• R(一): R基础知识


          R 是一门拥有统计分析及作图功能的免费软件,主要用于数学建模、统计计算、数据处理、可视化等方向。据 IEEE Spectrum发布的2016年编程语言前10位排名来看,R语言由2015年排名第6位上升级2016年的第5位。目前在CRAN 上发布的算法包已经超过8000+多个。R体系涉及到高等数据、概率学、统计学、IT技术等多种知识的综合应用,虽然看起来超级复杂,但学过程还是得从基础开始。

        解释:CRAN (The Comprehensive R Archive NetWork): 提供下载软件安装程序和相应软件包的网站,访问地址:https://www.r-project.org/

    附图2016年编程语言排名:来源于 http://spectrum.ieee.org/static/interactive-the-top-programming-languages-2016

     目录:

    • R语言特点
    • R语法规范
    • R工作原理
    • R数据类型
    • R对象类别
    • R对象判断转换
    • R运算符
    • R特殊值
    • R循环语句
    • R工作空间
    • R帮助
    • 常用操作

    R语言特点:


    • 灵活、开放、免费
    • R是一种解释性语言
    • R区分大小
    • 帮助系统很赞,开发查找方便
    • 数量众多的算法功能包(8000+扩展包),还不包括在github上的开发包
    • 支持在UNIX、 Windows and MacOS多种系统上运行
    • 高质量、广泛的统计分析、数据挖掘

    R语法规范:


    • 对象的命名以"."或字母开头,当以"."开头时,第二个字符不允许是数字
    • 基本命令要么是表达式,要么是赋值。如果命令是表达式,它被解析后,结果显示在屏幕同时清空命令所占内存。赋值被解析后,将值传给变量结果不显示。
    • 命令以";"分隔或另起一行,注释以"#"标注
    • 当一条命令在一行结束时还没不完整,R会结出延续提示符,默认是"+"
    • 与其它语言相比,R有个比较个性的赋值表达方式(即箭头赋值符号),至于此表达方式的来源,在谢老师的一篇文章中有介绍,请参见http://yihui.name/cn/2012/09/equal-and-arrow/
    • 开发过程中的编码规范约定,可参见google的R语言编码风格指南,如下图(详细参见:http://bbs.pinggu.org/thread-1410518-1-1.html

    R工作原理:


    • 当R在运行时,所有的变量、数据、函数及结果都是以对象的形式存在于计算机的活动内存中,期间进行的所有操作都是针对活动内存中的对象,如下示意图
    • 用户通过输入一些命令调用函数,分析得出的结果可以直接显示在屏幕上,也可以直接存入某个对象或写入磁盘,因为产生的数据本身就是一种对象,所以它们也能被视为数据并能象其它数据一样被处理分析。数据的输入文件可来源于本地磁盘,也可以是从远程服务端获取
    • 上图中示意的所有的R 函数都包含在某个库里 (library), 我们从CRAN上下载的程序包被调用的时候,都要通过 library(包名)先加载到内存,再被使用,后面会详细介绍。
    • 在R软件安装包里自带的 base 库是R的核心,在启动R时会自动加载,它包含了如:数据读写、数据运算等基本操作。

    R数据类型:


    •  数据型:Numeric  
    •  字符型:Character
    •  逻辑型:Logical
    •  因子型:Factor   (表示不同类别,在下面的内容中会举例来说明)
    •  复数型:Complex

    R对象类别:


    • 向量(Vector): 线性代数里面我记得又称为矢量,它表示一系统元素的组合。(注意:向量里面的元素类型必须一致,不一致时会自动进行转换),如下图示例
    • 因子(Factor): 为处理分类数据提供的一种有效方法,概念难懂,结合以下代码说明
      #取10名考生所在的省赋给变量province
       province <- c('四川','湖南','江苏','四川','四川','四川','湖南','江苏','湖南','江苏')
       
       #创建因子, 并查看因子输出结果
       pf <- factor(province);pf
       
       #录入每位考生的分数
       score <- c(95,86,84,92,84,79,86,99,85,90)
       
       #计算各省的平均成绩,并在屏幕显示
       tapply(score,pf,mean)
    •  输出结果如下图:(这样应该能明白了吧?)

