Linux安装软件有一种方式就是通过源码安装，源码通常是一个压缩包，打开压缩包，经常会看到一个叫configure的文件，而不见makefile文件。通常我们在自己的电脑写应用的时候都是通过makefile来生成可执行的文件，但是为什么源码里面没有呢。实际上，编译器在开始工作前要知道当前的系统环境，比如安装的位置要在哪里、要依赖什么组件等等，由于每台电脑的环境不一样，可以通过configure配置文件指定编译参数。运行这个脚本就可以获知编译参数，编译器就可以灵活地实现针对你个人电脑的“私人定制”，这也是linux源码安装的一个优势。用户也可以自定义参数，比如假设我们要自定义安装目录，可以./configure --prefix=/usr/local/apache2。又比如假如要动态库和静态库一起编译，使用./config shared --prefix=/usr/local --openssldir=/usr/local/ssl，假如我们要加入一些模块支持（如mysql），使用
./configure --prefix=/www --with-mysqlconfigure通常是由autoconf这个工具生成的，下载：
sudo apt-get install autoconf
autoconf：只是autotools系列工具中的一个，运行之后可对configure.in脚本配置文件进行处理进而生成configure可执行文件，其他还包括了-----
aclocal：生成一个名称为aclocal.m4的用于处理本地宏定义的文件
autoscan：在给定目录以及其子目录树中检测源文件，若没有给定目录，就是在当前目录及其子目录树中检查。
autoheader：负责生成config.in文件，该工具通常从“acconfig.h”文件中复制用户附加的符号定义。
automake：它要用到的脚本配置文件是makefile.am，用户需要自己创建相应的文件，然后利用automake工具转换成makefile.in，此时运行configure自动配置设置文件就可将该.in文件生成makefile文件
网上摘取的一种图，解释了这套工具的工作流程：
运行autoscan，它会自动搜寻指定目录（默认是当前或者当前目录的子目录）的源文件，并且创建configure.scan文件
autoscan会尝试读入”configure.ac”（同configure.in的配置文件）文件，此时没有创建该配置文件，于是它会自动生成“configure.in”的原型文件“configure.scan”，该文件和源文件是在同一个目录下的，用户可以通过cat命令查看：
AC_PREREQ(2.61)
AC_INIT(hello, 1.0)
AM_INIT_AUTOMAKE(hello, 1.0)
AC_CONFIG_SRCDIR([hello.c])
AC_CONFIG_HEADER([config.h])
# Checks for programs.
AC_PROG_CC
# Checks for libraries.
# Checks for header files.
AC_CHECK_HEADERS([sys/time.h])
# Checks for typedefs, structures, and compiler characteristics.
AC_HEADER_TIME
# Checks for library functions.
AC_CHECK_FUNCS([gettimeofday])
AC_CONFIG_FILES([Makefile])
AC_OUTPUT
解释-----
AC_PREREQ：这个宏用于声明本文件要求的autoconf版本
AC_INIT：总是configure.in中的第一个宏，可以拓展为许多可由其他configure脚本共享的模板文件代码，这些代码解析传到configure的命令行参数。这个宏的一个参数是一个文件名，这个文件应该在源代码目录中，用于健全性检查，以保证configure脚本已正确定位源文件目录
AM_INIT_AUTOMAKE：automake必备的宏，使automake自动生成Makefile
AC_CONFIG_SRCDIR：检查所指定的源文件是否存在，以及源代码目录的有效性。
AC_CHECK_HEADERS：用于生产config.h文件供autoheader使用
AC_CONFIG_FILES：用于生成相应的Makefile
AC_PROG_CC：使配置脚本搜索C编译器并使用其名称定义变量CC。 Automake生成的src / Makefile.in文件使用变量CC构建hello，因此当配置从src / Makefile.in创建src / Makefile时，它将使用它找到的值定义CC。如果要求Automake创建一个使用CC的Makefile.in，但是configure.ac没有定义它，它会建议你添加一个调用AC_PROG_CC
AC_OUTPUT：是一个关闭命令，实际上产生脚本的一部分，负责创建用AC_CONFIG_HEADERS和AC_CONFIG_FILES注册的文件
AC_CHECK_FUNCS：检查C标准库中是否存在函数。 如果找到，则定义预处理器宏HAVE_ [function]。它生成一个测试程序，声明一个具有相同名称的函数，然后编译并链接它。更改函数名称中的几个字符（使测试失败）并检查config.log，当测试程序失败时，您将看到测试程序的源代码。假如缺失这个宏，会遇到下面的警告：
