # random.shuffle(labels_list) batchNum = int(math.ceil(1.0 * sample_num / batchSize)) for i in range(batchNum): start = i * batchSize end = min((i + 1) * batchSize, sample_num) batch_images = images_list[start:end] batch_labels = labels_list[start:end] # 逐个保存*.tfrecords文件 filename = setname + '{0}.tfrecords'.format(i) print('save:%s' % (filename)) writer = tf.python_io.TFRecordWriter(filename) for i, [image_name, labels] in enumerate(zip(batch_images, batch_labels)): image_path=os.path.join(image_dir,batch_images[i]) if not os.path.exists(image_path): print('Err:no image',image_path) continue image = read_image(image_path, resize_height, resize_width) image_raw = image.tostring() print('image_path=%s,shape:( %d, %d, %d)' % (image_path,image.shape[0], image.shape[1], image.shape[2]),'labels:',labels) # 这里仅保存一个label,多label适当增加"'label': _int64_feature(label)"项 label=labels[0] example = tf.train.Example(features=tf.train.Features(feature={ 'image_raw': _bytes_feature(image_raw), 'height': _int64_feature(image.shape[0]), 'width': _int64_feature(image.shape[1]), 'depth': _int64_feature(image.shape[2]), 'label': _int64_feature(label) })) writer.write(example.SerializeToString()) writer.close() # 用txt保存*.tfrecords文件列表 # record_list='{}.txt'.format(setname) with open(record_txt_path, 'a') as f: f.write(filename + ' ') def read_records(filename,resize_height, resize_width): ''' 解析record文件 :param filename:保存*.tfrecords文件的txt文件路径 :return: ''' # 读取txt中所有*.tfrecords文件 with open(filename, 'r') as f: lines = f.readlines() files_list=[] for line in lines: files_list.append(line.rstrip()) # 创建文件队列,不限读取的数量 filename_queue = tf.train.string_input_producer(files_list,shuffle=False) # create a reader from file queue reader = tf.TFRecordReader() # reader从文件队列中读入一个序列化的样本 _, serialized_example = reader.read(filename_queue) # get feature from serialized example # 解析符号化的样本 features = tf.parse_single_example( serialized_example, features={ 'image_raw': tf.FixedLenFeature([], tf.string), 'height': tf.FixedLenFeature([], tf.int64), 'width': tf.FixedLenFeature([], tf.int64), 'depth': tf.FixedLenFeature([], tf.int64), 'label': tf.FixedLenFeature([], tf.int64) } ) tf_image = tf.decode_raw(features['image_raw'], tf.uint8)#获得图像原始的数据 tf_height = features['height'] tf_width = features['width'] tf_depth = features['depth'] tf_label = tf.cast(features['label'], tf.int32) # tf_image=tf.reshape(tf_image, [-1]) # 转换为行向量 tf_image=tf.reshape(tf_image, [resize_height, resize_width, 3]) # 设置图像的维度 # 存储的图像类型为uint8,这里需要将类型转为tf.float32 # tf_image = tf.cast(tf_image, tf.float32) # [1]若需要归一化请使用: tf_image = tf.image.convert_image_dtype(tf_image, tf.float32)# 归一化 # tf_image = tf.cast(tf_image, tf.float32) * (1. / 255) # 归一化 # [2]若需要归一化,且中心化,假设均值为0.5,请使用: # tf_image = tf.cast(tf_image, tf.float32) * (1. / 255) - 0.5 #中心化 return tf_image, tf_height,tf_width,tf_depth,tf_label def disp_records(record_file,resize_height, resize_width,show_nums=4): ''' 解析record文件,并显示show_nums张图片,主要用于验证生成record文件是否成功 :param tfrecord_file: record文件路径 :param resize_height: :param resize_ :param show_nums: 默认显示前四张照片 :return: ''' tf_image, tf_height, tf_width, tf_depth, tf_label = read_records(record_file,resize_height, resize_width) # 读取函数 # 显示前show_nums个图片 init_op = tf.initialize_all_variables() with tf.Session() as sess: sess.run(init_op) coord = tf.train.Coordinator() threads = tf.train.start_queue_runners(sess=sess, coord=coord) for i in range(show_nums): image,height,width,depth,label = sess.run([tf_image,tf_height,tf_width,tf_depth,tf_label]) # 在会话中取出image和label # image = tf_image.eval() # 直接从record解析的image是一个向量,需要reshape显示 # image = image.reshape([height,width,depth]) print('shape:',image.shape,'label:',label) # pilimg = Image.fromarray(np.asarray(image_eval_reshape)) # pilimg.show() show_image("image:%d"%(label),image) coord.request_stop() coord.join(threads) def batch_test(record_file,resize_height, resize_width): ''' :param record_file: record文件路径 :param resize_height: :param resize_ :return: :PS:image_batch, label_batch一般作为网络的输入 ''' tf_image,tf_height,tf_width,tf_depth,tf_label = read_records(record_file,resize_height, resize_width) # 读取函数 # 使用shuffle_batch可以随机打乱输入: # shuffle_batch用法:https://blog.csdn.net/u013555719/article/details/77679964 min_after_dequeue = 100#该值越大,数据越乱,必须小于capacity batch_size = 4 # capacity = (min_after_dequeue + (num_threads + a small safety margin∗batchsize) capacity = min_after_dequeue + 3 * batch_size#容量:一个整数,队列中的最大的元素数 image_batch, label_batch = tf.train.shuffle_batch([tf_image, tf_label], batch_size=batch_size, capacity=capacity, min_after_dequeue=min_after_dequeue) init = tf.global_variables_initializer() with tf.Session() as sess: # 开始一个会话 sess.run(init) coord = tf.train.Coordinator() threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord) for i in range(4): # 在会话中取出images和labels images, labels = sess.run([image_batch, label_batch]) # 这里仅显示每个batch里第一张图片 show_image("image", images[0, :, :, :]) print(images.shape, labels) # 停止所有线程 coord.request_stop() coord.join(threads) if __name__ == '__main__': # 参数设置 image_dir='dataset/train' train_file = 'dataset/train.txt' # 图片路径 output_record_txt = 'dataset/record/record.txt'#指定保存record的文件列表 resize_height = 224 # 指定存储图片高度 resize_width = 224 # 指定存储图片宽度 batchSize=8000 #batchSize一般设置为8000,即每batchSize张照片保存为一个record文件 # 产生record文件 create_records(image_dir=image_dir, file=train_file, record_txt_path=output_record_txt, batchSize=batchSize, resize_height=resize_height, resize_width=resize_width) # 测试显示函数 disp_records(output_record_txt,resize_height, resize_width) # batch_test(output_record_txt,resize_height, resize_width)
7,直接读取文件的方式
之前,我们都是将数据转存为tfrecord文件,训练时候再去读取,如果不想转为record文件,想直接读取图像文件进行训练,可以使用下面的方法:
filename.txt
0.jpg 0 1.jpg 0 2.jpg 0 3.jpg 0 4.jpg 0 5.jpg 1 6.jpg 1 7.jpg 1 8.jpg 1 9.jpg 1
代码如下:
