• python数据分析入门学习笔记儿


    学习利用python进行数据分析的笔记儿&下星期二内部交流会要讲的内容,一并分享给大家。博主粗心大意,有什么不对的地方欢迎指正~还有许多尚待完善的地方,待我一边学习一边完善~

    前言:各种和数据分析相关python库的介绍(前言1~4摘抄自《利用python进行数据分析》)
    
    1.Numpy:
      Numpy是python科学计算的基础包,它提供以下功能(不限于此):
        (1)快速高效的多维数组对象naarray 
        (2)用于对数组执行元素级计算以及直接对数组执行数学运算的函数
        (3)用于读写硬盘上基于数组的数据集的工具
        (4)线性代数运算、傅里叶变换,以及随机数生成
        (5)用于将C、C++、Fortran代码集成到python的工具
    
    2.pandas
      pandas提供了使我们能够快速便捷地处理结构化数据的大量数据结构和函数。pandas兼具Numpy高性能的数组计算功能以及电子表格和关系型数据(如SQL)灵活的数据处理能力。它提供了复杂精细的索引功能,以便更为便捷地完成重塑、切片和切块、聚合以及选取数据子集等操作。
      对于金融行业的用户,pandas提供了大量适用于金融数据的高性能时间序列功能和工具。
      DataFrame是pandas的一个对象,它是一个面向列的二维表结构,且含有行标和列标。
      ps.引用一段网上的话说明DataFrame的强大之处:
      Excel 2007及其以后的版本的最大行数是1048576,最大列数是16384,超过这个规模的数据Excel就会弹出个框框“此文本包含多行文本,无法放置在一个工作表中”。Pandas处理上千万的数据是易如反掌的事情,同时随后我们也将看到它比SQL有更强的表达能力,可以做很多复杂的操作,要写的code也更少。 说了一大堆它的好处,要实际感触还得动手码代码。
    
    3.matplotlib
      matplotlib是最流行的用于绘制数据图表的python库。
    
    4.Scipy
      Scipy是一组专门解决科学计算中各种标准问题域的包的集合。
    5.statsmodels: 各种模型 ****待学习
    6.scikit-learn: machine learning模块,很全 ****待学习

    
    一.数据导入和导出
    (一)读取csv文件
     1.本地读取
    复制代码
    import pandas as pd
    df = pd.read_csv('E:\tips.csv')  #根据自己数据文件保存的路径填写(ps.填写路径时,单斜杠会报错,双斜杠不会,不知为何)
    #输出: total_bill tip sex smoker day time size 0 16.99 1.01 Female No Sun Dinner 2 1 10.34 1.66 Male No Sun Dinner 3 2 21.01 3.50 Male No Sun Dinner 3 3 23.68 3.31 Male No Sun Dinner 2 4 24.59 3.61 Female No Sun Dinner 4 5 25.29 4.71 Male No Sun Dinner 4 .. ... ... ... ... ... ... ... 240 27.18 2.00 Female Yes Sat Dinner 2 241 22.67 2.00 Male Yes Sat Dinner 2 242 17.82 1.75 Male No Sat Dinner 2 243 18.78 3.00 Female No Thur Dinner 2 [244 rows x 7 columns]
    复制代码
    2.网络读取
    import pandas as pd
    data_url = "https://raw.githubusercontent.com/mwaskom/seaborn-data/master/tips.csv" #填写url读取
    df = pd.read_csv(data_url)
    #输出同上,为了节省篇幅这儿就不粘贴了
    3.read_csv详解
    
    功能: Read CSV (comma-separated) file into DataFrame
    复制代码
    read_csv(filepath_or_buffer, sep=',', dialect=None, compression='infer', doublequote=True, escapechar=None, quotechar='"', quoting=0, skipinitialspace=False, lineterminator=None, header='infer', index_col=None, names=None, prefix=None, skiprows=None, skipfooter=None, skip_footer=0, na_values=None, true_values=None, false_values=None, delimiter=None, converters=None, dtype=None, usecols=None, engine=None, delim_whitespace=False, as_recarray=False, na_filter=True, compact_ints=False, use_unsigned=False, low_memory=True, buffer_lines=None, warn_bad_lines=True, error_bad_lines=True, keep_default_na=True, thousands=None, comment=None, decimal='.', parse_dates=False, keep_date_col=False, dayfirst=False, date_parser=None, memory_map=False, float_precision=None, nrows=None, iterator=False, chunksize=None, verbose=False, encoding=None, squeeze=False, mangle_dupe_cols=True, tupleize_cols=False, infer_datetime_format=False, skip_blank_lines=True)
    复制代码
    参数详解:
    http://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/generated/pandas.read_csv.html
    