configure.ac: warning: missing AC_CHECK_FUNCS(gettimeofday)
这是autoscan告诉你，因为gettimeofday是一个潜在的可移植性问题，你应该有一个配置检查它。所以你需要做的是添加 AC_CHECK_FUNCS（gettimeofday） 配置.ac，重新运行autoreconf，然后装饰你的C代码 #ifdef HAVE_GETTIMEOFDAY ，这是一般的过程
AC_HEADER_TIME：这个不是必要宏，当源代码中有依赖于time.h和sys/time.h时，则定义TIME_WITH_SYS_TIME,这个宏在使用例如struct timeval和struct tm的程序中很有用，它最好结合HAVE_SYS_TIME_H一起使用，可以使用AC_CHECK_HEADERS检查它
你的c程序就可以添加下面的一段：
#if TIME_WITH_SYS_TIME
# include <sys/time.h>
# include <time.h>
#else
# if HAVE_SYS_TIME_H
# include <sys/time.h>
# else
# include <time.h>
# endif
#endif
环境：ubuntu14.04
编辑一个文件，命名为hello.c
#include<stdio.h>
#include<sys/time.h>
int main(int argc,char *argv)
{
float sec;
struct timeval time;
gettimeofday(&time,NULL);
sec=time.tv_sec;
sec+=time.tv_usec/1000000.0;
printf("hello-world sec=%e ",sec);
return 0;
}
执行autoscan（如果是sudo权限执行新生成的两个文件所有者和所属组都是root，不能编辑），生成两个文件：
其中autoscan.log显示一个宏被请求的信息日志
configure.scan原文件内容：
# -*- Autoconf -*-
# Process this file with autoconf to produce a configure script.
AC_PREREQ([2.69])
AC_INIT([FULL-PACKAGE-NAME], [VERSION], [BUG-REPORT-ADDRESS])
AC_CONFIG_SRCDIR([hello.c])
AC_CONFIG_HEADERS([config.h])
# Checks for programs.
AC_PROG_CC
# Checks for libraries.
# Checks for header files.
AC_CHECK_HEADERS([sys/time.h])
# Checks for typedefs, structures, and compiler characteristics.
# Checks for library functions.
AC_CHECK_FUNCS([gettimeofday])
AC_OUTPUT
修改一下
红色部分改为AC_INIT(hello, 1.0)
并且在AC_CONFIG_SRCDIR([hello.c])之后加上
AM_INIT_AUTOMAKE(hello, 1.0)
AC_OUTPUT之前加上
AC_CONFIG_FILES([Makefile])
修改完后执行mv configure.scan configure.ac
旧版本的autoconf编译是用configure.in，但是现在推荐使用configure.ac。另外注意configure.ac中的宏最好是单独成行的，AC_INIT必须在check之前调用，而AC_OUTPUT必须在结尾调用，某些宏在运行的时候会检查一些另外宏是否已经先运行。
宏的顺序一般是这样的：
AC_INIT
测试程序
测试函数库
测试头文件
测试类型定义
测试结构
测试编译器特性
测试库函数
测试系统调用
AC_OUTPUT
该文件包含autoconf宏的调用，其实configure.ac里面的内容也可以包含shell指令
执行aclocal，此时会生成一个叫aclocal.m4的新文件（告诉autoconf如何找到新的宏）
执行autoconf或autoconf --install
假如遇到错误：
试试：
解决：
sudo apt-get install libtool
然后再autoconf
执行autoheader，会生成一个config.h.in文件
创建一个脚本配置文件Makefile.am
AUTOMAKE_OPTIONS=foreign
bin_PROGRAMS=hello
hello_SOURCES=hello.c
说明：AUTOMAKE_OPTIONS为设置automake的选项。GNU对自己发布的软件有严格的规范，例如必须附带许可证声明文件COPYING等，否则automake执行时会报错。automake提供了3种软件等级：foreign、gnu和gnits，默认为gnu。这里使用foreign，只检测必须的文件
bin_PROGRAMS定义要生成的可执行文件名。如果要产生多个可执行文件，每个可执行文件的文件名要用空格隔开 .对于可执行文件和静态库类型，如果只想编译，不想安装到系统中，可以用noinst_PROGRAMS代替bin_PROGRAMS，noinst_LIBRARIES代替lib_LIBRARIES。