# -*-coding: utf-8 -*- import tensorflow as tf import glob import numpy as np import os import matplotlib.pyplot as plt import cv2 def show_image(title, image): ''' 显示图片 :param title: 图像标题 :param image: 图像的数据 :return: ''' # plt.imshow(image, cmap='gray') plt.imshow(image) plt.axis('on') # 关掉坐标轴为 off plt.title(title) # 图像题目 plt.show() def tf_read_image(filename, resize_height, resize_width): ''' 读取图片 :param filename: :param resize_height: :param resize_ :return: ''' image_string = tf.read_file(filename) image_decoded = tf.image.decode_jpeg(image_string, channels=3) # tf_image = tf.cast(image_decoded, tf.float32) tf_image = tf.cast(image_decoded, tf.float32) * (1. / 255.0) # 归一化 if resize_width>0 and resize_height>0: tf_image = tf.image.resize_images(tf_image, [resize_height, resize_width]) # tf_image = tf.image.per_image_standardization(tf_image) # 标准化[0,1](减均值除方差) return tf_image def get_batch_images(image_list, label_list, batch_size, labels_nums, resize_height, resize_width, one_hot=False, shuffle=False): ''' :param image_list:图像 :param label_list:标签 :param batch_size: :param labels_nums:标签个数 :param one_hot:是否将labels转为one_hot的形式 :param shuffle:是否打乱顺序,一般train时shuffle=True,验证时shuffle=False :return:返回batch的images和labels ''' # 生成队列 image_que, tf_label = tf.train.slice_input_producer([image_list, label_list], shuffle=shuffle) tf_image = tf_read_image(image_que, resize_height, resize_width) min_after_dequeue = 200 capacity = min_after_dequeue + 3 * batch_size # 保证capacity必须大于min_after_dequeue参数值 if shuffle: images_batch, labels_batch = tf.train.shuffle_batch([tf_image, tf_label], batch_size=batch_size, capacity=capacity, min_after_dequeue=min_after_dequeue) else: images_batch, labels_batch = tf.train.batch([tf_image, tf_label], batch_size=batch_size, capacity=capacity) if one_hot: labels_batch = tf.one_hot(labels_batch, labels_nums, 1, 0) return images_batch, labels_batch def load_image_labels(filename): ''' 载图txt文件,文件中每行为一个图片信息,且以空格隔开:图像路径 标签1,如:test_image/1.jpg 0 :param filename: :return: ''' images_list = [] labels_list = [] with open(filename) as f: lines = f.readlines() for line in lines: # rstrip:用来去除结尾字符、空白符(包括 、 、 、' ',即:换行、回车、制表符、空格) content = line.rstrip().split(' ') name = content[0] labels = [] for value in content[1:]: labels.append(int(value)) images_list.append(name) labels_list.append(labels) return images_list, labels_list def batch_test(filename, image_dir): labels_nums = 2 batch_size = 4 resize_height = 200 resize_width = 200 image_list, label_list = load_image_labels(filename) image_list=[os.path.join(image_dir,image_name) for image_name in image_list] image_batch, labels_batch = get_batch_images(image_list=image_list, label_list=label_list, batch_size=batch_size, labels_nums=labels_nums, resize_height=resize_height, resize_width=resize_width, one_hot=False, shuffle=True) with tf.Session() as sess: # 开始一个会话 sess.run(tf.global_variables_initializer()) coord = tf.train.Coordinator() threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord) for i in range(4): # 在会话中取出images和labels images, labels = sess.run([image_batch, labels_batch]) # 这里仅显示每个batch里第一张图片 show_image("image", images[0, :, :, :]) print('shape:{},tpye:{},labels:{}'.format(images.shape, images.dtype, labels)) # 停止所有线程 coord.request_stop() coord.join(threads) if __name__ == "__main__": image_dir = "./dataset/train" filename = "./dataset/train.txt" batch_test(filename, image_dir)
8,数据输入管道:pipeline机制解释如下:
TensorFlow引入了tf.data.Dataset模块,使其数据读入的操作变得更为方便,而支持多线程(进程)的操作,也在效率上获得了一定程度的提高。使用tf.data.Dataset模块的pipline机制,可实现CPU多线程处理输入的数据,如读取图片和图片的一些的预处理,这样GPU可以专注于训练过程,而CPU去准备数据。
参考资料:
https://blog.csdn.net/u014061630/article/details/80776975 (五星推荐)TensorFlow全新的数据读取方式:Dataset API入门教程:http://baijiahao.baidu.com/s?id=1583657817436843385&wfr=spider&for=pc
从tfrecord文件创建TFRecordDataset方式如下:
# 用dataset读取TFRecords文件 dataset = tf.contrib.data.TFRecordDataset(input_file)
解析tfrecord 文件的每条记录,即序列化后的 tf.train.Example;使用 tf.parse_single_example 来解析:
feats = tf.parse_single_example(serial_exmp, features=data_dict)
其中,data_dict 是一个dict,包含的key 是写入tfrecord文件时用的key ,相应的value是对应不同的数据类型,我们直接使用代码看,如下:
def _parse_record(example_photo): features = { 'name': tf.FixedLenFeature((), tf.string), 'shape': tf.FixedLenFeature([3], tf.int64), 'data': tf.FixedLenFeature((), tf.string) } parsed_features = tf.parse_single_example(example_photo,features=features) return parsed_features
解析tfrecord文件中的所有记录,我们需要使用dataset 的map 方法,如下:
dataset = dataset.map(_parse_record)
Dataset支持一类特殊的操作:Transformation。一个Dataset通过Transformation变成一个新的Dataset。通常我们可以通过Transformation完成数据变换,打乱,组成batch,生成epoch等一系列操作。常用的Transformation有:map、batch、shuffle和repeat。
map方法可以接受任意函数对dataset中的数据进行处理;另外可以使用repeat,shuffle,batch方法对dataset进行重复,混洗,分批;用repeat赋值dataset以进行多个epoch;如下:
dataset = dataset.repeat(epochs).shuffle(buffer_size).batch(batch_size)
解析完数据后,便可以取出数据进行使用,通过创建iterator来进行,如下:
iterator = dataset.make_one_shot_iterator() features = sess.run(iterator.get_next())
下面分别介绍
8.1,map
使用 tf.data.Dataset.map
,我们可以很方便地对数据集中的各个元素进行预处理。因为输入元素之间时独立的,所以可以在多个 CPU 核心上并行地进行预处理。map
变换提供了一个 num_parallel_calls
参数去指定并行的级别。
dataset = dataset.map(map_func=parse_fn, num_parallel_calls=FLAGS.num_parallel_calls)
8.2,prefetch
tf.data.Dataset.prefetch 提供了 software pipelining 机制。该函数解耦了 数据产生的时间 和 数据消耗的时间。具体来说,该函数有一个后台线程和一个内部缓存区,在数据被请求前,就从 dataset 中预加载一些数据(进一步提高性能)。prefech(n) 一般作为最后一个 transformation,其中 n 为 batch_size。 prefetch 的使用方法如下:
dataset = dataset.batch(batch_size=FLAGS.batch_size) dataset = dataset.prefetch(buffer_size=FLAGS.prefetch_buffer_size) # last transformation return dataset
8.3,repeat
repeat的功能就是将整个序列重复多次,主要用来处理机器学习中的epoch,假设原先的数据是一个epoch,使用repeat(5)就可以将之变成5个epoch:
如果直接调用repeat()的话,生成的序列就会无限重复下去,没有结束,因此也不会抛出tf.errors.OutOfRangeError异常
8.4,完整代码如下:
# -*-coding: utf-8 -*- import tensorflow as tf import numpy as np import glob import matplotlib.pyplot as plt width=0 height=0 def show_image(title, image): ''' 显示图片 :param title: 图像标题 :param image: 图像的数据 :return: ''' # plt.figure("show_image") # print(image.dtype) plt.imshow(image) plt.axis('on') # 关掉坐标轴为 off plt.title(title) # 图像题目 plt.show() def tf_read_image(filename, label): image_string = tf.read_file(filename) image_decoded = tf.image.decode_jpeg(image_string, channels=3) image = tf.cast(image_decoded, tf.float32) if