    • 矩阵(matrix): 一种特殊的数组,是向量在多维度下的一般形式。 用法: matrix(data = NA, nrow = 1, ncol = 1, byrow = FALSE, dimnames = NULL)
      1. data为必要的矩阵元素,nrow 为行数,ncol 为列数,注意nrow 与ncol 的乘积应为 矩阵元素个数,byrow 项控制排列元素时是否按行进行,默认是按列,dimnames 给定行和列的名称
      2. 示例代码: 1:12表示 1至12 的有序数字序列
        > matrix(1:12,nrow = 3,ncol = 4,byrow = TRUE,dimnames = list(c("Row1","Row2","Row3"),c("col1","col2","col3","col4")))
             col1 col2 col3 col4
        Row1    1    2    3    4
        Row2    5    6    7    8
        Row3    9   10   11   12
        >
    • 数据框(dataframe): 和矩阵类似的结构,列可以是不同的对象。
      1. 使用data.frame函数来初始化一个对象,示例代码如下:
        > duty <-data.frame(date=c("20160814","2016015","2016016"),
        +                            Name=c("tgzhu","zhangShan","LiShi"),
        +                            Tel=c("13606401549","13606401550","13606401551"))
        > duty
              date      Name         Tel
        1 20160814     tgzhu 13606401549
        2  2016015 zhangShan 13606401550
        3  2016016     LiShi 13606401551
        > 
      2. 在通过读取本地文件、通过RODBC访问数据库访问的都是 data.frame对象,在后续会以单独的章节对其包含的操作进行介绍 

    • 列表(list): 一种泛化的向量,没有要求所有元素数型一致
      1. 通过 list 函数来初始化一个对象,示例代码如下:
        #无tag 方式
        list("tgzhu",16,TRUE)
        
        #带tag方式
        list(name="tgzhu",workAge=16,goodMan=TRUE)
        
        #list 嵌套
        list(name="tgzhu",workAge=16,address=list(address="JN",Tel="13606401550"))
      2.  list中元素的访问:list_name$tag_name、list_name[[tag_name]]、 list_name[[index]]

      3. 注意:list中元素的访问需要双层[[]],如果单层[index]或[tag_name]会访问到tag_name(或者index)与值本身,是个子list,而不仅仅是值;
      4. 双层[[]]中的只能是单一的tag_name或index,不能是类似[[1:3]]这样访问,而单层可以[1:3],提取出1~3作为子list
    • 小结:
      1. R中的数据结构主要面向《线性代数》中的一些概念,如向量、矩阵等
      2. R中其实没有简单数据(数值型、逻辑型、字符型等),对于简单类型会自动看做长度为1的向量

     R对象判断转换:

    • R对象判断函数:其返回值:TRUE或FALSE
      1. is.numeric(): 是否数值型数据
      2. is.character():   是否字符型数据
      3. is.vector():   是否向量数据
      4. is.matrix():  是否矩阵数据
      5. is.data.frame():   是否数据框数据
      6. is.factor():    是否因子数据
      7. is.logical():   是否逻辑型数据
    • 转换数据类型:函数将输入参数转换为对应的类型
      1. as.numeric()
      2. as.character()
      3. as.vector()
      4. as.matrix()
      5. as.data.frame()
      6. as.factor()
      7. as.logical()
      • 简单示例如下
        > a <- c(1,2,3);a
        [1] 1 2 3
        > 
        > is.numeric(a)
        [1] TRUE
        > 
        > a<-as.character(a);a
        [1] "1" "2" "3"
        > 
        > is.numeric(a)
        [1] FALSE

     R运算符:


    • 算术运算符: + - * /
    • 逻辑运算符: <,<=,>,>=,==,!=, &, |, !
    • 数学函数:log,exp,sin,cos,tan,sqrt,max ,min,range,length,sum,prod,var

    R循环语句:


    • 条件语句:  if (expr1 ) expr2 else expr3
    • 循环控制:for,repeat,while
      1. for语法: for (name in expr1 ) expr2 其中name 是循环变量,expr1是一个向量表达式,而expr2常常是根据虚拟变量name 而设计的成组表达式。在name 访问expr1所有可以取到的值时,expr2都会运行
      2. 注意:相比其他程序语言,R代码里面很少使用for(),执行效率很低
      3. repeat expr, while (condition) expr
      4. 关键字break:可以用于结束任何循环,甚至是非常规的。它是结束repeat 循环的唯一办法。
      5. 关键字next:可以用来结束一次特定的循环,然后直接跳入"下一次"循环

    R特殊值:


    •  在某些情况下,向量的元素可能有残缺.R为确保所有数据都能被正确识别、计算或统计等,定义了一些特殊值数据
      1. NULL空数据
      2. NA(not available):表示无数据
      3. NaN(Not a Number):表示非数字
      4. inf:数字除以0得到的值,无穷大
    • 断一个object (x)是不是属于这些类型有相应的函数:
      1. is.null(x)
      2. is.na(x)
      3. is.nan(x)
      4. is.infinite(x)

    R工作空间:


    • 工作空间(workspace)就是当前R的工作环境,它储存着所有用户定义的对象(向量、矩阵、函数、数据框、列表) 。在一个R会话结束时,你可以将当前工作空间保存到一个镜像中,并在下次启动R时自动载入它
    • 当前的工作目录(working directory)是R用来读取文件和保存结果的默认目录。使用函数getwd()来查看当前的工作目录,或使用函数setwd()设定当前的工作目录。
    • 注意:如果需要读入一个不在当前工作目录下的文件,则需在调用语句中写明完整的路径。记得使用引号闭合这些目录名和文件名
    • 用于管理工作空间的部分标准命令:
      1. getwd(): get working directory  显示当前的工作目录
      2. setwd("yourdirectory"):  修改当前的工作目录为你指定的目录地址
      3. ls():  列出当前工作空间中的对象
      4. rm(objectlist):  移除(删除)一个或多个对象,变通一下: rm(list=ls())  即表示删除工作空间内存中的所有对象
      5. rm(list=ls(pat=“^m”)): 删除内存中以m开头的变量
      6. options():  显示或设置当前选项,这个命令很有用,在下面的章节会用到
      7. save.image("myfile") : 保存工作空间到文件myfile中(默认值为.RData)
      8. save(objectlist, file="myfile"):  保存指定对象到一个文件中
      9. load("myfile"):  读取一个工作空间到当前会话中(默认值为.RData),一些静态的数据文件也可保存为.rda文件,通过load加载到内存
      10. q():  退出R

    R帮助:


    • help.start(): 打开所有已在本地安装的帮助文档
    • help( 函数名) 或 ? 函数名 : 查看函数帮助文档
    • help.search(“pattern”)  ??pattern:  函数搜索已在本地计算机安装的帮助文档
    • 如果有些包是最近才安装的,则设置rebuild参数来刷新数据库,如:help.search(‘tree’,rebuild=TRUE)
    • 示例:help(“bs”,try.all.package=TRUE) : 默认情况下,help只会在载入内存的包中进行搜索,选项 try.all.package = FASLSE,若设为TRUE,则可在所有包中进行搜索。在 这种情况下,不会显示函数 的帮助页面
    • 若package未载入内存,而想查看帮助页面,可使用:help(“bs”,package=“splines”);
    • apropos("yourSearchName"):找出所有名字中含有指定字符串的函数(仅加载到内存中的包中搜)

    常用操作


    • 查看已加载的包:   (.packages())
    • 卸除已加载的包,如卸除RMySQL包:   detach("package:RMySQL")
    • 安装包,如下载安装报名为“rjson”的包:    install.packages("rjson")
    • 彻底删除已安装的包: remove. packages(c("pkg1","pkg2") , lib = file .path("path", "to", "library"))
    • 查看已安装的包:  installed.packages()[,c('Package','Version','LibPath')]  (其中c('Package','Version','LibPath') 表示显示包名、版本、库路径信息,若无[,c('Package','Version','LibPath')]参数,则显示所有信息)
    • 查看某个包提供的函数:  help(package='TSA')    (package参数为要查看的包的包名)
    • 查看某个函数属于哪个包: help(函数名)
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