    (二)读取Mysql数据
      假设数据库安装在本地,用户名为myusername,密码为mypassword,要读取mydb数据库中的数据
    复制代码
    import pandas as pd
    import MySQLdb
    mysql_cn= MySQLdb.connect(host='localhost', port=3306,user='myusername', passwd='mypassword', db='mydb')
    df = pd.read_sql('select * from test;', con=mysql_cn)    
    mysql_cn.close()
    复制代码
    上面的代码读取了test表中所有的数据到df中,而df的数据结构为Dataframe。
    ps.MySQL教程:http://www.runoob.com/mysql/mysql-tutorial.html
    (三)读取excel文件
    要读取excel文件还需要安装xlrd模块,pip install xlrd即可。
    df = pd.read_excel('E:\tips.xls')
    
    (四)数据导出到csv文件
    df.to_csv('E:\demo.csv', encoding='utf-8', index=False) 
    #index=False表示导出时去掉行名称,如果数据中含有中文,一般encoding指定为‘utf-8’

     (五)读写SQL数据库

    复制代码
    import pandas as pd
    import sqlite3
    con = sqlite3.connect('...')
    sql = '...'
    df=pd.read_sql(sql,con)
    
    #help文件
    help(sqlite3.connect)
    #输出
    Help on built-in function connect in module _sqlite3:
    
    connect(...)
        connect(database[, timeout, isolation_level, detect_types, factory])
        
        Opens a connection to the SQLite database file *database*. You can use
        ":memory:" to open a database connection to a database that resides in
        RAM instead of on disk.
    #############
    help(pd.read_sql)
    #输出
    Help on function read_sql in module pandas.io.sql:
    
    read_sql(sql, con, index_col=None, coerce_float=True, params=None, parse_dates=None, columns=None, chunksize=None)
        Read SQL query or database table into a DataFrame.
    复制代码

    ps.数据库的代码是我直接从网络上粘贴过来的,没有测试过是不是可行,先贴上来。

        数据库我还在摸索中,学习心得学习笔记之类的大家可以一起分享23333~

     二.提取和筛选需要的数据
    (一)提取和查看相应数据 (用的是tips.csv的数据,数据来源:https://github.com/mwaskom/seaborn-data)
    复制代码
    print df.head() #打印数据前五行
    #输出 total_bill tip sex smoker day time size 0 16.99 1.01 Female No Sun Dinner 2 1 10.34 1.66 Male No Sun Dinner 3 2 21.01 3.50 Male No Sun Dinner 3 3 23.68 3.31 Male No Sun Dinner 2 4 24.59 3.61 Female No Sun Dinner 4
    复制代码
    复制代码
    print df.tail()  #打印数据后5行
    #输出
         total_bill   tip     sex smoker   day    time  size
    239       29.03  5.92    Male     No   Sat  Dinner     3
    240       27.18  2.00  Female    Yes   Sat  Dinner     2
    241       22.67  2.00    Male    Yes   Sat  Dinner     2
    242       17.82  1.75    Male     No   Sat  Dinner     2
    243       18.78  3.00  Female     No  Thur  Dinner     2
    复制代码
    print df.columns  #打印列名
    #输出
    Index([u'total_bill', u'tip', u'sex', u'smoker', u'day', u'time', u'size'], dtype='object')
    复制代码
    print df.index  #打印行名
    #输出
    Int64Index([  0,   1,   2,   3,   4,   5,   6,   7,   8,   9,
                ...
                234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243],
               dtype='int64', length=244)
    复制代码
    复制代码
    print df.ix[10:20, 0:3]  #打印10~20行前三列数据
    #输出
        total_bill   tip     sex
    10       10.27  1.71    Male
    11       35.26  5.00  Female
    12       15.42  1.57    Male
    13       18.43  3.00    Male
    14       14.83  3.02  Female
    15       21.58  3.92    Male
    16       10.33  1.67  Female
    17       16.29  3.71    Male
    18       16.97  3.50  Female
    19       20.65  3.35    Male
    20       17.92  4.08    Male
    复制代码
    复制代码
    #提取不连续行和列的数据,这个例子提取的是第1,3,5行,第2,4列的数据
    df.iloc[[1,3,5],[2,4]]
    #输出
        sex  day
    1  Male  Sun
    3  Male  Sun
    5  Male  Sun
    复制代码
    #专门提取某一个数据,这个例子提取的是第三行,第二列数据(默认从0开始算哈)
    df.iat[3,2]
    #输出
    'Male'
    print df.drop(df.columns[1, 2], axis = 1) #舍弃数据前两列
    print df.drop(df.columns[[1, 2]], axis = 0) #舍弃数据前两行
    #为了节省篇幅结果就不贴出来了哈~
    print df.shape #打印维度
    #输出
    (244, 7)
    复制代码
    df.iloc[3] #选取第3行
    #输出1
    total_bill     23.68
    tip             3.31
    sex             Male
    smoker            No
    day              Sun
    time          Dinner
    size               2
    Name: 3, dtype: object
    
