最近在准备抽取数据的工作。有一个id集合200多M,要从另一个500GB的数据集合中抽取出所有id集合中包含的数据集。id数据集合中每一个行就是一个id的字符串(Reduce side join要在每行的行尾加“,”号,而Map side join不必,如果加了也可以处理掉),类似,500GB的数据集合中每一行是某一id对应的全记录,用“,”号分隔。
为什么不在hive或者pig下面搞这个操作呢?主要是因为Hive配置了Kerberos认证之后,还有一个问题没有解决,包含metastore的主机无法从namenode主机获取票据,所以就暂时放一放吧。用MapReduce来搞吧。在Hive下比较方便,但在MapReduce中实现就比较麻烦。
1、概述
在传统数据库(如:MySql)中,JOIN操作常常是非常耗时的。而在HADOOP中进行JOIN操作,同样常见且耗时,由于Hadoop的独特设计思想,当进行JOIN操作时,有一些特殊的技巧。下面分别介绍MapReduce中的几种常见join,比如有最常见的 map side join,reduce side join,semi join(这些在Hive中都有) 等。Map side join在处理多个小表关联大表时非常有用,而 reduce join 在处理多表关联时是比较麻烦的,会造成大量的网络IO,效率低下,但在有些时候也是非常有用的。
2. 常见的join方法介绍
2.1 map side join
Map side join是针对以下场景进行的优化:两个待连接表中,有一个表非常大,而另一个表非常小,以至于小表可以直接存放到内存中。这样,我们可以将小表复制多份,让每个map须 task内存中存在一份(比如存放到hash table中),然后只扫描大表:对于大表中的每一条记录key/value,在hash table中查找是否有相同的key的记录,如果有,则连接后输出即可。
为了支持文件的复制,Hadoop提供了一个类DistributedCache,使用该类的方法如下:
(1)用户使用静态方法DistributedCache.addCacheFile()指定要复制的文件,它的参数是文件的URI(如果是HDFS上的文件,可以这样:hdfs://namenode:9000/home/XXX/file,其中9000是自己配置的NameNode端口号)。JobTracker在作业启动之前会获取这个URI列表,并将相应的文件拷贝到各个TaskTracker的本地磁盘上。(2)用户使用DistributedCache.getLocalCacheFiles()方法获取文件目录,并使用标准的文件读写API读取相应的文件。
package com.unionpayadvisors; import java.io.BufferedReader; import java.io.FileReader; import java.io.IOException; import java.util.HashSet; import java.util.Set; import org.apache.hadoop.conf.Configuration; import org.apache.hadoop.conf.Configured; import org.apache.hadoop.filecache.DistributedCache; import org.apache.hadoop.fs.Path; import org.apache.hadoop.io.LongWritable; import org.apache.hadoop.io.NullWritable; import org.apache.hadoop.io.Text; import org.apache.hadoop.mapreduce.Job; import org.apache.hadoop.mapreduce.Mapper; import org.apache.hadoop.mapreduce.lib.input.FileInputFormat; import org.apache.hadoop.mapreduce.lib.input.TextInputFormat; import org.apache.hadoop.mapreduce.lib.output.FileOutputFormat; import org.apache.hadoop.mapreduce.lib.output.TextOutputFormat; import org.apache.hadoop.util.GenericOptionsParser; import org.apache.hadoop.util.Tool; import org.apache.hadoop.util.ToolRunner; import org.hsqldb.lib.StringUtil; import redis.clients.jedis.Jedis; import redis.clients.jedis.JedisPool; public class AccountTableJoin extends Configured implements Tool { private static WriteLog log = WriteLog.getInstance(); private static String parseRaw(String str) { if (StringUtil.isEmpty(str)) { return str; } str = str.trim(); if (str.startsWith(""")) { str = str.substring(1); } if (str.endsWith(""")) { str = str.substring(0, str.length() - 1); } return str.trim(); } public static class MapClass extends Mapper<LongWritable, Text, Text, NullWritable> { // 用于缓存 user_account 中的数据 private Set<String> accountSet = new HashSet<String>(); private Text accKey = new Text(); private NullWritable nullValue = NullWritable.get(); private String[] kv; private Jedis jedis = new JedisPool("192.168.2.101", 6379).getResource(); // 此方法会在map方法执行之前执行 // @Override protected void setup(Context context) throws IOException,InterruptedException { BufferedReader in = null; try { // 从当前作业中获取要缓存的文件 Path[] paths = DistributedCache.getLocalCacheFiles(context .getConfiguration()); String accountLine = null; for (Path path : paths) { if (path.toString().contains("account")) { in = new BufferedReader(new FileReader(path.toString())); while (null != (accountLine = in.readLine())) { log.logger("AccountTableJoin", "accountSet="+parseRaw(accountLine.split(",", -1)[0])); accountSet.add(parseRaw(accountLine.split(",", -1)[0])); } } } } catch (IOException e) { e.printStackTrace(); } finally { try { if (in != null) { in.close(); } } catch (IOException e) { e.printStackTrace(); } } } public void map(LongWritable key, Text value, Context context) throws IOException, InterruptedException { kv = value.toString().split(","); //map join: 在map阶段过滤掉不需要的数据 if(kv.length==4&&accountSet.contains(parseRaw(kv[0]))){ accKey.set(value); context.write(accKey, nullValue); } } } public int run(String[] args) throws Exception { log.logger("XXXXXXXXX", "begin in"); Job job = new Job(getConf(), "AccountTableJoin"); job.setJobName("AccountTableJoin"); job.setJarByClass(AccountTableJoin.class); job.setMapperClass(MapClass.class); job.setInputFormatClass(TextInputFormat.class); job.setOutputFormatClass(TextOutputFormat.class); job.setOutputKeyClass(Text.class); job.setOutputValueClass(NullWritable.class); String[] otherArgs = new GenericOptionsParser(job.getConfiguration(), args).getRemainingArgs(); FileInputFormat.addInputPath(job, new Path(otherArgs[0])); FileOutputFormat.setOutputPath(job, new Path(otherArgs[1])); return job.waitForCompletion(true) ? 0 : 1; } public static void main(String[] args) throws Exception { int res = ToolRunner.run(new Configuration(), new AccountTableJoin(), args); System.exit(res); } /* * hadoop jar AccountTableJoin.jar AccountTableJoin * /user/he/sample_account.del /user/he/SAMPLE_SUM_2012070809101112.del * /user/he/ACCOUNT_JOIN_RESULT */ }
WriteLog代码:
package com.unionpayadvisors; import java.io.File; import java.io.FileNotFoundException; import java.io.FileOutputStream; import java.io.PrintWriter; import java.util.Calendar; public class WriteLog { /**写日志<br> * 写logString字符串到./log目录下的文件中 * @param logString 日志字符串 * @author tower */ private static WriteLog instance = null; private WriteLog(){}; public static WriteLog getInstance() { if( instance == null ) { instance = new WriteLog(); } return instance; } public void logger(String fileNameHead,String logString) { try { String logFilePathName=null; Calendar cd = Calendar.getInstance();//日志文件时间 int year=cd.get(Calendar.YEAR); String month=addZero(cd.get(Calendar.MONTH)+1); String day=addZero(cd.get(Calendar.DAY_OF_MONTH)); String hour=addZero(cd.get(Calendar.HOUR_OF_DAY)); String min=addZero(cd.get(Calendar.MINUTE)); String sec=addZero(cd.get(Calendar.SECOND)); File fileParentDir=new File("./log");//判断log目录是否存在 if (!fileParentDir.exists()) { fileParentDir.mkdir(); } if (fileNameHead==null||fileNameHead.equals("")) { logFilePathName="./log/"+year+month+day+hour+".log";//日志文件名 }else { logFilePathName="./log/"+fileNameHead+year+month+day+hour+".log";//日志文件名 } PrintWriter printWriter=new PrintWriter(new FileOutputStream(logFilePathName, true));//紧接文件尾写入日志字符串 String time="["+year+month+day+"-"+hour+":"+min+":"+sec+"] "; printWriter.println(time+logString); printWriter.flush(); } catch (FileNotFoundException e) { // TODO Auto-generated catch block e.getMessage(); } } /**整数i小于10则前面补0 * @param i * @return * @author tower */ public static String addZero(int i) { if (i<10) { String tmpString="0"+i; return tmpString; } else { return String.valueOf(i); } } }
2.2 reduce side join
reduce side join是一种最简单的join方式, 之所以存在reduce side join,是因为在map阶段不能获取所有需要的join字段,即:同一个key对应的字段可能位于不同map中。Reduce side join是非常低效的,因为shuffle阶段要进行大量的数据传输。
假设要进行join的数据分别来自File1和File2.
