1、到IBM websphere官方网站下载相应版本的更新包，如6.1.0-WS-WASSDK-WinX32-FP0000021.pak和6.1.0-WS-WAS-WinX32-FP0000021.pak；
2、下载并安装websphere安装更新程序updateinstall，如download.updii.61019.windows.ia32.zip解压安装，注意安装这个程序需要在JDK1.4的环境下；
3、再把这两个更新包拷贝到updateinstall_home/maintenance 下，运行更新程序出现图形界面，会自动识别到更新包进行安装。
注意：安装更新的时候要关闭websphere服务
websphere安装更新程序updateinstall地址：
http://www-01.ibm.com/support/docview.wss?rs=180&uid=swg24012718
ftp://ftp.software.ibm.com/software/websphere/appserv/support/tools/UpdateInstaller/6.1.x/WinIA32/download.updii.61019.windows.ia32.zip
websphere版本更新包地址：
ftp://ftp.software.ibm.com/software/websphere/appserv/support/fixpacks/was61/cumulative/cf61021/WinX32/6.1.0-WS-WAS-WinX32-FP0000021.pak
ftp://ftp.software.ibm.com/software/websphere/appserv/support/fixpacks/was61/cumulative/cf61021/WinX32/6.1.0-WS-WASSDK-WinX32-FP0000021.pak