hello_SOURCES用于定义“hello”这个可执行程序所需要的依赖文件，如果有多个，要全部列出来，用空格隔开。如果要生成多个执行程序，那么要定义多个filename_SOURCES
然后执行automake -a，自动添加一些脚本并生成configure.in文件
如果遇到警告：
configure.ac:7: warning: AM_INIT_AUTOMAKE: two- and three-arguments forms are deprecated. For more info, see:
configure.ac:7: http://www.gnu.org/software/automake/manual/automake.html#Modernize-AM_005fINIT_005fAUTOMAKE-invocation
configure.ac:12: installing './compile'
configure.ac:7: installing './install-sh'
configure.ac:7: installing './missing'
Makefile.am: installing './depcomp'
现在AM_INIT_AUTOMAKE只需要引入一个参数
一个空格分隔的automake选项列表应该应用到项目树中的每个Makefile.am，效果如同每个选项在AUTOMAKE_OPTIONS中列出。
之前使用的AM_INIT_AUTOMAKE是一种比较老旧的配置：
AM_INIT_AUTOMAKE（PACKAGE，VERSION，[NO-DEFINE]）
在这种形式中，有两个必需要的参数：PACKAGE,VERSION
包和版本已经可以从autoconf的AC_INIT宏获得。但是和AC_INIT调用发生的情况不同，此时AM_INIT_AUTOMAKE调用支持包和版本参数中的shell变量扩展（否则分别为通过AC_INIT调用定义的PACKAGE_TARNAME和PACKAGE_VERSION），也就是AM_INIT_AUTOMAKE支持Makefile中引入shell指令
解决：编辑configure.ac
方法1：将AM_INIT_AUTOMAKE的参数取消
方法2：默认情况下，这个宏AC_DEFINE的PACKAGE和VERSION。这可以通过传递no-define选项来避免
AM_INIT_AUTOMAKE([no-define ...])
不过这样也不是最稳妥的，链接的文章后面提到
如果您从早期版本的Automake升级configure.ac，将包和版本参数从AM_INIT_AUTOMAKE直接移动到AC_INIT并不总是正确的，如上例所示。 AC_INIT的第一个参数应该是程序包的名称（例如“GNU Automake”），而不是您传递给AM_INIT_AUTOMAKE的tarball名称（例如“automake”）。 Autoconf尝试从软件包名称派生tarball名称，该名称应该适用于大多数但不是所有软件包名称。 （如果它不适用于你，你可以使用AC_INIT的四参数形式明确地提供tarball名称）。
然后执行./configure
它将makefile.in文件生成Makefile文件
最后执行make，生成了可执行文件hello
资料：
GNU Autoconf, Automake and Libtool（http://www.shlomifish.org/lecture/Autotools/slides/）
automake（http://www.gnu.org/software/automake/manual/automake.html#index-AC_005fINIT）
autoconf（https://www.gnu.org/software/autoconf/manual/autoconf.html#Shell-Script-Compiler）
GNU Document(http://www.delorie.com/gnu/docs/)
使用autotools生成makefile文件入门（http://www.cnblogs.com/flatfoosie/archive/2010/12/21/1912946.html）
Makefile学习与进阶之Makefile.am和$$(M)的意思（http://www.cnblogs.com/zmlctt/p/4161547.html）
GNU AutoMake的中文翻译（http://blog.csdn.net/brace/article/details/726168）
Autoconf学习---编写configure脚本（http://www.cnblogs.com/flyfish10000/articles/1986054.html）
例解autoconf和automake生成makefile文件（https://www.ibm.com/developerworks/cn/linux/l-makefile/）
configure.ac(configure.in)详解（http://www.ivpeng.com/pblog/configure-ac.html）
Makefile.am规则和实例详解（http://www.ivpeng.com/pblog/makefile-am.html）