    df.iloc[2:4] #选取第2到第3行
    #输出2
       total_bill   tip   sex smoker  day    time  size
    2       21.01  3.50  Male     No  Sun  Dinner     3
    3       23.68  3.31  Male     No  Sun  Dinner     2
    
    df.iloc[0,1] #选取第0行1列的元素
    #输出3
    1.01
    复制代码
    (二)筛选出需要的数据(用的是tips.csv的数据,数据来源:https://github.com/mwaskom/seaborn-data)
    复制代码
    #example:假设我们要筛选出小费大于$8的数据
    df[df.tip>8]
    #输出
         total_bill  tip   sex smoker  day    time  size
    170       50.81   10  Male    Yes  Sat  Dinner     3
    212       48.33    9  Male     No  Sat  Dinner     4
    复制代码
    复制代码
    #数据筛选同样可以用”或“和”且“作为筛选条件,比如
    #1
    df[(df.tip>7)|(df.total_bill>50)] #筛选出小费大于$7或总账单大于$50的数据
    #输出
         total_bill    tip   sex smoker  day    time  size
    23        39.42   7.58  Male     No  Sat  Dinner     4
    170       50.81  10.00  Male    Yes  Sat  Dinner     3
    212       48.33   9.00  Male     No  Sat  Dinner     4
    
    #2
    df[(df.tip>7)&(df.total_bill>50)]#筛选出小费大于$7且总账单大于$50的数据
    #输出
         total_bill  tip   sex smoker  day    time  size
    170       50.81   10  Male    Yes  Sat  Dinner     3
    复制代码
    复制代码
    #接上
    #假如加入了筛选条件后,我们只关心day和time
    df[['day','time']][(df.tip>7)|(df.total_bill>50)]
    #输出
         day    time
    23   Sat  Dinner
    170  Sat  Dinner
    212  Sat  Dinner
    复制代码
      三.统计描述(用的是tips.csv的数据,数据来源:https://github.com/mwaskom/seaborn-data)
    复制代码
    print df.describe() #描述性统计
    #输出  各指标都比较简单就不解释了哈
           total_bill         tip        size
    count  244.000000  244.000000  244.000000
    mean    19.785943    2.998279    2.569672
    std      8.902412    1.383638    0.951100
    min      3.070000    1.000000    1.000000
    25%     13.347500    2.000000    2.000000
    50%     17.795000    2.900000    2.000000
    75%     24.127500    3.562500    3.000000
    max     50.810000   10.000000    6.000000
    复制代码
    
    四.数据处理

    (一)数据转置(用的是tips.csv的数据,数据来源:https://github.com/mwaskom/seaborn-data)
    复制代码
    print df.T
    #output
                   0       1       2       3       4       5       6       7    
    total_bill   16.99   10.34   21.01   23.68   24.59   25.29    8.77   26.88   
    tip           1.01    1.66     3.5    3.31    3.61    4.71       2    3.12   
    sex         Female    Male    Male    Male  Female    Male    Male    Male   
    smoker          No      No      No      No      No      No      No      No   
    day            Sun     Sun     Sun     Sun     Sun     Sun     Sun     Sun   
    time        Dinner  Dinner  Dinner  Dinner  Dinner  Dinner  Dinner  Dinner   
    size             2       3       3       2       4       4       2       4   
    
