java 程序的使用

Java程序可以在任何安装有Java平台的系统上运行，运行的时候语法如下：

 

java -jar <program.jar>

 

-jar这个参数是必须有的，后面跟你的java程序，例如我们这边就是

 

java -jar /home/biosoft/GenomeAnalysisTK-1.6-13/GenomeAnalysisTK.jar …

 

这边在引用程序位置时推荐使用绝对路径，然后除了-jar这个参数以外，还有一个经常用到的参数就是用来设定内存上限的-Xmx参数，用法如下：

 

java -Xmx<size> -jar …

 

这边的size可以用m、g等等做单位，例如

java -Xmx4g -jar /home/biosoft/GenomeAnalysisTK-1.6-13/GenomeAnalysisTK.jar …

就表示把内存的最大使用量限制在4G，对于处理一些比较大的文件，可以适当的把这个值调高一点，来提高运算效率或者防止内存不足程序无法运行.

原文出处：

Nowind博客：http://blog.sina.com.cn/s/blog_6721167201018fyw.html