在map阶段,map函数同时读取两个文件File1和File2,为了区分两种来源的key/value数据对,对每条数据打一个标签(tag),比如:tag=0表示来自文件File1,tag=2表示来自文件File2。即:map阶段的主要任务是对不同文件中的数据打标签。
在reduce阶段,reduce函数获取key相同的来自File1和File2文件的value list, 然后对于同一个key,对File1和File2中的数据进行join(笛卡尔乘积)。即:reduce阶段进行实际的连接操作。
代码如下(需要再次修改):
package com.unionpayadvisors; import java.io.BufferedReader; import java.io.FileReader; import java.io.IOException; import java.util.HashSet; import java.util.Set; import org.apache.hadoop.conf.Configuration; import org.apache.hadoop.conf.Configured; import org.apache.hadoop.filecache.DistributedCache; import org.apache.hadoop.fs.Path; import org.apache.hadoop.io.LongWritable; import org.apache.hadoop.io.NullWritable; import org.apache.hadoop.io.Text; import org.apache.hadoop.mapreduce.Job; import org.apache.hadoop.mapreduce.Mapper; import org.apache.hadoop.mapreduce.lib.input.FileInputFormat; import org.apache.hadoop.mapreduce.lib.input.TextInputFormat; import org.apache.hadoop.mapreduce.lib.output.FileOutputFormat; import org.apache.hadoop.mapreduce.lib.output.TextOutputFormat; import org.apache.hadoop.util.GenericOptionsParser; import org.apache.hadoop.util.Tool; import org.apache.hadoop.util.ToolRunner; import org.hsqldb.lib.StringUtil; import redis.clients.jedis.Jedis; import redis.clients.jedis.JedisPool; public class AccountTableJoin extends Configured implements Tool { private static WriteLog log = WriteLog.getInstance(); private static String parseRaw(String str) { if (StringUtil.isEmpty(str)) { return str; } str = str.trim(); if (str.startsWith(""")) { str = str.substring(1); } if (str.endsWith(""")) { str = str.substring(0, str.length() - 1); } return str.trim(); } public static class MapClass extends Mapper<LongWritable, Text, Text, NullWritable> { // 用于缓存 user_account 中的数据 private Set<String> accountSet = new HashSet<String>(); private Text accKey = new Text(); private NullWritable nullValue = NullWritable.get(); private String[] kv; private Jedis jedis = new JedisPool("192.168.2.101", 6379).getResource(); // 此方法会在map方法执行之前执行 // @Override protected void setup(Context context) throws IOException,InterruptedException { BufferedReader in = null; try { // 从当前作业中获取要缓存的文件 Path[] paths = DistributedCache.getLocalCacheFiles(context .getConfiguration()); String accountLine = null; for (Path path : paths) { if (path.toString().contains("account")) { in = new BufferedReader(new FileReader(path.toString())); while (null != (accountLine = in.readLine())) { log.logger("AccountTableJoin", "accountSet="+parseRaw(accountLine.split(",", -1)[0])); accountSet.add(parseRaw(accountLine.split(",", -1)[0])); } } } } catch (IOException e) { e.printStackTrace(); } finally { try { if (in != null) { in.close(); } } catch (IOException e) { e.printStackTrace(); } } } public void map(LongWritable key, Text value, Context context) throws IOException, InterruptedException { kv = value.toString().split(","); //map join: 在map阶段过滤掉不需要的数据 if(kv.length==4&&accountSet.contains(parseRaw(kv[0]))){ accKey.set(value); context.write(accKey, nullValue); } // log.logger("XXXXXXXXX", "length!" + kv.length); // if (kv.length == 53) { // context.write(new Text(String.valueOf(parseRaw(kv[53 - 1])+":"+jedis.exists(parseRaw(kv[53 - 1])))), nullValue); // // log.logger("XXXXXXXXX", "Jedis!" + parseRaw(kv[53 - 1])); // if (jedis.exists(parseRaw(kv[53 - 1]))) { // // log.logger("XXXXXXXXX", "jedis.exists" // + jedis.exists(parseRaw(kv[53 - 1]))); // accKey.set(value); // context.write(accKey, nullValue); // } } } public int run(String[] args) throws Exception { log.logger("XXXXXXXXX", "begin in"); Job job = new Job(getConf(), "AccountTableJoin"); job.setJobName("AccountTableJoin"); job.setJarByClass(AccountTableJoin.class); job.setMapperClass(MapClass.class); job.setInputFormatClass(TextInputFormat.class); job.setOutputFormatClass(TextOutputFormat.class); job.setOutputKeyClass(Text.class); job.setOutputValueClass(NullWritable.class); String[] otherArgs = new GenericOptionsParser(job.getConfiguration(), args).getRemainingArgs(); FileInputFormat.addInputPath(job, new Path(otherArgs[0])); FileOutputFormat.setOutputPath(job, new Path(otherArgs[1])); return job.waitForCompletion(true) ? 0 : 1; } public static void main(String[] args) throws Exception { log.logger("XXXXXXXXX", "begin connection Jedis!"); // jedis=jedisPool.getResource(); // log.logger("XXXXXXXXX", "find "7a5abdf04ce2350424907bf234d8ac80"" // + jedis.get("7a5abdf04ce2350424907bf234d8ac80")); // log.logger("XXXXXXXXX", "exsit "7a5abdf04ce2350424907bf234d8ac80"" // + jedis.exists("7a5abdf04ce2350424907bf234d8ac80")); int res = ToolRunner.run(new Configuration(), new AccountTableJoin(), args); // jedisPool.returnResource(jedis); // jedisPool.destroy(); log.logger("XXXXXXXXX", "connection Jedis end!"); System.exit(res); } /* * hadoop jar AccountTableJoin.jar AccountTableJoin * /user/he/sample_account.del /user/he/SAMPLE_SUM_2012070809101112.del * /user/he/ACCOUNT_JOIN_RESULT */ }
2.3 SemiJoin
SemiJoin,也叫半连接,是从分布式数据库中借鉴过来的方法。它的产生动机是:对于reduce side join,跨机器的数据传输量非常大,这成了join操作的一个瓶颈,如果能够在map端过滤掉不会参加join操作的数据,则可以大大节省网络IO。
实现方法很简单:选取一个小表,假设是File1,将其参与join的key抽取出来,保存到文件File3中,File3文件一般很小,可以放到内存中。在map阶段,使用DistributedCache将File3复制到各个TaskTracker上,然后将File2中不在File3中的key对应的记录过滤掉,剩下的reduce阶段的工作与reducee side join相同。
2.4 reduce side join + BloomFilter
在某些情况下,SemiJoin抽取出来的小表的key集合在内存中仍然存放不下,这时候可以使用BloomFiler以节省空间。
BloomFilter最常见的作用是:判断某个元素是否在一个集合里面。它最重要的两个方法是:add() 和contains()。最大的特点是不会存在false negative,即:如果contains()返回false,则该元素一定不在集合中,但会存在一定的true negative,即:如果contains()返回true,则该元素可能在集合中。
因而可将小表中的key保存到BloomFilter中,在map阶段过滤大表,可能有一些不在小表中的记录没有过滤掉(但是在小表中的记录一定不会过滤掉),这没关系,只不过增加了少量的网络IO而已。
Hadoop面试的时候也会问到 Hadoop上Join的实现,几乎是一道必问的问题,而极个别公司还会涉及到DistributedCache原理以及怎样利用DistributedCache进行Join操作。