                   8       9     ...       234     235     236     237     238  
    total_bill   15.04   14.78   ...     15.53   10.07    12.6   32.83   35.83   
    tip           1.96    3.23   ...         3    1.25       1    1.17    4.67   
    sex           Male    Male   ...      Male    Male    Male    Male  Female   
    smoker          No      No   ...       Yes      No     Yes     Yes      No   
    day            Sun     Sun   ...       Sat     Sat     Sat     Sat     Sat   
    time        Dinner  Dinner   ...    Dinner  Dinner  Dinner  Dinner  Dinner   
    size             2       2   ...         2       2       2       2       3   
    
                   239     240     241     242     243  
    total_bill   29.03   27.18   22.67   17.82   18.78  
    tip           5.92       2       2    1.75       3  
    sex           Male  Female    Male    Male  Female  
    smoker          No     Yes     Yes      No      No  
    day            Sat     Sat     Sat     Sat    Thur  
    time        Dinner  Dinner  Dinner  Dinner  Dinner  
    size             3       2       2       2       2  
    
    [7 rows x 244 columns]
    复制代码

     (二)数据排序(用的是tips.csv的数据,数据来源:https://github.com/mwaskom/seaborn-data)

    复制代码
    df.sort_values(by='tip')  #按tip列升序排序
    #输出(为了不占篇幅我简化了一部分)
         total_bill    tip     sex smoker   day    time  size
    67         3.07   1.00  Female    Yes   Sat  Dinner     1
    236       12.60   1.00    Male    Yes   Sat  Dinner     2
    92         5.75   1.00  Female    Yes   Fri  Dinner     2
    111        7.25   1.00  Female     No   Sat  Dinner     1
    0         16.99   1.01  Female     No   Sun  Dinner     2
    ..          ...    ...     ...    ...   ...     ...   ...
    214       28.17   6.50  Female    Yes   Sat  Dinner     3
    141       34.30   6.70    Male     No  Thur   Lunch     6
    59        48.27   6.73    Male     No   Sat  Dinner     4
    23        39.42   7.58    Male     No   Sat  Dinner     4
    212       48.33   9.00    Male     No   Sat  Dinner     4
    170       50.81  10.00    Male    Yes   Sat  Dinner     3
    
    [244 rows x 7 columns]
    复制代码
    (三)缺失值处理

    1.填充缺失值(数据来自《利用python进行数据分析》第二章 usagov_bitly_data2012-03-16-1331923249.txt,需要的同学可以找我要)

    复制代码
    import json  #python有许多内置或第三方模块可以将JSON字符串转换成python字典对象
    import pandas as pd
    import numpy as np
    from pandas import DataFrame
    path = 'F:PycharmProjectspydata-book-masterch02usagov_bitly_data2012-03-16-1331923249.txt' #根据自己的路径填写
    records = [json.loads(line) for line in open(path)]
    frame = DataFrame(records)
    frame['tz']
    
    #输出(为了节省篇幅我删除了部分输出结果)
    0          America/New_York
    1            America/Denver
    2          America/New_York
    3         America/Sao_Paulo
    4          America/New_York
    5          America/New_York
    6             Europe/Warsaw
    7                          
    8                          
    9                          
    10      America/Los_Angeles
    11         America/New_York
    12         America/New_York
    13                      NaN
                   ...         
    Name: tz, dtype: object
    复制代码

    从以上输出值可以看出数据存在未知或缺失值,接着咱们来处理缺失值。

    复制代码
    print frame['tz'].fillna(1111111111111)  #以数字代替缺失值
    #输出结果(为了节省篇幅我删除了部分输出结果)
    0          America/New_York
    1            America/Denver
    2          America/New_York
    3         America/Sao_Paulo
    4          America/New_York
    5          America/New_York
    6             Europe/Warsaw
    7                          
    8                          
    9                          
    10      America/Los_Angeles
    11         America/New_York
    12         America/New_York
    13            1111111111111
    Name: tz, dtype: object
    复制代码
    复制代码
    print frame['tz'].fillna('YuJie2333333333333') #用字符串代替缺失值
    #输出(为了节省篇幅我删除了部分输出结果)
    0          America/New_York
    1            America/Denver
    2          America/New_York
    3         America/Sao_Paulo
    4          America/New_York
    5          America/New_York
    6             Europe/Warsaw
    7                          
    8                          
    9                          
    10      America/Los_Angeles
    11         America/New_York
    12         America/New_York
    13       YuJie2333333333333
    Name: tz, dtype: object
    复制代码