width>0 and height>0: image = tf.image.resize_images(image, [height, width]) image = tf.cast(image, tf.float32) * (1. / 255.0) # 归一化 return image, label def input_fun(files_list, labels_list, batch_size, shuffle=True): ''' :param files_list: :param labels_list: :param batch_size: :param shuffle: :return: ''' # 构建数据集 dataset = tf.data.Dataset.from_tensor_slices((files_list, labels_list)) if shuffle: dataset = dataset.shuffle(100) dataset = dataset.repeat() # 空为无限循环 dataset = dataset.map(tf_read_image, num_parallel_calls=4) # num_parallel_calls一般设置为cpu内核数量 dataset = dataset.batch(batch_size) dataset = dataset.prefetch(2) # software pipelining 机制 return dataset if __name__ == '__main__': data_dir = 'dataset/image/*.jpg' # labels_list = tf.constant([0,1,2,3,4]) # labels_list = [1, 2, 3, 4, 5] files_list = glob.glob(data_dir) labels_list = np.arange(len(files_list)) num_sample = len(files_list) batch_size = 1 dataset = input_fun(files_list, labels_list, batch_size=batch_size, shuffle=False) # 需满足:max_iterate*batch_size <=num_sample*num_epoch,否则越界 max_iterate = 3 with tf.Session() as sess: iterator = dataset.make_initializable_iterator() init_op = iterator.make_initializer(dataset) sess.run(init_op) iterator = iterator.get_next() for i in range(max_iterate): images, labels = sess.run(iterator) show_image("image", images[0, :, :, :]) print('shape:{},tpye:{},labels:{}'.format(images.shape, images.dtype, labels))
9,AttributeError: module 'tensorflow' has no attribute 'data' 解决方法
当我们使用tf 中的 dataset时,可能会出现如下错误:
原因是tf 版本不同导致的错误。
在编写代码的时候,使用的tf版本不同,可能导致其Dataset API 放置的位置不同。当使用TensorFlow1.3的时候,Dataset API是放在 contrib 包里面,而当使用TensorFlow1.4以后的版本,Dataset API已经从contrib 包中移除了,而变成了核心API的一员。故会产生报错。
解决方法:
将下面代码:
# 用dataset读取TFRecords文件 dataset = tf.data.TFRecordDataset(input_file)
改为此代码:
# 用dataset读取TFRecords文件 dataset = tf.contrib.data.TFRecordDataset(input_file)
问题解决。
10,tf.gfile.FastGfile()函数学习
函数如下:
tf.gfile.FastGFile(path,decodestyle)
函数功能:实现对图片的读取
函数参数:path:图片所在路径
decodestyle:图片的解码方式(‘r’:UTF-8编码; ‘rb’:非UTF-8编码)
例子如下:
img_raw = tf.gfile.FastGFile(IMAGE_PATH, 'rb').read()
11,Python zip()函数学习
zip() 函数用于将可迭代的对象作为参数,将对象中对应的元素打包成一个个元组,然后返回由这些元组组成的列表。如果各个迭代器的元素个数不一致,则返回列表长度与最短的对象相同,利用*号操作符,可以将元组解压为列表。
在 Python 3.x 中为了减少内存,zip() 返回的是一个对象。如需展示列表,需手动 list() 转换。
zip([iterable, ...]) 参数说明: iterabl——一个或多个迭代器 返回值:返回元组列表
实例:
>>>a = [1,2,3] >>> b = [4,5,6] >>> c = [4,5,6,7,8] >>> zipped = zip(a,b) # 打包为元组的列表 [(1, 4), (2, 5), (3, 6)] >>> zip(a,c) # 元素个数与最短的列表一致 [(1, 4), (2, 5), (3, 6)] >>> zip(*zipped) # 与 zip 相反,*zipped 可理解为解压,返回二维矩阵式 [(1, 2, 3), (4, 5, 6)]
12,下一步计划
1,为什么前面使用Dataset,而用大多数博文中的 QueueRunner 呢?
A:这是因为 Dataset 比 QueueRunner 新,而且是官方推荐的,Dataset 比较简单。
2,学习了 TFRecord 相关知识,下一步学习什么?
A:可以尝试将常见的数据集如 MNIST 和 CIFAR-10 转换成 TFRecord 格式。
参考文献:https://blog.csdn.net/u012759136/article/details/52232266
https://blog.csdn.net/tengxing007/article/details/56847828/
https://blog.csdn.net/briblue/article/details/80789608 (五星推荐)
https://blog.csdn.net/happyhorizion/article/details/77894055 (五星推荐)