I0221 21:47:41.826748 6797 solver.cpp:259] Train net output #0: loss = 0.00413362 (* 1 = 0.00413362 loss)
I0221 21:47:41.826756 6797 solver.cpp:590] Iteration 9980, lr = 0.001
I0221 21:47:44.453655 6797 solver.cpp:468] Snapshotting to binary proto file /home/d302/wangxiao/caffe-master/wangxiao/bvlc_alexnet/caffe_alexnet_train_iter_10000.caffemodel
I0221 21:47:44.453685 6797 net.cpp:948] Serializing 25 layers
F0221 21:47:47.096515 6797 io.cpp:69] Check failed: proto.SerializeToOstream(&output)
*** Check failure stack trace: ***
@ 0x7f06066beb7d google::LogMessage::Fail()
@ 0x7f06066c0c7f google::LogMessage::SendToLog()
@ 0x7f06066be76c google::LogMessage::Flush()
@ 0x7f06066c151d google::LogMessageFatal::~LogMessageFatal()
@ 0x7f0606effe4e caffe::WriteProtoToBinaryFile()
@ 0x7f0606e1d30f caffe::WriteProtoToBinaryFile()
@ 0x7f0606e20a46 caffe::Solver<>::SnapshotToBinaryProto()
@ 0x7f0606e206ec caffe::Solver<>::Snapshot()
@ 0x7f0606e1fe72 caffe::Solver<>::Step()
@ 0x7f0606e1f1d3 caffe::Solver<>::Solve()
@ 0x416280 train()
@ 0x418206 main
@ 0x7f0605be376d (unknown)
@ 0x414fe9 (unknown)
Aborted (core dumped)
d302@d302-MS-7816-04:~/wangxiao/caffe-master$
解决方案： 2016年8月14号 补充
前两天有园友来问我，这个问题有没有解决，我回答说：忘了，好久之前的了，果然今天就出现了这个问题，昨晚跑的 VGG，出现了相同的问题，可是我之前跑那个代码 一直没问题啊，呃呃呃，我看错误是：
Snapshotting to binary proto file /home/d302/wangxiao/caffe-master/wangxiao/bvlc_alexnet/caffe_alexnet_train_iter_10000.caffemodel
Check failed: proto.SerializeToOstream(&output)
我扫了一眼，保存的 caffemodel，发现： _iter_10000.caffemodel 是存在的，但是 _iter_10000.solverstate 不在，估计是保存的问题，难道是空间不够用了？我删除了其他无关的 model，在 8000次迭代产生的 model上继续训练，待会就知道是否是 磁盘空间不足导致的问题了。。。
目测，已经过了那个错误的点了，所以，解决这个问题的答案是：存储空间不足，清理磁盘空间吧 。。。
另外，感谢园友的提醒，他解决的方法是：
原来是之前穿件文件用了sudo，跑程序的时候没有加sudo，导致权限不够，加了sudo后就ok了