    还有:

    print frame['tz'].fillna(method='pad') #用前一个数据代替缺失值
    print frame['tz'].fillna(method='bfill') #用后一个数据代替缺失值

    2.删除缺失值 (数据同上)

    print frame['tz'].dropna(axis=0) #删除缺失行
    print frame['tz'].dropna(axis=1) #删除缺失列

    3.插值法填补缺失值

    由于没有数据,这儿插播一个小知识点:创建一个随机的数据框

    复制代码
    import pandas as pd
    import numpy as np
    #创建一个6*4的数据框,randn函数用于创建随机数
    czf_data = pd.DataFrame(np.random.randn(6,4),columns=list('ABCD')) 
    czf_data
    #输出
              A         B         C         D
    0  0.355690  1.165004  0.810392 -0.818982
    1  0.496757 -0.490954 -0.407960 -0.493502
    2 -0.202123 -0.842278 -0.948464  0.223771
    3  0.969445  1.357910 -0.479598 -1.199428
    4  0.125290  0.943056 -0.082404 -0.363640
    5 -1.762905 -1.471447  0.351570 -1.546152
    复制代码

    好啦,数据就出来了。接着我们用空值替换数值,创造出一个含有空值的DataFrame。

    复制代码
    #把第二列数据设置为缺失值
    czf_data.ix[2,:]=np.nan
    czf_data
    #输出
              A         B         C         D
    0  0.355690  1.165004  0.810392 -0.818982
    1  0.496757 -0.490954 -0.407960 -0.493502
    2       NaN       NaN       NaN       NaN
    3  0.969445  1.357910 -0.479598 -1.199428
    4  0.125290  0.943056 -0.082404 -0.363640
    5 -1.762905 -1.471447  0.351570 -1.546152
    复制代码
    复制代码
    #接着就可以利用插值法填补空缺值了~
    print czf_data.interpolate()
    #输出
              A         B         C         D
    0  0.355690  1.165004  0.810392 -0.818982
    1  0.496757 -0.490954 -0.407960 -0.493502
    2  0.733101  0.433478 -0.443779 -0.846465
    3  0.969445  1.357910 -0.479598 -1.199428
    4  0.125290  0.943056 -0.082404 -0.363640
    5 -1.762905 -1.471447  0.351570 -1.546152
    复制代码

     (四)数据分组(用的是tips.csv的数据,数据来源:https://github.com/mwaskom/seaborn-data)

    复制代码
    group = df.groupby('day')  #按day这一列进行分组
    #1
    print group.first()#打印每一组的第一行数据
    #输出
          total_bill   tip     sex smoker    time  size
    day                                                
    Fri        28.97  3.00    Male    Yes  Dinner     2
    Sat        20.65  3.35    Male     No  Dinner     3
    Sun        16.99  1.01  Female     No  Dinner     2
    Thur       27.20  4.00    Male     No   Lunch     4
    #2
    print group.last()#打印每一组的最后一行数据
    #输出
          total_bill   tip     sex smoker    time  size
    day                                                
    Fri        10.09  2.00  Female    Yes   Lunch     2
    Sat        17.82  1.75    Male     No  Dinner     2
    Sun        15.69  1.50    Male    Yes  Dinner     2
    Thur       18.78  3.00  Female     No  Dinner     2
    复制代码

    (五)值替换

    复制代码
    import pandas as pd
    import numpy as np
    #首先创造一个Series(没有数据情况下的福音233)
    Series = pd.Series([0,1,2,3,4,5])
    #输出
    Series
    0    0
    1    1
    2    2
    3    3
    4    4
    5    5
    dtype: int64
    复制代码
    复制代码
    #数值替换,例如将0换成10000000000000
    print Series.replace(0,10000000000000)
    #输出
    0    10000000000000
    1                 1
    2                 2
    3                 3
    4                 4
    5                 5
    dtype: int64
    复制代码
    复制代码
    #列和列的替换同理
    print Series.replace([0,1,2,3,4,5],[11111,222222,3333333,44444,55555,666666])
    #输出
    0      11111
    1     222222
    2    3333333
    3      44444
    4      55555
    5     666666
    dtype: int64
    复制代码

