MR案例：小文件处理方案

HDFS被设计来存储大文件，而有时候会有大量的小文件生成，造成NameNode资源的浪费，同时也影响MapReduce的处理效率。有哪些方案可以合并这些小文件，或者提高处理小文件的效率呢？

1). 所有HDFS小文件数据导出到本地单个文件后，再存入HDFS

[root@ncst ~]# hadoop fs -ls /test/in/small/
Found 3 items
-rw-r--r--   1 root supergroup          1 2015-08-25 22:17 /test/in/small/small.1
-rw-r--r--   1 root supergroup          1 2015-08-25 22:17 /test/in/small/small.2
-rw-r--r--   1 root supergroup          1 2015-08-25 22:17 /test/in/small/small.3

　1.1). 利用hadoop fs -cat或hadoop fs -text命令，将所有内容导出到本地文件，然后put到HDFS即可。如：

[root@ncst test]# hadoop fs -cat /test/in/small/small.* > small_data
[root@ncst test]# hadoop fs -put small_data /test/in/small/

　1.2). 或者使用管道：

[root@ncst test]# hadoop fs -cat /test/in/small/small.* | 
> hadoop fs -put - /test/in/small/small_data

　　　最后删除原有文件，注意避免删除新上传的FlumeData1，通过模糊匹配的方式即可

shell> hadoop fs -rm -skipTrash /test/in/small/small.*

总结：

• 这个合并方案适用于文件格式一致，文件合并顺序不敏感（或者按照文件名为序）的场景，例如这里收集的日志信息，每一条都是一样的格式，每一条记录本身有生成时间信息，所以不依赖与在文件中的位置。
• 如果文件中使用数字用于命名，而期望以数字顺序而不是字符串顺序进行合并，会遇到如下问题：-text包含-cat的功能，-cat只能针对平面文件，而-text可以处理压缩(compressed)和顺序(sequence)文件。
1. 问题：1,10,100,1000,11,110.将这些数字进行排列。如果按照字符串顺序，是1,10,100,1000,11,110，而我们知道数字的期望顺序是1,10,11,100,110,1000。
2. 这里的一个参考方法可以如下：hadoop fs -text [0-9]_fileName.txt [0-9][0-9]_fileName.txt [0-9][0-9[0-9]_fileName.txt | hadoop fs -put – targetFilename.txt 以此类推实现更多位数的数字排序。
3. 如果可以的话，使用数字前补零的命名方式(如000009)，使得所有文件名称长度一致，可以使得字符顺序与数字的顺序一致。

2). 调用现有API方法 或 自行开发

本质上，这种方案还是先把数据内容读到客户端，再写入到HDFS。

　2.1). org.apache.hadoop.fs.FileUtil.copyMerge()方法将指定目录下的所有文件拷贝、合并到一个文件。copyMerge()可以在不同FileSystem中移动，通过deleteSource标识来指定是否删除，如果设定为true，则会删除整个srcDir目录。而conf的传入其实只是为了获取 io.file.buffer.size 的设置。而 addString 则是在合并时，每个文件后添加的字符串。

  /** Copy all files in a directory to one output file (merge). */
  public static boolean copyMerge(FileSystem srcFS, Path srcDir, 
                                  FileSystem dstFS, Path dstFile, 
                                  boolean deleteSource,
                                  Configuration conf, String addString) throws IOException {
    //检查hdfs上输出路径是否存在
    dstFile = checkDest(srcDir.getName(), dstFS, dstFile, false);

    if (!srcFS.getFileStatus(srcDir).isDirectory())
      return false;
   
    OutputStream out = dstFS.create(dstFile);
    
    try {
      FileStatus contents[] = srcFS.listStatus(srcDir);
      Arrays.sort(contents);
      for (int i = 0; i < contents.length; i++) {
        if (contents[i].isFile()) {
          InputStream in = srcFS.open(contents[i].getPath());
          try {
            IOUtils.copyBytes(in, out, conf, false);
            if (addString!=null)
              out.write(addString.getBytes("UTF-8"));
                
          } finally {
            in.close();
          } 
        }
      }
    } finally {
      out.close();
    }    
    //是否删除原有文件
    if (deleteSource) {
      return srcFS.delete(srcDir, true);
    } else {
      return true;
    }
 }  

　2.2). 参考copyMerge()的写法，自定义合并程序。如下例，在本FileSystem中将srcDir下的所有文件写入同一个文件dstFile，而删除则是针对被合并的文件而不是整个目录。

public boolean dirMergeToFile(String srcDir, Path dstFile, boolean deleteSource){
        boolean rtcd = true;
        try {
            Configuration conf = new Configuration();
            FileSystem fs = FileSystem. get(conf);

            Path sDir = new Path(srcDir);
            Path dFile = dstFile;
            if (!fs.getFileStatus(sDir).isDirectory()) {
                System. out.println(sDir.getName() + " is not a directory!");
                return false ;
            }
            OutputStream out = null;
            try {
                //排除隐藏的文件，即以.开头。
                FileStatus contents[] = fs.listStatus(sDir);

                if(contents.length == 0){
                    return true ;
                }

                if (fs.exists(dFile)) {
                    System. out.println(dFile.getName() + " exists!");
                    return false ;
                }

                out = fs.create(dFile);
                Arrays.sort(contents);

                for (int i = 0; i < contents.length; i++) {
                    if (contents[i].isFile()) {
                        InputStream in = fs.open(contents[i].getPath());
                        try {
                            IOUtils.copyBytes(in, out, conf, false );
                        } finally {
                            in.close();
                        }
                        if (deleteSource && !fs.delete(contents[i].getPath(), false)) {
                            rtcd = false;
                        }
                    }
                }
            } finally {
                if (out != null)
                    out.close();
            }
            return rtcd;
        } catch (IOException e) {
            System. out.println(e.getMessage());
            return false ;
        }
    }

3). Hadoop自带方案Hadoop Archive

hadoop archive 命令运行MapReduce job来并行处理输入文件，将小文件的内容合并形成少量大文件，然后再利用 index 文件，指出小文件在大文件中所属的坐标，以此来减少小文件的数量。Hadoop Archives生成归档文件格式为HAR。详见解读：Hadoop Archive

4). Sequence File

Sequence File由一系列二进制的键值对组成，其中key为小文件的名字，value的File Content。创建Sequence File的过程可以使用MapReduce Job完成。Sequence Files也是splittable的，所以 MapReduce 可以break them into chunks，并且分别被独立的处理。和HAR不同的是，这种方式还支持压缩。block压缩在许多情况下都是最好的选择，因为它将多个records压缩到一起，而不是一个record一个压缩。详见MR案例：小文件合并SequeceFile

5). CombineFileInputFormat类

CombineFileInputFormat是Hadoop自带的多文件合并处理方案。指定输入目录，将其下的大量小文件进行合并分片，达到减少map任务数量的目的。详细见解读：CombineFileInputFormat类