    五.统计分析

    (一)t检验

    1.独立样本t检验

    两独立样本t检验就是根据样本数据对两个样本来自的两独立总体的均值是否有显著差异进行推断;进行两独立样本t检验的条件是,两样本的总体相互独立且符合正态分布。

    开始找不到合适的数据,我就在网上随便摘抄了个spss做独立样本t检验的实例数据作为例子大家暂时看着吧找到合适的例子再给大家举~

    数据如下,我将数据保存为本地xlsx格式:

    复制代码
       group  data
    0      1    34
    1      1    37
    2      1    28
    3      1    36
    4      1    30
    5      2    43
    6      2    45
    7      2    47
    8      2    49
    9      2    39
    复制代码
    复制代码
    import pandas as pd
    from scipy.stats import ttest_ind
    IS_t_test = pd.read_excel('E:\IS_t_test.xlsx') 
    Group1 = IS_t_test[IS_t_test['group']==1]['data']
    Group2 = IS_t_test[IS_t_test['group']==2]['data']
    print ttest_ind(Group1,Group2)
    
    #输出
    (-4.7515451390104353, 0.0014423819408438474) 
    复制代码

    输出结果的第一个元素为t值,第二个元素为p-value

    ttest_ind默认两组数据方差齐性的,如果想要设置默认方差不齐,可以设置equal_var=False

    print ttest_ind(Group1,Group2,equal_var=True)
    print ttest_ind(Group1,Group2,equal_var=False)
    #输出
    (-4.7515451390104353, 0.0014423819408438474)
    (-4.7515451390104353, 0.0014425608643614844)

    2.配对样本t检验

    同样找不到数据,让我们暂且假设上边独立样本是配对样本吧,使用同样的数据。

    复制代码
    import pandas as pd
    from scipy.stats import ttest_rel
    IS_t_test = pd.read_excel('E:\IS_t_test.xlsx') 
    Group1 = IS_t_test[IS_t_test['group']==1]['data']
    Group2 = IS_t_test[IS_t_test['group']==2]['data']
    print ttest_rel(Group1,Group2)
    
    #输出
    (-5.6873679190073361, 0.00471961872448184)
    复制代码

    同样的,输出结果的第一个元素为t值,第二个元素为p-value。

     (二)方差分析

    1.单因素方差分析

    这里依然沿用t检验的数据

    复制代码
    import pandas as pd
    from scipy import stats
    IS_t_test = pd.read_excel('E:\IS_t_test.xlsx') 
    Group1 = IS_t_test[IS_t_test['group']==1]['data']
    Group2 = IS_t_test[IS_t_test['group']==2]['data']
    w,p = stats.levene(*args)
    #levene方差齐性检验。levene(*args, **kwds)  Perform Levene test for equal variances.如果p<0.05,则方差不齐
    print w,p
    #进行方差分析
    f,p = stats.f_oneway(*args)
    print f,p
    
    #输出
    (0.019607843137254936, 0.89209916055865535)
    22.5771812081 0.00144238194084
    复制代码

    2.多因素方差分析

        数据是我从网上找的多因素方差分析的一个例子,研究区组和营养素对体重的影响。我做成了excel文件,需要的同学可以问我要哈~做多因素方差分析需要加载statsmodels模块,如果电脑没有安装可以pip install一下。

    复制代码
    #数据导入
    import pandas as pd
    MANOVA=pd.read_excel('E:\MANOVA.xlsx')
    MANOVA
    #输出(为了节省篇幅删掉了中间部分的输出结果)
    id nutrient weight 0 1 1 50.1 1 2 1 47.8 2 3 1 53.1 3 4 1 63.5 4 5 1 71.2 5 6 1 41.4 ....................... 21 6 3 38.5 22 7 3 51.2 23 8 3 46.2
    复制代码
    复制代码
    #多因素方差分析
    from statsmodels.formula.api import ols
    from statsmodels.stats.anova import anova_lm
    formula = 'weight~C(id)+C(nutrient)+C(id):C(nutrient)'
    anova_results = anova_lm(ols(formula,MANOVA).fit())
    print anova_results
    #output
                       df        sum_sq     mean_sq   F  PR(>F)
    C(id)               7  2.373613e+03  339.087619   0     NaN
    C(nutrient)         2  1.456133e+02   72.806667   0     NaN
    C(id):C(nutrient)  14  3.391667e+02   24.226190   0     NaN
    Residual            0  8.077936e-27         inf NaN     NaN
    复制代码

    也许数据选得不对,p-value全是空值23333,待我找个好点儿的数据再做一次多因素方差分析。

    3.重复测量设计的方差分析(单因素)   ********待完善

    重复测量设计是对同一因变量进行重复测度,重复测量设计的方差分析可以是同一条件下进行的重复测度,也可以是不同条件下的重复测量。

    代码和多因素方差分析一样,思路不一样而已~但我还找不到多因素方差分析合适的数据所以这儿就先不写了2333

     4.混合设计的方差分析   ********待完善

    #########统计学学得好的同学们,教教我吧。。

    (三)卡方检验

      卡方检验就是统计样本的实际观测值与理论推断值之间的偏离程度,实际观测值与理论推断值之间的偏离程度就决定卡方值的大小,卡方值越大,越不符合;卡方值越小,偏差越小,越趋于符合,若两个值完全相等时,卡方值就为0,表明理论值完全符合。(from 百度百科2333)

    1.单因素卡方检验

    数据源于网络,男女化妆与不化妆人数的理论值与实际值。

    复制代码
    import numpy as np
    from scipy import stats
    from scipy.stats import chisquare
    observed = np.array([15,95])
     #观测值:110学生中化妆的女生95人,化妆的男生15人
    expected = np.array([55,55])
    #理论值:110学生中化妆的女生55人,化妆的男生55人
    chisquare(observed,expected)
    #output
    (58.18181818181818, 2.389775628860044e-14)
    复制代码

    2.多因素卡方检验*****正在研究中,学会了完善这一块~

     (四)计数统计(用的数据为tips.csv)

    复制代码
    #example:统计性别
    count = df['sex'].value_counts()
    #输出
    print count
    Male      157
    Female     87
    Name: sex, dtype: int64
    复制代码

    (五)回归分析  *****待学习: 数据拟合,广义线性回归。。。。等等

    六.可视化

      我觉得吧,其实看着excel就可以实现的功能为何那么复杂,excel确实够通用够便捷,但是处理很大数据量的话也许吃不消吧。学学python绘图也不赖,而且讲真,有的成效真的挺好看的。

    (一)Seaborn

    我学数据分析可视化是从学习Seaborn入门的,Seaborn是基于matplotlib的Python可视化库,刚开始便接触matplotlib难免有些吃力,参数多且难理解,但是慢慢来总会学会的。还有关键的一点是,seaborn画出来的图好好看。。
    复制代码
    #基础导入
    import numpy as np
    import pandas as pd
    import seaborn as sns
    import matplotlib as mpl
    import matplotlib.pyplot as plt
    复制代码
    #小费数据真的挺好的,这儿用tips作为example
    tips = sns.load_dataset('tips') #从网络环境导入数据tips

    1.lmplot函数

    lmplot(x, y, data, hue=None, col=None, row=None, palette=None, col_wrap=None, size=5, aspect=1, markers='o', sharex=True, sharey=True, hue_order=None, col_order=None, row_order=None, legend=True, legend_out=True, x_estimator=None, x_bins=None, x_ci='ci', scatter=True, fit_reg=True, ci=95, n_boot=1000, units=None, order=1, logistic=False, lowess=False, robust=False, logx=False, x_partial=None, y_partial=None, truncate=False, x_jitter=None, y_jitter=None, scatter_kws=None, line_kws=None)

    功能:Plot data and regression model fits across a FacetGrid. 

    下面就不同的例子,对lmplot的参数进行解释

    例子1.  画出总账单和小费回归关系图

    用到了lmplot(x, y, data,scatter_kws)

    x,y,data一目了然这儿就不多解释了,scatter_kws和line_kws的官方解释如下:

    {scatter,line}_kws : dictionarie

    Additional keyword arguments to pass to plt.scatter and plt.plot.

    scatter为点,line为线。其实就是用字典去限定点和线的各种属性,如例子所示,散点的颜色为灰石色,线条的颜色为印度红,成像效果就是这样点线颜色分离,展现效果很好。大家也可以换上自己想要的图片属性。

    sns.lmplot("total_bill", "tip", tips,
               scatter_kws={"marker": ".", "color": "slategray"},
               line_kws={"linewidth": 1, "color": "indianred"}).savefig('picture2') 

    另外:颜色还可以使用RGB代码,具体对照表可以参考这个网站,可以自己搭配颜色:

    http://www.114la.com/other/rgb.htm

    marker也可以有多种样式,具体如下:

    .  Point marker
    ,  Pixel marker
    o  Circle marker
    v  Triangle down marker
    ^  Triangle up marker
    <   Triangle left marker
    >   Triangle right marker
    1  Tripod down marker
    2  Tripod up marker
    3  Tripod left marker
    4  Tripod right marker
    s  Square marker
    p  Pentagon marker
    *  Star marker
    h  Hexagon marker
    H  Rotated hexagon D Diamond marker
    d  Thin diamond marker
    | Vertical line (vlinesymbol) marker
    _  Horizontal line (hline symbol) marker
    +  Plus marker
    x  Cross (x) marker

    sns.lmplot("total_bill", "tip", tips,
               scatter_kws={"marker": ".","color":"#FF7F00"},
               line_kws={"linewidth": 1, "color": "#BF3EFF"}).savefig('s1')

    ps.我修改maker属性不成功不知为何,求解答

    例子2.用餐人数(size)和小费(tip)的关系图

    官方解释:

    x_estimator : callable that maps vector -> scalar, optional

    Apply this function to each unique value of x and plot the resulting estimate. This is useful when x is a discrete variable. If x_ci is not None, this estimate will be bootstrapped and a confidence interval will be drawn.

    大概解释就是:对拥有相同x水平的y值进行映射

    plt.figure()
    sns.lmplot('size', 'tip', tips, x_estimator= np.mean).savefig('picture3')

    {x,y}_jitter : floats, optional

    Add uniform random noise of this size to either the x or y variables. The noise is added to a copy of the data after fitting the regression, and only influences the look of the scatterplot. This can be helpful when plotting variables that take discrete values.

    jitter是个很有意思的参数, 特别是处理靶数据的overlapping过于严重的情况时, 通过增加一定程度的噪声(noise)实现数据的区隔化, 这样原始数据是若干 点簇 变成一系列密集邻近的点群. 另外, 有的人会经常将 rugjitter 结合使用. 这依人吧.对于横轴取离散水平的时候, 用x_jitter可以让数据点发生水平的扰动.但扰动的幅度不宜过大。

    sns.lmplot('size', 'tip', tips, x_jitter=.15).savefig('picture4')

    seaborn还可以做出xkcd风格的图片,还挺有意思的

    with plt.xkcd():
        sns.color_palette('husl', 8)
        sns.set_context('paper')
        sns.lmplot(x='total_bill', y='tip', data=tips, ci=65).savefig('picture1')

    with plt.xkcd():
        sns.lmplot('total_bill', 'tip', data=tips, hue='day')
        plt.xlabel('hue = day')
        plt.savefig('picture5')

    with plt.xkcd():
        sns.lmplot('total_bill', 'tip', data=tips, hue='smoker')
        plt.xlabel('hue = smoker')
        plt.savefig('picture6')

    复制代码
    sns.set_style('dark')
    sns.set_context('talk')
    sns.lmplot('size', 'total_bill', tips, order=2)
    plt.title('# poly order = 2')
    plt.savefig('picture7')
    plt.figure()
    sns.lmplot('size', 'total_bill', tips, order=3)
    plt.title('# poly order = 3')
    plt.savefig('picture8')
    复制代码
    
    
    sns.jointplot("total_bill", "tip", tips).savefig('picture9')

     

    (二)matplotlib ********待完善

     

    七.其它~

    (一)调用R

    让Python直接调用R的函数,下载安装rpy2模块即可~

    具体步骤:http://www.geome.cn/posts/python-%E9%80%9A%E8%BF%87rpy2%E8%B0%83%E7%94%A8-r%E8%AF%AD%E8%A8%80/

    亲测可用~ 大大大大大前提:电脑上安装了R

    (二)ipython ********待完善

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  • 原文地址:https://www.cnblogs.com/wanghuaijun/p/7147570.html
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